2018-2019年寧夏甲型H1N1流感病毒血凝素基因組序列分析
發(fā)布時(shí)間：2021-03-04 15:59
目的了解寧夏2018-2019流感監(jiān)測(cè)年度流感病毒病原學(xué)檢測(cè)情況,分析甲型H1N1流感病毒血凝素（HA）基因特征。方法采用real time RT-PCR方法對(duì)流感監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院采集的流感樣病例（ILI）標(biāo)本進(jìn)行核酸檢測(cè);對(duì)陽性標(biāo)本進(jìn)行毒株分離;提取甲型H1N1毒株的RNA,采用RT-PCR方法擴(kuò)增HA片段并測(cè)序,利用生物信息軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)分析。結(jié)果寧夏流感網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)咽拭子標(biāo)本共5 214份,核酸檢測(cè)陽性數(shù)為760份,其中甲型H1N1陽性數(shù)為485份,占總陽性數(shù)的63.82%,分離出甲型H1N1毒株161株。寧夏分離毒株與疫苗株A/Califaoria/07/2009不在同一進(jìn)化分支,同源性為92.6%～96.3%;與疫苗株A/Michigan/45/2015（H1N1）為同一進(jìn)化分支,同源性為96.6%～98.1%。與疫苗株A/Califaoria/07/2009比較,抗原位點(diǎn)、受體結(jié)合位點(diǎn)及其他位點(diǎn)均有變異,除毒株A/NingxiaXixia/SWL1176/2019（H1N1）第222位氨基酸發(fā)生D222G變異外,其他甲型H1N1流感毒株均未發(fā)生D...
【文章來源】：現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(09)北大核心
【文章頁數(shù)】：5 頁
【部分圖文】：
寧夏2018-2019年甲型H1N1流感病毒病原學(xué)檢測(cè)結(jié)果
對(duì)161株甲型H1N1毒株側(cè)序結(jié)果與參考毒株及2017年寧夏分離株進(jìn)行比對(duì)分析。根據(jù)分析結(jié)果,結(jié)合采集地區(qū)、采集時(shí)間及標(biāo)本信息選取50株血凝素序列結(jié)果應(yīng)用Mega6.0軟件繪制基因種系發(fā)生樹分析親緣關(guān)系,進(jìn)化樹見圖2(圖中的進(jìn)化樹只包含部分毒株,剔除了部分位于進(jìn)化樹上相同終末分支的序列)。結(jié)果顯示,整個(gè)進(jìn)化樹分為兩個(gè)進(jìn)化分支,疫苗株A/Califaoria/07/2009與國內(nèi)代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)為同一進(jìn)化分支,寧夏分離毒株與疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)及2017年分離毒株高度同源為同一進(jìn)化分支。寧夏分離毒株與參考毒株比較,發(fā)生了一定程度的變異,與國際疫苗株A/Califaoria/07/2009氨基酸的同源性為92.6%～96.3%、與國內(nèi)代表A/Sichuan/1/2009(H1N1)氨基酸的同源性為91.3%～95.8%、與國際疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)氨基酸的同源性相對(duì)較高為96.6%～98.1%。2.3 HA分子特征分析
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]河北省2011-2017年甲型H1N1流感流行及其基因特征分析[J]. 韓光躍,李巖,劉艷芳,劉蘭芬,姜彩肖,齊順祥. 中國病毒病雜志. 2017(04)
[2]湖北省大流行期和流行后期新甲型H1N1流感病毒基因特性分析[J]. 方斌,劉琳琳,李翔,葉國軍,余曉,宋毅. 中華疾病控制雜志. 2017(01)
[3]2009-2015年中國甲型H1N1流感病毒血凝素基因進(jìn)化分析[J]. 顏文娟,郭艷,李小杉,李偉,宣楊,宋玥,方坤,衛(wèi)平民. 微生物學(xué)通報(bào). 2017(02)
[4]2013-2014年寧夏甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因變異狀況及序列分析[J]. 孫曉強(qiáng),溫秋芳,陳曉梅,袁芳,馬學(xué)旻,馬江濤,詹軍. 寧夏醫(yī)學(xué)雜志. 2016(01)
[5]2012年甲型H1N1流感病毒HA基因特征及抗原性分析[J]. 張曉春,黃韋唯,陳振華,陳恒. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2014(05)
[6]福建省甲型H1N1流感病毒分離及首例分離株全基因組序列分析[J]. 謝劍鋒,沈曉娜,王美愛,張擁軍,吳冰珊,陳煒,王金章,修文瓊,朱莉莉,楊式芹,陳端,翁育偉,鄭奎城,嚴(yán)延生. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(08)
