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傳染病動(dòng)力學(xué)模型在長沙市水痘疫情預(yù)警及干預(yù)措施效果評(píng)價(jià)中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2020-07-06 21:07
【摘要】:目的:(1)分析湖南省長沙市水痘的發(fā)病和流行情況以及其一般特征;(2)通過Logistic微分方程模型擬合,探討長沙市水痘流行周期的時(shí)間特點(diǎn),找出流行周期內(nèi)的疫情速度變化拐點(diǎn),得出預(yù)警周;(3)建立湖南省長沙市水痘傳播的SEIR(Susceptible-Exposed-Infective-Removal)模型,預(yù)測(cè)水痘發(fā)病趨勢(shì),探討病例隔離、疫苗接種、通風(fēng)消毒等防控措施在水痘疫情暴發(fā)中的防控效果。方法:(1)通過湖南省長沙市疾病預(yù)防控制中心,國家疾病監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)提取湖南省長沙市2008-2017年所有水痘患者基本信息;(2)根據(jù)患者發(fā)病時(shí)間將其整理為周發(fā)病例數(shù),從而分析長沙市水痘流行的周期規(guī)律,利用Logistic微分方程模型對(duì)所有流行周期分別進(jìn)行擬合,獲得方程中各周期內(nèi)的參數(shù)K和N,進(jìn)而根據(jù)微分方程求得參數(shù)C,獲得“疫情加速周”和“預(yù)警周”;(3)以長沙市某學(xué)校某一次水痘暴發(fā)情況為對(duì)象,根據(jù)傳染病群體模型方法中的水痘基本傳播模型,結(jié)合長沙市水痘傳播特點(diǎn),構(gòu)建湖南省長沙市水痘傳播模型,通過查閱相關(guān)文獻(xiàn)、調(diào)查報(bào)告、統(tǒng)計(jì)學(xué)資料等獲取模型中相關(guān)參數(shù),借助1stopt、Matlab7.1和Berkeley Madonna8.3.18等工具,對(duì)傳染概率(β)進(jìn)行擬合估計(jì),通過數(shù)據(jù)擬合,預(yù)測(cè)水痘暴發(fā)疫情的發(fā)展趨勢(shì),并通過改變模型倉室以及模型參數(shù)或條件,探討隔離病人、疫苗接種等防控措施對(duì)水痘疫情暴發(fā)的防控效果。結(jié)果:(1)本研究從湖南省長沙市疾病預(yù)防控制中心,通過國家疾病監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)收集2008-2017年間上報(bào)的所有水痘病例,共58528例,其中死亡3例;分析發(fā)現(xiàn),2009年發(fā)病率最低(5.22/萬);2017年最高(13.04/萬);且各年度之間水痘的發(fā)病率差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。(2)長沙市2008-2017年水痘患者上報(bào)人數(shù)平均發(fā)展速度112.97%,平均增長速度為12.97%,其發(fā)病率呈現(xiàn)明顯的逐年增長趨勢(shì)。(3)分析所有水痘患者的上報(bào)時(shí)間發(fā)現(xiàn),長沙市水痘發(fā)病每年呈現(xiàn)兩次高峰,分別在4-7月和11月至次年1月,且各個(gè)月份間均有病例的發(fā)生,其中12月平均報(bào)告病例數(shù)最多(約為917.3例),9月份報(bào)告病例數(shù)最少(約為194.3例)。(4)長沙市水痘每年的兩個(gè)高峰期分別定義為夏秋季流行高峰和冬春季流行高峰。