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肺結核患者與肺癌患者肺組織微生物組特征研究

發(fā)布時間:2020-07-18 16:57
【摘要】:目的:探討肺結核患者與肺癌患者不同病理形態(tài)病灶區(qū)和正常肺區(qū)的微生物組基本特征。方法:選取2016—2017年間首都醫(yī)科大學附屬北京胸科醫(yī)院共20例臨床及病理確診為肺結核患者和肺癌患者的福爾馬林固定石蠟包埋的配對組織標本,通過顯微切割技術分別獲得FFPE組織的壞死區(qū)、肉芽腫區(qū)、鱗癌區(qū)、腺癌區(qū)和正常肺區(qū)。采用16S rRNA高通量測序的方法,檢測其微生物組特征。結果:肺結核患者肺部切除樣本在門水平上,主要有五個類群(相對豐度1%):分別為 Proteobacteria、Actinobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes 和 TM7。壞死區(qū),肉芽腫區(qū)和正常肺區(qū)之間微生物群落組成未見差異,但是Firmicutes在壞死區(qū)相對豐度顯著高于肉芽腫區(qū)(Z=-2.100,P=0.036)和正常肺區(qū)(Z=-2.380,P=0.017),而TM7在正常肺區(qū)相對豐度顯著高于壞死區(qū)(Z=-2.240,P=0.025)。在屬水平上,主要有九個類群(相對豐度1%):分別為Ochrobactrum、Sphingomonas、Corynebacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Hydrogenophilus、Enhydrobacter、Propionibacterium和Sphingobacterium。配對樣品秩和檢驗結果表明Ohrobactrum在正常肺區(qū)相對豐度顯著高于壞死區(qū)(Z=-2.380,P=0.017)和肉芽腫區(qū)(Z=-2.100,P=0.036),Sphingomonas在正常肺區(qū)相對豐度顯著低于壞死區(qū)(Z=-2.521,P=0.012)和肉芽腫區(qū)(Z=-2.521,P=0.012),Enhydrobacter在壞死區(qū)相對豐度顯著高于肉芽腫區(qū)(Z=-2.100,P=0.036)和正常肺區(qū)(Z=-2.380,P=0.017)。此外肺結核致病菌Mycobacterium相對豐度1%,且在壞死區(qū)相對豐度顯著高于肉芽腫區(qū)(Z=-2.366,P=0.018)和正常肺區(qū)(Z=-2.366,P=0.018)。肺癌患者肺部切除樣本在門水平上,主要有九個類群(相對豐度1%):分別為Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes、Actinobacteria、Acdobacteria、Cyanbacteria、Verrucomicrobi、Planctomyces和TM7。病灶區(qū)和正常肺區(qū)的微生物群落組成未見差異。在屬水平上,主要有十三個類群(相對豐度1%):分別為 Ochrobactrum、Pseudomonas、Stenotrophomonas、Brevibacterium、Parabacteroides、Sphingobacterium、Lactobacillus、Corynebacterium、Acinetobacter、Natronomonas、Brevundimonas、Sphingomonas和Enhydrobacter。腺癌區(qū)與正常肺區(qū)(F=2.151,P=0.024),鱗癌區(qū)與正常肺區(qū)(F=3.012,P=0.023)的微生物組特征差異有統(tǒng)計學意義。配對樣品秩和檢驗結果表明Pseudomonas在腫瘤病灶區(qū)相對豐度較高(Z=-2.197,P=0.028)。Enhydrobacter在腫瘤病灶區(qū)相對豐度較低(Z=-2.028,P=0.043)。此外,門水平上Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes、TM7,以及屬水平上Sphingobacterium、Sphingomonas、Corynebacterium、Brevundimonas、Enhydrobacter在結核病灶區(qū)與腫瘤病灶區(qū)以及/或結核正常肺區(qū)與腫瘤正常肺區(qū)之間存在顯著性差異(P0.05)。結論:結核病患者和肺癌患者肺部不同區(qū)域的微生物群落組成在門水平上沒有顯著差異,但在屬水平上,有一定差異,這些差異菌有助于進一步了解結核和肺癌的發(fā)病機制,但具體聯(lián)系仍需進一步研究。此外發(fā)現(xiàn)了部分微生物在兩種疾病間分布存在差異,需要更大樣本量的進一步研究以確定其作用。本研究探索了肺結核患者和肺癌患者肺部壞死區(qū)、肉芽腫區(qū)、鱗癌區(qū)、腺癌區(qū)和正常肺的微生物群落組成特征和差異,為肺結核和肺癌的臨床預防、診斷和治療奠定了理論基礎。
【學位授予單位】:北京市結核病胸部腫瘤研究所
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R521;R734.2
【圖文】:

肺結核,顯微切割,癌病,肉芽


圖1組織標本顯微切割(圖A、B、C為肺結核壞死區(qū);圖D、E、F為肺結核肉芽逡逑腫區(qū);圖G、H、I為淲癌病灶區(qū);圖?!、K、L為腺癌病灶區(qū);圖M、N、0為正常組織逡逑區(qū)。左圖為鏡下觀察的組織切片,中圖為圈選切割區(qū)域,右圖為顯微切割后情況)逡逑22逡逑

樣本


結核患者樣本DNA16SrRNA擴增建庫結果

樣本,腫瘤患者


腫瘤患者樣本DNA16SrRNA擴增建庫結果

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