[7]中國內(nèi)地首例確診甲型H1N1流感病例的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)[J]. 王偉,潘明,常國輝,李曉丹,李天舒,秦成峰,賈娜,溫樂英,高榮保,童文彬,何樹森,王大燕,郭俊峰,藍(lán)雨,楊磊,趙翔,李希研,李梓,鄒淑梅,祝慶余,郭元吉,曹務(wù)春,李德新,舒躍龍. 病毒學(xué)報(bào). 2009(S1)
[8]廣東新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子進(jìn)化與變異[J]. 梁麗君,鐘靜,黃平,蘇文哲,何劍峰,張欣,武婕,楊芬,鄒麗容. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2013 (03)
本文編號(hào)：3063497
【文章來源】：現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(09)北大核心
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【部分圖文】：
寧夏2018-2019年甲型H1N1流感病毒病原學(xué)檢測(cè)結(jié)果
對(duì)161株甲型H1N1毒株側(cè)序結(jié)果與參考毒株及2017年寧夏分離株進(jìn)行比對(duì)分析。根據(jù)分析結(jié)果,結(jié)合采集地區(qū)、采集時(shí)間及標(biāo)本信息選取50株血凝素序列結(jié)果應(yīng)用Mega6.0軟件繪制基因種系發(fā)生樹分析親緣關(guān)系,進(jìn)化樹見圖2(圖中的進(jìn)化樹只包含部分毒株,剔除了部分位于進(jìn)化樹上相同終末分支的序列)。結(jié)果顯示,整個(gè)進(jìn)化樹分為兩個(gè)進(jìn)化分支,疫苗株A/Califaoria/07/2009與國內(nèi)代表株A/Sichuan/1/2009(H1N1)為同一進(jìn)化分支,寧夏分離毒株與疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)及2017年分離毒株高度同源為同一進(jìn)化分支。寧夏分離毒株與參考毒株比較,發(fā)生了一定程度的變異,與國際疫苗株A/Califaoria/07/2009氨基酸的同源性為92.6%～96.3%、與國內(nèi)代表A/Sichuan/1/2009(H1N1)氨基酸的同源性為91.3%～95.8%、與國際疫苗株A/Michigan/45/2015(H1N1)氨基酸的同源性相對(duì)較高為96.6%～98.1%。2.3 HA分子特征分析
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]河北省2011-2017年甲型H1N1流感流行及其基因特征分析[J]. 韓光躍,李巖,劉艷芳,劉蘭芬,姜彩肖,齊順祥. 中國病毒病雜志. 2017(04)
[2]湖北省大流行期和流行后期新甲型H1N1流感病毒基因特性分析[J]. 方斌,劉琳琳,李翔,葉國軍,余曉,宋毅. 中華疾病控制雜志. 2017(01)
[3]2009-2015年中國甲型H1N1流感病毒血凝素基因進(jìn)化分析[J]. 顏文娟,郭艷,李小杉,李偉,宣楊,宋玥,方坤,衛(wèi)平民. 微生物學(xué)通報(bào). 2017(02)
[4]2013-2014年寧夏甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因變異狀況及序列分析[J]. 孫曉強(qiáng),溫秋芳,陳曉梅,袁芳,馬學(xué)旻,馬江濤,詹軍. 寧夏醫(yī)學(xué)雜志. 2016(01)
[5]2012年甲型H1N1流感病毒HA基因特征及抗原性分析[J]. 張曉春,黃韋唯,陳振華,陳恒. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2014(05)
[6]福建省甲型H1N1流感病毒分離及首例分離株全基因組序列分析[J]. 謝劍鋒,沈曉娜,王美愛,張擁軍,吳冰珊,陳煒,王金章,修文瓊,朱莉莉,楊式芹,陳端,翁育偉,鄭奎城,嚴(yán)延生. 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(08)
[7]中國內(nèi)地首例確診甲型H1N1流感病例的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)[J]. 王偉,潘明,常國輝,李曉丹,李天舒,秦成峰,賈娜,溫樂英,高榮保,童文彬,何樹森,王大燕,郭俊峰,藍(lán)雨,楊磊,趙翔,李希研,李梓,鄒淑梅,祝慶余,郭元吉,曹務(wù)春,李德新,舒躍龍. 病毒學(xué)報(bào). 2009(S1)
[8]廣東新型甲型H1N1病毒血凝素基因分子進(jìn)化與變異[J]. 梁麗君,鐘靜,黃平,蘇文哲,何劍峰,張欣,武婕,楊芬,鄒麗容. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志. 2013 (03)
本文編號(hào)：3063497
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