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云南省2017年新分離鼠疫菌表型與基因型研究

發(fā)布時間:2020-05-30 22:21
【摘要】:[目的]了解云南省新發(fā)鼠疫疫情所分離鼠疫菌的表型及基因型特征、并對其進行溯源分析,藉此查明新發(fā)鼠疫疫情的性質及來源,為制定針對該疫源地科學地防控策略提供科學依據。[方法]1.表型測定:進行阿拉伯糖、密二糖、鼠李糖、麥芽糖及甘油的發(fā)酵實驗,脫氮實驗,VW毒力因子檢測,色素沉著因子檢測及營養(yǎng)需求來測定鶴慶鼠疫菌的表型特征。2.基因型測定:通過差異區(qū)段(Different region,DFR)分型、規(guī)律成簇的間隔短回文重復序列(CRISPRs)分型與可變數(shù)目串聯(lián)重復序列(MLVA)分型(12+14策略)方法來判定新分離鼠疫菌的基因型別,同時以云南既往代表菌株信息為參照,利用BN6.6軟件進行溯源分析。[結果]1.麗江菌株、劍川菌株與鶴慶菌株生化特性,均發(fā)酵阿拉伯糖、麥芽糖、甘油且脫氮陽性,生物型屬于古典變種型;其他表型均為VW~+菌株、色素沉著因子陽性,營養(yǎng)需求類型為苯丙氨酸依賴、谷氨酸不依賴型。2.2017年云南省新分離15株鼠疫菌DFR型別一致均為DFR 01、02、13、23四個位點上缺失,其余位點不缺失,與麗江菌株有相同的DFR型別,為Genomovar05型。3.2017年云南省新分離15株鼠疫菌CRISPR分型中,YPa排序為“a1-a2-a3-a4-a5-a6-a7”,YPb為“b1-b2-b3-b4”,YPc為“c1-c2-c3”,與麗江菌株有著相同的型別為基因簇Ca7。4.鶴慶菌株位于麗江野鼠鼠疫簇內,為同一種MLVA基因型,與HQ1只在位點M22有差異,與位于整個麗江野鼠鼠疫簇的核心位置的麗江菌株2006-7號同源。[結論]鶴慶菌株、玉龍菌株與劍川菌株屬于同一種生物型,均為古典變種型鼠疫耶爾森菌,毒力因子與營養(yǎng)需求等表型均一致。2017年云南省新分離15株鼠疫菌鼠疫菌株在CRISPRs分型與DFR分型上與麗江野鼠疫源地菌株一致,而MLVA(14+12)溯源分析表明,鶴慶菌株來源于麗江菌株的進一步分化,是麗江疫源地進一步向南擴散的結果,鑒于此種類型鼠疫菌的高致病性,應加強對該疫源地持續(xù)監(jiān)測,并做好鼠間疫情的處置,降低其傳播到人的風險。
【圖文】:

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縣鹿子村、古城區(qū)木梳村和鶴慶縣大馬廠村監(jiān)測到鼠疫疫情,其中,劍川縣大慶村與原疫區(qū)(石龍)相距較遠,而與鶴慶縣的大馬廠村相隔無幾,鶴慶縣自新中國成立后首次分離到鼠疫菌,并且均分離自活鼠,此次疫情的大馬廠與大慶村與玉龍縣鹿子村同處于同一山脈,此次疫情是麗江野鼠鼠疫疫源地的南遷還是劍川石龍野鼠鼠疫疫源地的北移,還有待研究。本次疫情從鶴慶縣鼠及其寄生蚤中分離到 10 株鼠疫菌,劍川縣大慶村鼠及其寄生蚤中分離到 3 株鼠疫菌,玉龍縣分離到 1 株鼠疫菌,麗江古城區(qū)分離到 1 株鼠疫菌,新分離的鼠疫菌是什么生物型?毒力因子等表型如何,為何在活鼠中分離得到?其疫源地是家鼠型還是野鼠型?與劍川野鼠鼠疫疫源地性質相同還是與麗江玉龍野鼠鼠疫疫源地性質相同?為此,本研究針對這些新分離菌株進行表型與基因型研究,,以確定其疫源地性質及其致病性強弱,為以后更好的預防控制鼠疫疫情提供科學依據。

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云南省2017年新分離鼠疫菌DFR電泳結果
【學位授予單位】:大理大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:R516.8

【參考文獻】

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