夏秋季所對(duì)應(yīng)時(shí)間為:每年的第8周至第37周;冬春季流行周期為每年的第38周至次年的第7周。(5)通過Logistic模型擬合分析得,夏秋季流行周期的平均“疫情加速周”約為第16周,冬春季流行周期約為第45周,且標(biāo)準(zhǔn)差均約為1周;本研究建議將每年的第15周和第44周作為長沙市水痘的預(yù)警周,提高水痘的關(guān)注,從而更好地預(yù)防水痘暴發(fā)。(6)通過統(tǒng)計(jì)分析可得,SEIR模型的模擬理論值與實(shí)際值之間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(c~2(28)0.608,P(29).005),通過擬合優(yōu)度檢驗(yàn)顯示R~2為0.816,P0.01,構(gòu)建的SEIR模型與水痘暴發(fā)疫情擬合效果較好。(7)通過SEIR模型模擬分析顯示,當(dāng)對(duì)水痘患者進(jìn)行嚴(yán)格隔離時(shí),疫情累計(jì)病例最高達(dá)13人,可使累計(jì)發(fā)病人數(shù)明顯減少;疫苗接種對(duì)水痘疫情有明顯的防控效果,且接種率越高,防控效果越好,當(dāng)接種率達(dá)到50%時(shí),可使累計(jì)罹患率TAR降為0.56%;通風(fēng)、消毒有效率對(duì)水痘疫情的控制無明顯效果,隨著通風(fēng)、消毒有效率的升高,累積患病人數(shù)無明顯差異,只是高峰時(shí)間發(fā)生延后。通風(fēng)消毒有效率越高,疫情高峰日后移越久,疫情持續(xù)時(shí)間越長。只有當(dāng)消毒有效率達(dá)到90%時(shí),可稍微較少累計(jì)發(fā)病人數(shù),但也明顯延長了疫情的持續(xù)時(shí)間。(8)另外對(duì)不同干預(yù)措施的聯(lián)合防控進(jìn)行模擬比較,結(jié)果發(fā)現(xiàn)“隔離+疫苗接種”組合防控效果較好,當(dāng)疫苗接種率達(dá)0.3時(shí)可使TAR降為0.28%;三種防控措施同時(shí)聯(lián)合采取時(shí)防控效果最為顯著,且當(dāng)接種率達(dá)到0.2時(shí),便可使TAR控制在1.0%以下;另外研究發(fā)現(xiàn)當(dāng)通風(fēng)、消毒有效率較低時(shí),其聯(lián)合防控效果與去除其之后效果相近,只有當(dāng)通風(fēng)、消毒有效率達(dá)0.7時(shí),才可使TAR%明顯降低。結(jié)論:(1)長沙市2008-2017年水痘患者平均增長速度為12.97%,其發(fā)病率整體上呈逐年增長趨勢(shì);長沙市水痘每年有兩個(gè)流行周期,分別為夏秋季流行周期和冬春季流行周期。(2)研究發(fā)現(xiàn),長沙市水痘夏秋季流行周期的平均“疫情加速周”約為第16周,冬春季的約為第45周,且標(biāo)準(zhǔn)差均約為1周;因此,本研究建議將每年的第15周和第44周作為長沙市水痘的預(yù)警周,提高水痘的關(guān)注,從而更好地預(yù)防水痘暴發(fā)。(3)分析發(fā)現(xiàn)病例隔離、疫苗接種均可以有效的控制學(xué)校水痘疫情的發(fā)展,且接種率越大,防控效果越好;通風(fēng)、消毒等防控措施對(duì)學(xué)校水痘疫情的發(fā)展無明顯的防控效果;病例隔離和疫苗接種聯(lián)合防控效果優(yōu)于單項(xiàng)措施;學(xué)校水痘暴發(fā)時(shí)可以采取病例隔離與疫苗接種的綜合干預(yù)措施,且疫苗接種率越大,防控效果越好,同時(shí)可加強(qiáng)通風(fēng)、消毒作為輔助。
【學(xué)位授予單位】:湖南師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R181.3;R511.5
【圖文】:

