發(fā)布時(shí)間：2020-07-18 16:57

【摘要】：目的:探討肺結(jié)核患者與肺癌患者不同病理形態(tài)病灶區(qū)和正常肺區(qū)的微生物組基本特征。方法:選取2016—2017年間首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京胸科醫(yī)院共20例臨床及病理確診為肺結(jié)核患者和肺癌患者的福爾馬林固定石蠟包埋的配對(duì)組織標(biāo)本,通過(guò)顯微切割技術(shù)分別獲得FFPE組織的壞死區(qū)、肉芽腫區(qū)、鱗癌區(qū)、腺癌區(qū)和正常肺區(qū)。采用16S rRNA高通量測(cè)序的方法,檢測(cè)其微生物組特征。結(jié)果:肺結(jié)核患者肺部切除樣本在門(mén)水平上,主要有五個(gè)類群(相對(duì)豐度1%):分別為 Proteobacteria、Actinobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes 和 TM7。壞死區(qū),肉芽腫區(qū)和正常肺區(qū)之間微生物群落組成未見(jiàn)差異,但是Firmicutes在壞死區(qū)相對(duì)豐度顯著高于肉芽腫區(qū)(Z=-2.100,P=0.036)和正常肺區(qū)(Z=-2.380,P=0.017),而TM7在正常肺區(qū)相對(duì)豐度顯著高于壞死區(qū)(Z=-2.240,P=0.025)。在屬水平上,主要有九個(gè)類群(相對(duì)豐度1%):分別為Ochrobactrum、Sphingomonas、Corynebacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Hydrogenophilus、Enhydrobacter、Propionibacterium和Sphingobacterium。配對(duì)樣品秩和檢驗(yàn)結(jié)果表明Ohrobactrum在正常肺區(qū)相對(duì)豐度顯著高于壞死區(qū)(Z=-2.380,P=0.017)和肉芽腫區(qū)(Z=-2.100,P=0.036),Sphingomonas在正常肺區(qū)相對(duì)豐度顯著低于壞死區(qū)(Z=-2.521,P=0.012)和肉芽腫區(qū)(Z=-2.521,P=0.012),Enhydrobacter在壞死區(qū)相對(duì)豐度顯著高于肉芽腫區(qū)(Z=-2.100,P=0.036)和正常肺區(qū)(Z=-2.380,P=0.017)。此外肺結(jié)核致病菌Mycobacterium相對(duì)豐度1%,且在壞死區(qū)相對(duì)豐度顯著高于肉芽腫區(qū)(Z=-2.366,P=0.018)和正常肺區(qū)(Z=-2.366,P=0.018)。肺癌患者肺部切除樣本在門(mén)水平上,主要有九個(gè)類群(相對(duì)豐度1%):分別為Proteobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes、Actinobacteria、Acdobacteria、Cyanbacteria、Verrucomicrobi、Planctomyces和TM7。病灶區(qū)和正常肺區(qū)的微生物群落組成未見(jiàn)差異。在屬水平上,主要有十三個(gè)類群(相對(duì)豐度1%):分別為 Ochrobactrum、Pseudomonas、Stenotrophomonas、Brevibacterium、Parabacteroides、Sphingobacterium、Lactobacillus、Corynebacterium、Acinetobacter、Natronomonas、Brevundimonas、Sphingomonas和Enhydrobacter。腺癌區(qū)與正常肺區(qū)(F=2.151,P=0.024),鱗癌區(qū)與正常肺區(qū)(F=3.012,P=0.023)的微生物組特征差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。配對(duì)樣品秩和檢驗(yàn)結(jié)果表明Pseudomonas在腫瘤病灶區(qū)相對(duì)豐度較高(Z=-2.197,P=0.028)。Enhydrobacter在腫瘤病灶區(qū)相對(duì)豐度較低(Z=-2.028,P=0.043)。此外,門(mén)水平上Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes、TM7,以及屬水平上Sphingobacterium、Sphingomonas、Corynebacterium、Brevundimonas、Enhydrobacter在結(jié)核病灶區(qū)與腫瘤病灶區(qū)以及/或結(jié)核正常肺區(qū)與腫瘤正常肺區(qū)之間存在顯著性差異(P0.05)。結(jié)論:結(jié)核病患者和肺癌患者肺部不同區(qū)域的微生物群落組成在門(mén)水平上沒(méi)有顯著差異,但在屬水平上,有一定差異,這些差異菌有助于進(jìn)一步了解結(jié)核和肺癌的發(fā)病機(jī)制,但具體聯(lián)系仍需進(jìn)一步研究。此外發(fā)現(xiàn)了部分微生物在兩種疾病間分布存在差異,需要更大樣本量的進(jìn)一步研究以確定其作用。本研究探索了肺結(jié)核患者和肺癌患者肺部壞死區(qū)、肉芽腫區(qū)、鱗癌區(qū)、腺癌區(qū)和正常肺的微生物群落組成特征和差異,為肺結(jié)核和肺癌的臨床預(yù)防、診斷和治療奠定了理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】：北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號(hào)】：R521;R734.2
【圖文】：

圖１組織標(biāo)本顯微切割（圖Ａ、Ｂ、Ｃ為肺結(jié)核壞死區(qū)；圖Ｄ、Ｅ、Ｆ為肺結(jié)核肉芽逡逑腫區(qū)；圖Ｇ、Ｈ、Ｉ為淲癌病灶區(qū)；圖？！、Ｋ、Ｌ為腺癌病灶區(qū)；圖Ｍ、Ｎ、０為正常組織逡逑區(qū)。左圖為鏡下觀察的組織切片，中圖為圈選切割區(qū)域，右圖為顯微切割后情況）逡逑２２逡逑

結(jié)核患者樣本DNA16SrRNA擴(kuò)增建庫(kù)結(jié)果

腫瘤患者樣本DNA16SrRNA擴(kuò)增建庫(kù)結(jié)果

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本文編號(hào)：2761168