【摘要】：目的對2016~2018年寧夏地區(qū)的腹瀉病例開展監(jiān)測,了解本地區(qū)病毒性腹瀉的病原譜構成及其流行特征,為病毒性腹瀉的預防和控制提供數據基礎和理論依據。對諾如病毒進行分子流行病學研究,通過同源性和系統(tǒng)進化分析、重組分析來揭示寧夏地區(qū)諾如病毒的基因特征和分布特點,了解該病毒的傳播方式和變異規(guī)律,及時發(fā)現主要的流行株、變異株。方法1.按照納入標準和排除標準收集2016.01~2018.12期間在寧夏10家哨點醫(yī)院就診的腹瀉病例標本,同時采集病例信息(包括年齡、性別、發(fā)病時間等)。提取腹瀉標本核酸,通過實時熒光定量PCR(Real-time PCR)同時檢測RV、NoV、SaV、AstV、EAdV。結合病例信息,利用SPSS22.0、SAS軟件統(tǒng)計分析相關指標。2.對GII陽性標本的聚合酶區(qū)和衣殼蛋白區(qū)部分序列進行擴增和測序,用Mega-X軟件構建系統(tǒng)進化樹,并結合諾如病毒分型網站(http://www.rivm.nl/mpf/NoV/typingtool)綜合鑒定基因型別。對兩區(qū)型別不一致的毒株擴增包含ORF1/ORF2重疊區(qū)在內的長片段,用Simplot和RDP4軟件進行重組分析,并分析其分子流行病學特征。結果1.病毒性腹瀉監(jiān)測情況1.1腹瀉病毒檢出情況:2016~2018年寧夏地區(qū)病毒性腹瀉總陽性率為33.00%,HuCV陽性率最高為17.67%,其中GII、SaV和GI組NoV陽性率分別為14.66%、3.07%和0.61%;其次為RV、AstV和EAdV,陽性率分別為14.17%、5.29%和3.59%。1.2病原譜及混合感染:GII和RV是病毒性腹瀉的主要病原體,分別占28.83%、28.75%,其次為混合感染、AstV、SaV、EAdV和GI,分別為21.38%、7.54%、6.13%、6.13%和1.23%。合并感染分為三種,兩種病毒的混合感染共12種203例,以GII合并RV為主;三種病毒的合并感染共9種36例,以GII、RV、AstV的混合感染為主;四種病毒的合并感染共2種5例,以GII、RV、AstV、EAdV的混合感染為主。1.3時間分布:冬季陽性率最高為54.38%,其次為秋季、春季和夏季,陽性率分別為35.33%、32.05%和25.40%(?~2=126.355,P0.001)。寧夏RV、NoV、AstV呈明顯的冬季高發(fā),夏季低發(fā)特點,SaV與之相反,EAdV夏秋季高發(fā)。1.4地區(qū)分布:固原市病毒陽性率最高為44.15%,其次為石嘴山市、吳忠市、中衛(wèi)市和銀川市,陽性率分別為33.96%、31.44%、28.26%和24.76%;不同地區(qū)5種病毒陽性率差異均具有統(tǒng)計學意義,固原市RV、AstV、NoV、EAdV的陽性率均位于全區(qū)第一,SaV在石嘴山市陽性率最高。1.5人群分布:男性陽性率略高于女性(?~2=4.648,P=0.031);0~年齡組陽性率最高為41.10%,50~年齡組陽性率最低為22.09%(?~2=125.367,P0.001);散居兒童陽性率最高為39.88%,家務及待業(yè)陽性率最低為16.51%(?~2=94.058,P0.001)。2.GII組NoV基因分型及重組2.1基因分型:聚合酶區(qū)有5種基因型,GII.Pe、GII.P12、GII.P16、GII.P17和GII.P7;衣殼蛋白區(qū)有6種基因型,GII.4 Sydney_2012、GII.3、GII.2、GII.1、GII.6、GII.17。2.2重組:首次在寧夏發(fā)現12種重組類型:GII.Pe/GII.4 Sydney_2012(39.77%)、GII.P12/GII.3(30.68%)、GII.P16/GII.2(12.50%)、GII.P17/GII.17(3.41%)、GII.P7/GII.6(3.41%)、GII.P16/GII.1(2.27%)、GII.P16/GII.4 Sydney_2012(2.27%)、GII.P17/GII.4Sydney_2012(1.14%)、GII.P12/GII.2(1.14%)、GII.Pe/GII.1(1.14%)、GII.Pe/GII.2(1.14%)、GII.Pe/GII.3(1.14%)。共檢出32株重組株,為GII.Pe/GII.4 Sydney_2012、GII.P16/GII.2、GII.P16/GII.1、GII.P7/GII.6、GII.P12/GII.3型重組株,重組位點均位于ORF1區(qū),在5009bp~5079bp之間。結論1.GII和RV是寧夏病毒性腹瀉的主要病原體,其次為混合感染,混合感染又分兩種、三種、四種病毒的混合感染,主要為GII合并RV(/合并其他病毒)感染為主;寧夏RV、NoV、AstV呈明顯的冬季高發(fā),夏季低發(fā)特點,SaV與之相反,EAdV夏秋季高;.需重點關注固原市RV、AstV、NoV、EAdV及石嘴山市SaV流行情況;0~和70~年齡組為病毒性腹瀉高危人群。2.寧夏GII組NoV多為重組株,首次在該地發(fā)現12種重組類型并檢出GII.Pe/GII.4Sydney_2012、GII.P16/GII.2、GII.P16/GII.1、GII.P7/GII.6、GII.P12/GII.3型重組株,均為型間重組。GII.Pe/GII.4Sydney_2012和GII.P12/GII.3為寧夏流行株且在該地持續(xù)存在,提示應警惕GII.P16重組株未來在該地流行的可能。
【圖文】：

