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廣西地區(qū)慢性丙型肝炎患者NS5A抑制劑天然耐藥突變的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-07-07 08:22
【摘要】:目的:探討廣西地區(qū)未進(jìn)行抗病毒治療的慢性丙型肝炎患者NS5A抑制劑天然耐藥突變情況。方法:(1)采集233例患者治療前的外周靜脈血,將樣本送武漢康圣達(dá)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心檢測(cè)基因型;(2)提取患者的HCV RNA,設(shè)計(jì)針對(duì)HCV NS5A區(qū)域的特異性引物進(jìn)行巢式PCR擴(kuò)增;(3)PCR產(chǎn)物送上海生工生物有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與基因庫(kù)序列進(jìn)行比對(duì),鑒別出耐藥突變位點(diǎn)。結(jié)果:(1)入選的233例患者樣本中有214例擴(kuò)增并測(cè)序成功,慢性丙型肝炎191例,丙肝肝硬化23例,其中基因1a型19例,基因1b型100例,基因3a型23例,基因3b型30例,基因6a型42例;(2)214例擴(kuò)增成功的樣本中有76例(35.5%)檢測(cè)出相關(guān)位點(diǎn)突變,其中56例(26.2%)為單位點(diǎn)突變,20例(9.3%)為兩個(gè)位點(diǎn)聯(lián)合突變;(3)基因1型119例,有53例(44.5%)患者檢測(cè)出相關(guān)位點(diǎn)突變。其中基因1a型有7例(36.9%),突變位點(diǎn)為Q30H(n=1,5.3%),H58P(n=1,5.3%),M28T+H58P(n=1,5.3%)和H58P+E62D(n=4,21.0%);基因1b型有46例(46.0.0%),突變位點(diǎn)為R30Q(n=23,23.0%),Y93H(n=6,6.0%),Q54H(n=5,5.0%),P58S(n=4,4.0%),Q54H+P58S(n=4,4.0%),L31M+R30Q(n=2,2.0%)和Q54H+R30Q(n=2,2.0%);(4)基因3型53例,有19例(35.8%)檢測(cè)出相關(guān)位點(diǎn)突變。其中基因3a型有9例(39.1%),突變位點(diǎn)為A30K(n=2,8.7%),L31M(n=1,4.3%)和A30K+L31M(n=6,21.0%);基因3b型有10例(33.3%),突變位點(diǎn)為M28L(n=1,3.3%),K30A(n=1,3.3%),M31L(n=3,10.0%),T54A(n=4,13.4%)和K30A+M31L(n=1,3.3%);(5)基因6a型42例,有3例(7.2%)出現(xiàn)了相關(guān)位點(diǎn)突變,突變位點(diǎn)為F28V(n=1,2.4%),T58P(n=1,2.4%)和T93A(n=1,2.4%);(6)各個(gè)基因型突變率兩兩比較:基因1型和基因3型比較(44.5%VS 35.8%),P=0.2860.05,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;基因1型和6型比較(44.5%VS 7.2%),P=0.0000.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;基因3型和基因6型比較(35.8%VS 7.2%),P=0.0010.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;(7)丙肝肝硬化患者耐藥突變檢出率為47.8%,高于慢性丙型肝炎患者的檢出率34.0%,P=0.0000.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論:(1)廣西地區(qū)未進(jìn)行抗病毒治療的丙型肝炎患者存在NS5A抑制劑的天然耐藥位點(diǎn)突變,既有單位點(diǎn)突變,也有兩個(gè)位點(diǎn)聯(lián)合突變;(2)基因1型和基因3型患者的突變率高于基因6型患者;(3)丙肝肝硬化患者的耐藥突變率高于慢性丙型肝炎患者的突變率,耐藥突變可能與肝硬化的發(fā)生有關(guān)。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:R512.63
【圖文】:

基因組序列,基因組序列,慢性丙型肝炎


圖 1 -1 HCV 基因組序列(Figure1-1 HCV genome sequence )在 2011 年以前,治療慢性丙型肝炎患者的標(biāo)準(zhǔn)方案是聚乙二醇干擾素Pegylated interferons,PEG-IFN)聯(lián)合利巴韋林(Ribavirin,RBV),該方患者獲得的持續(xù)病毒學(xué)應(yīng)答(sustained viral response,SVR)率僅為 40%~0%,尤其對(duì)基因 1 型慢性丙型肝炎患者的治療效果欠佳[11, 12],且有相當(dāng)部分丙肝患者因禁忌證無(wú)法使用或因用藥過(guò)程中出現(xiàn)的嚴(yán)重的不良反應(yīng)停藥[13]。最近幾年,國(guó)外研發(fā)的針對(duì) HCV 生命周期中病毒蛋白特定靶的直接抗病毒藥物(Direct-acting antiviral agents, DAAs)在慢性丙型肝炎病毒領(lǐng)域取得了重大的突破,使慢性丙型肝炎患者的 SVR 率可以提高到0%以上[3],丙型肝炎的治療也就從此進(jìn)入了新的時(shí)代。DAAs 藥物在治療CV 感染的過(guò)程中具有高 SVR 率、廣泛基因型譜、治療周期短、不良反應(yīng)

電泳圖,基因,電泳,天然耐藥


廣西地區(qū)慢性丙型肝炎患者 NS5A 抑制劑天然耐藥突變的研究 2018 屆碩士學(xué)位論文圖 3-2-1 基因 1a 型電泳圖 圖 3-2-2 基因 3a/b 型電泳圖(Figure 3-2-1 The electrophoretic (Figure 3-2-2 The electrophoreticdiagram of genotype 1a) diagram of genotype 3a/b)

電泳圖,天然耐藥,孔道,電泳圖


廣西地區(qū)慢性丙型肝炎患者 NS5A 抑制劑天然耐藥突變的研究 2018 屆碩士學(xué)位論文圖 3-2-1 基因 1a 型電泳圖 圖 3-2-2 基因 3a/b 型電泳圖(Figure 3-2-1 The electrophoretic (Figure 3-2-2 The electrophoreticdiagram of genotype 1a) diagram of genotype 3a/b)

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本文編號(hào):2744889

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