人ABHD16A與IFITMs相互作用的初步探究
發(fā)布時間:2020-09-15 16:45
人類α/β-水解酶結(jié)構(gòu)域16A(Abhydrolase domain containing 16 A,ABHD16A)又被稱為人類白細胞抗原-B(Human leukocyte antigen-B,HLA-B)相關(guān)轉(zhuǎn)錄物5(HLA-B associated transcript 5,BAT5),是ABHD(Abhydrolase domain containing)蛋白家族成員之一,在哺乳動物中高度保守。因ABHD16A基因定位在主要組織相容性復(fù)合物(Major histocompatibility complex,MHC)Ⅲ基因簇中,推測其可能參與機體的免疫調(diào)節(jié),但迄今為止,對其功能的研究報道較少。前人在研究MHCIII相互作用蛋白時發(fā)現(xiàn)ABHD16A和干擾素誘導(dǎo)的跨膜轉(zhuǎn)運蛋白1(Interferon inducible transmembrane protein1,IFITM1)具有相互作用。IFITM1屬于IFITMs家族蛋白,該家族蛋白不僅具有抗病毒活性,還在細胞增殖遷移、細胞粘附、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等方面發(fā)揮著重要的作用。實驗室前期研究顯示,IFITM~(-/-)的小鼠出現(xiàn)炎癥反應(yīng),且在小鼠肝臟中,ABHD16A的蛋白含量大量增加,推測ABHD16A與IFITMs的相互作用在炎癥反應(yīng)、抗病毒作用等功能方面具有一定的聯(lián)系,并據(jù)此開展研究。主要以人源ABHD16A和IFITM1、IFITM2、IFITM3為研究對象,采用酵母雙雜交系統(tǒng)、亞細胞共定位研究ABHD16A和IFITM的相互作用,采用基因瞬時過表達、脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)刺激等方法探索其在炎癥反應(yīng)中的作用,并結(jié)合了臨床乙肝病人血液樣本的ABHD16A與IFITMs表達檢測。結(jié)果顯示:酵母雙雜交實驗證明了ABHD16A與IFITM1存在相互作用;激光共聚焦顯微觀察結(jié)果顯示ABHD16A分別與IFITM1、IFITM2、IFITM3共定位于細胞膜性區(qū)域;過表達ABHD16A、IFITM1、IFITM2、IFITM3后,促炎癥因子IL-6表達量下降,抗炎因子IL-10表達量上升(P0.05),促炎癥因子INOS和TNFα的含量也有所上升;細胞受LPS刺激后,ABHD16A、IFITM1、IFITM2、IFITM3、TNFα的mRNA上調(diào)(P0.05);說明ABHD16A、IFITM1、IFITM2、IFITM3在炎癥反應(yīng)中發(fā)揮重要作用;臨床乙肝患者血液樣本檢測結(jié)果顯示,ABHD16A表達下調(diào),“大三陽”患者的IFITM1、IFITM2、IFITM3表達量均下調(diào),“小三陽”患者的IFITM1、IFITM2、IFITM3表達量上調(diào),表明乙肝病毒感染引起的ABHD16A、IFITM1、IFITM2、IFITM3表達變化,值得進一步研究。本研究證明了ABHD16A和IFITMs的相互作用,并對其在炎癥反應(yīng)和乙型肝炎患者的表達情況進行了初步研究,為進一步研究ABHD16A和IFITMs在炎癥反應(yīng)、抗肝炎病毒的方面功能的研究上提供了理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R512.62
【部分圖文】:
且在哺乳動物中氨基酸序列高度保守。人的 ABHD16A 又稱為人類白細胞抗uman leukocyte antigen-B, HLA-B)相關(guān)轉(zhuǎn)錄物 5(HLA-B associated transcript 5, BAT5)含有 α/ β-水解酶結(jié)構(gòu)域(Abhydrolase domain containing, ABHD)家族,是典型的代謝絲。對其蛋白結(jié)構(gòu)和功能的預(yù)測結(jié)果顯示該家族蛋白在脂質(zhì)代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和代謝類疾病調(diào)多種的功能[3]。 ABHD16A 的基因定位人 ABHD16A 位于染色體 6p21.33 的位置,有 21 個外顯子,4 個轉(zhuǎn)錄本,其中只有兩個碼蛋白(NCBI 參考序列號:NM_001177515.1 和 NM_021160.2)。Spies 等[4-6]研究顯D16A 位于人類主要組織相容性復(fù)合物(Human major histocompatibility complex, MHC)簇中,且位于補體基因簇 C2 和 HLA-B 靠近編碼腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,Tβ)基因的長度為 555kb 的基因區(qū)域中(圖 1A)。另外,家鼠的 ABHD16A 位于第 17 號主要組織相容性復(fù)合物Ⅲ的基因簇中,且位于熱休克蛋白(Heat shock protein)Hsp70 和 ,靠近蛋白激酶 Ck2b 基因的區(qū)域中[131-133](圖 1B)。ABHD16A 的基因在人和鼠基因組特點提示該蛋白可能與機體免疫有關(guān)。A