模型曲線,變化速度,模型曲線


圖 2-2 Logistic 模型曲線變化速度圖用時(shí)間 t 對(duì)方程 2-2 進(jìn)行一階導(dǎo)數(shù)轉(zhuǎn)換,可得新發(fā)病例與時(shí)間 t 的關(guān)系表達(dá)式:()2()(1)kecktceNkedtdn (2-3)該方程是對(duì)新發(fā)病例數(shù)隨時(shí)間變化的表示,若進(jìn)一步對(duì)方程 2-3 求導(dǎo),也就是對(duì)方程 2-2 進(jìn)行二階求導(dǎo),便可以得到新發(fā)病例數(shù)變化速度的曲線方程。通過分析可得,當(dāng)疾病疫情發(fā)展到最高峰時(shí),新發(fā)病例數(shù)的變化速度減少至 0。因此令方程 2-2 的二階導(dǎo)數(shù)等于 0 時(shí),通過求解,即可得疾病發(fā)展過程中新發(fā)病例由增加到減少時(shí)的拐點(diǎn),也就是疾病處于高峰時(shí)的具體時(shí)間 ()22kctt 。此外,對(duì)方程 2-3 進(jìn)行二階求導(dǎo)(方程 2-2 的三階導(dǎo)數(shù)),便可獲得新發(fā)病例數(shù)增減速度的變化速度方程,此時(shí),另方程結(jié)果為 0 時(shí),可得新發(fā)病例數(shù)增長速度變化的拐點(diǎn),即

微分方程模型


圖 2-3 Logistic 微分方程模型變化時(shí)間特點(diǎn)2.1.2.3 模型的建立首先確定 Logistic 微分方程模型,根據(jù)模型需要將所有水痘患者根據(jù)發(fā)病時(shí)間,按照 2008-2017 年周歷表,整理為周發(fā)病例及累計(jì)病例數(shù),并進(jìn)行初步清洗,分析長沙市 2008 年到 2017 年水痘的周發(fā)病情況及周發(fā)病數(shù)的變化規(guī)律,根據(jù)水痘流行特點(diǎn),將 10 年的所有水痘發(fā)病數(shù)據(jù)整理為若干個(gè)流行周期。利用 Logistic微分方程模型對(duì)每個(gè)流行周期進(jìn)行曲線擬合,從而獲得各周期中的參數(shù) N 與 k,進(jìn)而通過數(shù)理統(tǒng)計(jì)中的帶入法求得(方程 2-2)中每個(gè)流行周期所對(duì)應(yīng)的參數(shù) c。2.1.2.4 預(yù)警周的確定由于衛(wèi)生決策以及干預(yù)措施的實(shí)施等均需要一定時(shí)間[51],所以當(dāng)疫情發(fā)展到

標(biāo)準(zhǔn)差,水痘,周期,疫情


首先確定 Logistic 微分方程模型,根據(jù)模型需要將所有水痘患者根據(jù)發(fā)病時(shí)間,按照 2008-2017 年周歷表,整理為周發(fā)病例及累計(jì)病例數(shù),并進(jìn)行初步清洗,分析長沙市 2008 年到 2017 年水痘的周發(fā)病情況及周發(fā)病數(shù)的變化規(guī)律,根據(jù)水痘流行特點(diǎn),將 10 年的所有水痘發(fā)病數(shù)據(jù)整理為若干個(gè)流行周期。利用 Logistic微分方程模型對(duì)每個(gè)流行周期進(jìn)行曲線擬合,從而獲得各周期中的參數(shù) N 與 k,進(jìn)而通過數(shù)理統(tǒng)計(jì)中的帶入法求得(方程 2-2)中每個(gè)流行周期所對(duì)應(yīng)的參數(shù) c。2.1.2.4 預(yù)警周的確定由于衛(wèi)生決策以及干預(yù)措施的實(shí)施等均需要一定時(shí)間[51],所以當(dāng)疫情發(fā)展到“疫情加速周”時(shí)進(jìn)行預(yù)警,往往會(huì)導(dǎo)致出現(xiàn)一定的滯后現(xiàn)象,因此本研究擬選擇在“疫情加速周”提前一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差的時(shí)間作為水痘疫情的“預(yù)警周”,即建議預(yù)警周,具體方法如圖 2-4 所示。

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