【摘要】：目的(1)了解廣西部分地區(qū)接受高效抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(HARRT)HIV-1雙陽(yáng)家庭病毒基因亞型分布特征和耐藥情況,為了解廣西HIV-1毒株傳播規(guī)律和流行趨勢(shì)提供依據(jù);同時(shí)探索各亞型與HIV-1耐藥發(fā)生的關(guān)系,為更好地開(kāi)展抗病毒治療提供參考依據(jù)。(2)了解廣西部分地區(qū)HIV-1雙陽(yáng)家庭病毒不同基因亞型間的細(xì)胞嗜性情況,探討病毒細(xì)胞嗜性與疾病感染進(jìn)程的關(guān)系。方法收集2014-2015年在廣西南寧市、柳州市、桂林市、賀州市、欽州市和貴港市共6個(gè)市經(jīng)HIV-1確證實(shí)驗(yàn)室WB實(shí)驗(yàn)確證陽(yáng)性的HIV-1雙陽(yáng)家庭感染者/患者血樣。共收集77例HIV-1 pol區(qū)序列用于HIV-1基因亞型和耐藥分析;166例HIV-1 env區(qū)序列用于HIV-1基因亞型細(xì)胞嗜性分析。采用自建基因型耐藥檢測(cè)方法(In-house)和巢式聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)方法分別擴(kuò)增HIV-1 pol區(qū)和env區(qū)基因序列片段,將擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海生工生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果用Sequencher5.2.4軟件進(jìn)行序列拼接和處理,Bio Edit 7.0軟件對(duì)序列進(jìn)行比對(duì)、剪切以及翻譯V3環(huán)序列氨基酸,分析頂端四肽類(lèi)型,使用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù);將pol區(qū)序列提交美國(guó)斯坦福大學(xué)的HIV耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)(https://hivdb.stanford.edu)進(jìn)行耐藥突變分析;使用Geno2pheno(coreceptor)2.5在線工具預(yù)測(cè)使用輔助受體情況,根據(jù)V3環(huán)氨基酸序列與HXB2參考株序列進(jìn)行比對(duì),預(yù)測(cè)相應(yīng)的毒株使用輔助受體情況。結(jié)果(1)77例HIV-1 pol序列中,南寧市26例,柳州市16例,桂林市11例,賀州市8例,欽州市7例,貴港市9例;患者年齡為25-73歲。55.84%的病例是通過(guò)家庭外異性傳播感染的,32.47%的病例是通過(guò)自己的配偶感染上的,其中有9例(11.69%)是通過(guò)注射毒品感染的。發(fā)現(xiàn)3種基因亞型,分別是CRF01-AE(89.61%)、CRF07-BC(7.79%)和CRF08-BC(2.60%)。共有8例樣本出現(xiàn)耐藥突變,耐藥突變發(fā)生率為10.39%,其中1例針對(duì)蛋白酶抑制劑(PIs),5例針對(duì)非核苷類(lèi)逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NNRTIs),2例出現(xiàn)對(duì)核苷類(lèi)逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NRTIs)和非核苷類(lèi)逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NNRTIs)雙重耐藥。(2)166例HIV-1 env序列中,發(fā)現(xiàn)6種亞型毒株,CRF01-AE 146例,CRF07-BC 9例,CRF08-BC 6例,B亞型1例,C亞型2例,2例非流行重組體(URF)0107亞型。發(fā)現(xiàn)4種V3環(huán)頂端四肽類(lèi)型,以GPGQ(75.90%)為主,其余分別為GPGR(10.27%),GPGK(2.1%),GPGH(1.4%)。61.64%的毒株被預(yù)測(cè)為使用CCR5作為輔助受體,38.36%毒株被預(yù)測(cè)為使用CXCR4作為輔助受體。結(jié)論(1)廣西部分地區(qū)HIV-1雙陽(yáng)家庭病毒基因亞型以CRF01-AE為主要流行株,主要存在異性性傳播人群中;其次是CRF07-BC型毒株,主流行在靜脈吸毒人群中。(2)廣西部分地區(qū)抗病毒治療的HIV-1雙陽(yáng)家庭病毒耐藥發(fā)生率耐屬于中度流行(3)HIV-1雙陽(yáng)家庭病毒存在對(duì)NRTIs和NNRTIs類(lèi)藥物雙重耐藥情況,應(yīng)加大對(duì)正在治療HIV/AIDS病例耐藥株流行的監(jiān)測(cè)和檢測(cè)。(4)廣西部分地區(qū)HIV-1雙陽(yáng)家庭病毒env基因V3環(huán)頂端四肽以GPGQ為主,CRF01-AE、CRF07-BC和CRF08-BC 3種重組毒株的頂端四肽均以GPGQ為主。(5)廣西部分地區(qū)HIV-1雙陽(yáng)家庭病毒主要表現(xiàn)為巨噬細(xì)胞嗜性的非合胞體誘導(dǎo)型,該人群X4嗜性毒株相對(duì)其他HIV/AIDS人群占比更高,應(yīng)當(dāng)引起關(guān)注。
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類(lèi)號(hào)】：R512.91

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本文編號(hào)：2765486