但在后期進化中發(fā)生了變化,它們保留了催化殘基,而結(jié)合位bioH 結(jié)構(gòu)域位于氨基酸 276-428 位置處,這種輔酶 A 結(jié)合酶是產(chǎn)生雙丙酰輔構(gòu)域在生物素生物合成過程中有一定的作用,但具體功能目前尚不清楚[8-9]酸 302-398 位置處,該結(jié)構(gòu)域有溶血磷脂酶活性,屬于 α/β 水解酶超家族[3,1圖 2:預(yù)測 ABHD16A 蛋白三維模式圖Fig.2 Prediction of ABHD16A Protein Three-Dimensional Patterns
預(yù)測ABHD16A蛋白三維模式圖
本文編號:2819213
【學(xué)位單位】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R512.62
【部分圖文】:
且在哺乳動物中氨基酸序列高度保守。人的 ABHD16A 又稱為人類白細胞抗uman leukocyte antigen-B, HLA-B)相關(guān)轉(zhuǎn)錄物 5(HLA-B associated transcript 5, BAT5)含有 α/ β-水解酶結(jié)構(gòu)域(Abhydrolase domain containing, ABHD)家族,是典型的代謝絲。對其蛋白結(jié)構(gòu)和功能的預(yù)測結(jié)果顯示該家族蛋白在脂質(zhì)代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和代謝類疾病調(diào)多種的功能[3]。 ABHD16A 的基因定位人 ABHD16A 位于染色體 6p21.33 的位置,有 21 個外顯子,4 個轉(zhuǎn)錄本,其中只有兩個碼蛋白(NCBI 參考序列號:NM_001177515.1 和 NM_021160.2)。Spies 等[4-6]研究顯D16A 位于人類主要組織相容性復(fù)合物(Human major histocompatibility complex, MHC)簇中,且位于補體基因簇 C2 和 HLA-B 靠近編碼腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,Tβ)基因的長度為 555kb 的基因區(qū)域中(圖 1A)。另外,家鼠的 ABHD16A 位于第 17 號主要組織相容性復(fù)合物Ⅲ的基因簇中,且位于熱休克蛋白(Heat shock protein)Hsp70 和 ,靠近蛋白激酶 Ck2b 基因的區(qū)域中[131-133](圖 1B)。ABHD16A 的基因在人和鼠基因組特點提示該蛋白可能與機體免疫有關(guān)。A
但在后期進化中發(fā)生了變化,它們保留了催化殘基,而結(jié)合位bioH 結(jié)構(gòu)域位于氨基酸 276-428 位置處,這種輔酶 A 結(jié)合酶是產(chǎn)生雙丙酰輔構(gòu)域在生物素生物合成過程中有一定的作用,但具體功能目前尚不清楚[8-9]酸 302-398 位置處,該結(jié)構(gòu)域有溶血磷脂酶活性,屬于 α/β 水解酶超家族[3,1圖 2:預(yù)測 ABHD16A 蛋白三維模式圖Fig.2 Prediction of ABHD16A Protein Three-Dimensional Patterns
預(yù)測ABHD16A蛋白三維模式圖
【參考文獻】
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1 楊凱;管世鶴;王愛華;潘穎;吳園園;孫蓓蓓;;拉米夫定聯(lián)合α干擾素序貫處理增強干擾素誘導(dǎo)跨膜蛋白表達的研究[J];中國藥理學(xué)通報;2013年11期
2 喬紅梅;龐煥香;張云峰;成煥吉;劉麗;魯繼榮;;肺炎支原體肺炎患兒IL-6、IL-10、TNF-α的變化[J];臨床兒科雜志;2012年01期
3 李先昆;聶智毅;曾日中;;酵母雙雜交技術(shù)研究與應(yīng)用進展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2009年07期
本文編號:2819213
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