146 種病毒不同月份陽性率分布顯示（見圖 3），RV、GII 組 NoV、AstV 12 月份陽性率最高，RV 和 GII 組 NoV 從 11 月份至次年 3 月份陽性率維持在比較高的水平，AstV

Simplot分析2016-2017年寧夏GⅡ組NoV重組類型
【學位授予單位】：寧夏醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：R512.5;R181.3

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 劉寧飛;王超;羅小軍;丁江;;豬常見病毒性腹瀉及防治[J];畜牧獸醫(yī)科技信息;2018年10期

2 溫玉梅;申茂成;莫傳俊;;豬常見病毒性腹瀉疾病及其防治措施[J];江西農業(yè);2017年07期

3 李軍勝;藍陳福;;利用中西醫(yī)結合的方法治療小兒病毒性腹瀉的療效觀察[J];中國中西醫(yī)結合消化雜志;2015年08期

4 田占輝;;豬常見病毒性腹瀉疾病及其防治對策分析[J];中獸醫(yī)學雜志;2015年09期

5 曹鳳麗;;小兒病毒性腹瀉的中醫(yī)藥治療進展分析與研究[J];人人健康;2016年24期

6 ;仔豬流行病毒性腹瀉新特點[J];畜禽業(yè);2012年03期

7 張冬平;李蓓;崔金娟;;喜炎平聯合雙歧桿菌治療嬰幼兒病毒性腹瀉臨床療效觀察[J];中國醫(yī)藥導報;2010年32期

8 莫敏雪;;喜炎平治療小兒病毒性腹瀉96例效果觀察[J];右江民族醫(yī)學院學報;2008年03期

9 葉洪平;黃功利;彭暉;余志紅;顏紅萍;;苓龍湯佐治小兒病毒性腹瀉80例臨床研究[J];實用中醫(yī)內科雜志;2007年04期

10 趙湛新;;黎氏秋瀉方配合西藥治療嬰幼兒病毒性腹瀉療效觀察[J];實用中醫(yī)藥雜志;2006年07期

相關會議論文 前10條

1 王開功;胡興義;張雙翔;周碧君;文明;程振濤;王偉;馮旭芳;;貴州省仔豬病毒性腹瀉流行病學調查[A];中國畜牧獸醫(yī)學會獸醫(yī)病理學分會、中國病理生理學會動物病理生理專業(yè)委員會、中國實驗動物學會實驗病理學專業(yè)委員會2016年學術研討會論文集[C];2016年

2 何愛華;袁平;修文瓊;關家榮;何家鑫;;嬰幼兒病毒性腹瀉的電鏡診斷[A];第十二屆全國電子顯微學會議論文集[C];2002年

3 董繼業(yè);鄭含笑;王佳芳;夏明;董幼祺;;董幼祺教授治療小兒病毒性腹瀉醫(yī)案二則[A];中華中醫(yī)藥學會兒科分會第三十一次學術大會論文匯編[C];2014年

4 謝曉麗;任敏;張偉;鄧孝智;廖雪春;劉麗榮;張琪琛;;成都地區(qū)嬰幼兒病毒性腹瀉的分子流行病學研究[A];中華醫(yī)學會第十五次全國兒科學術大會論文匯編（上冊）[C];2010年

5 繆春華;朱鳳才;祖榮強;袁兆虎;周印;;鎮(zhèn)江市5歲以下腹瀉住院兒童病毒性腹瀉感染狀況研究[A];華東地區(qū)第十次流行病學學術會議暨華東地區(qū)流行病學學術會議20周年慶典論文集[C];2010年

6 賀順忠;牛永娟;張青蘭;尕么江永;宋仁德;李家奎;;玉樹部分地區(qū)牦牛病毒性腹瀉血清學檢測報告[A];第四屆全國牛病防制及產業(yè)發(fā)展大會論文集[C];2012年

7 王惠;李曉宇;李冰;;2010年青島市夏季病毒性腹瀉流行病學觀察與護理[A];全國醫(yī)院感染護理新進展研討會、全國傳染病護理新進展研討會、全國自然災害護理研討會論文匯編[C];2011年

8 賀銳;趙翠生;張，

本文編號：2599641