【摘要】：研究背景宏基因組二代測序(Metagenomic next generation sequencing,mNGS)是對樣本中的總DNA或RNA進(jìn)行測序后再通過生物信息分析軟件全面鑒定細(xì)菌、病毒、真菌、寄生蟲等病原體,它提供的是一種無偏的分析方法,理論上可識別所有序列已知的病原體。2014年Wilson等報道了 mNGS檢測用于診斷嚴(yán)重聯(lián)合免疫缺陷癥患者鉤體病的案例,正式開啟了 mNGS檢測臨床應(yīng)用的大門。2015年P(guān)erlejewski等及2016年Guan等報道了 mNGS檢測在診斷中樞神經(jīng)系統(tǒng)病毒感染中的應(yīng)用。2016年Yao等報道了 mNGS檢測在診斷李斯特桿菌性腦膜腦炎的應(yīng)用。2018年He等報道了 mNGS檢測用于診斷免疫功能低下患者的創(chuàng)傷弧菌感染。此外,2017年Salzberg等在一項招募了 11名可疑中樞神經(jīng)系統(tǒng)(Central nervous system,CNS)感染患者的小型隊列研究中,腦組織和脊髓的活檢也成功地應(yīng)用到了 mNGS技術(shù)。2018年,一項對99例小兒細(xì)菌性腦膜炎患者腦脊液mNGS結(jié)果的回顧性分析,發(fā)現(xiàn)有10種不同的細(xì)菌病原體。同年,一項針對511個來自感染性疾病患者的樣本的大型前瞻性研究表明,mNGS技術(shù)對病原體的敏感性高于病原體培養(yǎng),且其結(jié)果受抗生素使用影響較小。2018年Fan等報道了 mNGS在神經(jīng)型布魯氏菌病及神經(jīng)型囊尾蚴病診斷中的應(yīng)用。2018年Ai等將肝組織和外周血樣本同時進(jìn)行mNGS檢測,最后診斷了局部肝結(jié)核。研究方法mNGS技術(shù)在臨床上應(yīng)用廣泛,越來越多的病例報道證明了其在感染性疾病診斷中所發(fā)揮的重要作用,但其在結(jié)核性腦膜炎(Tuberculous meningitis,TBM)診斷中的應(yīng)用尚不清楚。目前臨床上用于診斷TBM的方法有:腦脊液細(xì)菌培養(yǎng)、抗酸染色、PCR檢查、Xpert MTB/RIF法、mNGS檢測等,腦脊液結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)是TBM診斷的金標(biāo)準(zhǔn),但最快也需要兩到四周才有結(jié)果。然而,mNGS檢測在TBM患者診斷中的應(yīng)用研究甚少。本中心自2015到2018年共送檢130例腦脊液mNGS檢測標(biāo)本,其中患者最終為結(jié)核性腦膜炎的共17例,因此本文回顧分析了這17例TBM患者的mNGS和常規(guī)檢測方法的結(jié)果,并以細(xì)菌性腦膜炎、隱球菌性腦膜炎以及病毒性腦膜腦炎患者為mNGS陽性對照,以自身免疫性腦炎一例為mNGS陰性對照,來進(jìn)行mNGS與常規(guī)檢測方法敏感度、特異度等的比較。結(jié)果mNGS檢測結(jié)果中顯示的結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(Mycobacteriumtuberculosis complex,MBTC)包括結(jié)核分枝桿菌(M.tuberculosis)、非洲分枝桿菌(M.africanum)、牛分枝桿菌(M.bovis)、坎那分枝桿菌(M.canettii)。mNGS檢測結(jié)果陽性病例共發(fā)現(xiàn)13例,其中有12例檢出結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群。結(jié)核性腦膜炎的傳統(tǒng)檢測方法包括:腦脊液結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)、抗酸染色和PCR檢查。其中,結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)結(jié)果陽性1例,PCR結(jié)果陽性3例,抗酸染色陽性8例,有4個病例mNGS檢測陰性而抗酸染色結(jié)果為陽性,一個患者最終診斷為TBM合并隱球菌性腦膜炎。結(jié)論mNGS 比傳統(tǒng)檢測方法更敏感,mNGS檢測與抗酸染色聯(lián)合應(yīng)用可提高中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染性疾病的檢出率。本研究提示mNGS檢測可促進(jìn)腦脊液中MTB的識別,并可作為臨床疑診TBM的常規(guī)診斷方法。
【學(xué)位授予單位】：南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：R529.3

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本文編號：2742734