諾如病毒新重組株GII.P16/GII.2引起福建省2016年冬季病毒性胃腸炎暴發(fā)
發(fā)布時間:2020-12-11 02:26
目的本文旨在鑒定福建省2016年冬季導(dǎo)致病毒性胃腸炎暴發(fā)的病原體,并對病原體進(jìn)行分子特征研究。方法對疫情暴發(fā)地上送的福建省2016年胃腸炎暴發(fā)急性病例標(biāo)本,采用熒光PCR初步判定病原體,常規(guī)RT-PCR檢測諾如病毒RNA聚合酶和衣殼蛋白基因片段,并進(jìn)行序列測定和分子特征分析。結(jié)果在3起暴發(fā)疫情中18份標(biāo)本經(jīng)熒光PCR檢測均為諾如病毒核酸陽性,其中15份標(biāo)本RT-PCR檢測判為GII型諾如病毒,9份標(biāo)本成功測序。分析測序結(jié)果,證實引起本輪疫情為諾如病毒新重組株,該重組株有別于本地散發(fā)流行及全球暴發(fā)流行的優(yōu)勢基因型GII.4。毒株RNA聚合酶核苷酸序列與2016年日本的GII.4悉尼變異株Kawasaki194毒株的同源性最高,達(dá)98%,為GII.P16亞型;衣殼蛋白核苷酸序列與2008年比利時的IPH2161-08VG06毒株同源性最高(97.7%98.8%),為GII.2亞型。結(jié)論這是福建省首次報道諾如病毒重組株GII.P16/GII.2的檢出,并引起病毒性胃腸炎暴發(fā)。
【文章來源】:中國人獸共患病學(xué)報. 2017年09期 第805-808+813頁 北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
圖1諾如病毒衣殼蛋白核苷酸片段進(jìn)化分析(250bp)Fig.1PhylogeneticanalysesbasedonpartialVP1genesofnorovirus(250bp)●Outbreakstrainsofnorovirusin2016;▼Sporadicstrainsofnorovirusin2016
ylogeneticanalysesbasedonpartialVP1genesofnorovirus(250bp)●Outbreakstrainsofnorovirusin2016;▼Sporadicstrainsofnorovirusin2016圖2諾如病毒RNA聚合酶核苷酸片段進(jìn)化分析(780bp)Fig.2PhylogeneticanalysesbasedonpartialRNApoly-merasegenesofnorovirus(780bp)圖3Simplot分析2016年諾如病毒GII.P16/GII.2重組株Fig.3SimplotanalysesoftheNoVrecombinantGII.P16/GII.2detectedin20169807期吳冰珊等:諾如病毒新重組株GII.P16/GII.2引起福建。玻埃保赌甓静《拘晕改c炎暴發(fā)
本文編號:2909734
【文章來源】:中國人獸共患病學(xué)報. 2017年09期 第805-808+813頁 北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
圖1諾如病毒衣殼蛋白核苷酸片段進(jìn)化分析(250bp)Fig.1PhylogeneticanalysesbasedonpartialVP1genesofnorovirus(250bp)●Outbreakstrainsofnorovirusin2016;▼Sporadicstrainsofnorovirusin2016
ylogeneticanalysesbasedonpartialVP1genesofnorovirus(250bp)●Outbreakstrainsofnorovirusin2016;▼Sporadicstrainsofnorovirusin2016圖2諾如病毒RNA聚合酶核苷酸片段進(jìn)化分析(780bp)Fig.2PhylogeneticanalysesbasedonpartialRNApoly-merasegenesofnorovirus(780bp)圖3Simplot分析2016年諾如病毒GII.P16/GII.2重組株Fig.3SimplotanalysesoftheNoVrecombinantGII.P16/GII.2detectedin20169807期吳冰珊等:諾如病毒新重組株GII.P16/GII.2引起福建。玻埃保赌甓静《拘晕改c炎暴發(fā)
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