【摘要】：艾滋病即獲得性免疫缺陷綜合癥(AIDS)是由人類免疫缺陷病毒(HIV)引起的一種嚴(yán)重傳染病,HIV侵入人體后,破壞人體的細(xì)胞免疫功能,使人體發(fā)生多種難以治愈的條件性感染和惡性腫瘤,最終導(dǎo)致死亡。截至2011年底,全球存活的艾滋病病毒感染者和病人3400萬(3140萬～3590萬),新發(fā)感染250萬人,艾滋病相關(guān)死亡170萬人；而2011年中國大陸估計(jì)艾滋病病毒感染者和艾滋病病人78萬人(62-94萬人),全國感染率為0.058%(0.046%-0.070%)。云南省毗鄰全球最大的毒品生產(chǎn)地——“金三角”地區(qū),特殊的地理位置使云南HIV的傳入和流行都比較早,而后經(jīng)過不同的毒品傳輸路線向我國其他省市擴(kuò)散。上世紀(jì)90年代云南省一度呈現(xiàn)了B'C/CRF01-AE共流行的態(tài)勢,經(jīng)過近20年的共同流行進(jìn)化,云南省又出現(xiàn)了眾多的獨(dú)特重組型。隨著我國西南地區(qū)對外開放和邊境貿(mào)易的發(fā)展,云南各出入境口岸地區(qū)頻繁跨境人員以及外籍常住人員不斷增加,研究現(xiàn)時(shí)段云南進(jìn)出口岸的HIV分子流行病學(xué)特點(diǎn),有助于了解我國的HIV傳播規(guī)律并預(yù)測將來的流行態(tài)勢,對后續(xù)的HIV預(yù)防以及疫苗的研制也具有重要意義。 本研究聯(lián)合運(yùn)用RT-Nested-PCR方法成功擴(kuò)增了204例HIV-1血清樣本,將gag-pol區(qū)段分為三段擴(kuò)增, gag、gag-prot、pro-RT,其擴(kuò)增長度分別為1155bp、885bp、1010bp,對三段擴(kuò)增測序得到的序列分別進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。本研究的204例樣品為來自云南各出入境口岸感染HIV的長途卡車駕駛員,均為男性,其中中國籍僅14例,其余均為緬甸籍。大部分來自瑞麗口岸(186/204,91.18%),其余各口岸零星分布,這些駕駛員以青壯年(20～40歲)為主(197/204,96.57%),其傳播途徑大多因不愿意透露而不詳。比較分型結(jié)果發(fā)現(xiàn),任何一段單獨(dú)的分型結(jié)果都存在一定的局限性,不能準(zhǔn)確確定其毒株序列,因此我們將三段進(jìn)行拼接得到長約2.6kb的gag-pol基因序列,再次進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,以確定毒株基因亞型。經(jīng)分析,204例樣品的基因亞型以CRF01-AE (123/204,60.29%)為主,C(35/204,17.16%)亞型、B(22/204,10.78%)亞型次之,CRF08-BC與CRF07-BC共有13例(6.38%),另外還發(fā)現(xiàn)了4例(1.96%)介于CRF08-BC與CRF07-BC之間的BC獨(dú)特性重組,以及7例(3.43%) CRF01-AE/C/B'構(gòu)成的CRF-01B重組。并用Beast軟件對主要基因亞型CRF01-AE、C、B進(jìn)行了起源進(jìn)化分析,確定其大致的起源時(shí)間為1983、1960、1975年。 HIV的高度變異性使得在其傳播過程中出現(xiàn)了許多亞型以及重組型,為進(jìn)一步確定本研究中發(fā)現(xiàn)的11例獨(dú)特重組型,研究其重組位點(diǎn)分布情況,我們運(yùn)用Simplot軟件對高度保守區(qū)的gag-pol2.6kb的基因序列進(jìn)行分析。獨(dú)特BC重組結(jié)構(gòu)與CRF08-BC和CRF07-BC結(jié)構(gòu)相似,均以C亞型為骨架,在不同的區(qū)段插入1-4段來自中國瑞麗的B’亞型基因片段。這4例毒株的重組斷點(diǎn)位置各不相同,毒株06022的斷點(diǎn)位置位于1205-1236nt,1590-1647nt,2444-2480nt處；060122在1183-1243nt,1697-2025nt,2344-2490nt,2721-2806nt位置處出現(xiàn)了4個(gè)可能的重組斷點(diǎn)；10028的相對重組斷點(diǎn)位于：1190-1250nt,2008-2208nt,2435-2811nt,2883-3048nt處；12122比較特殊,僅有一個(gè)重組斷點(diǎn)位置：2329-3063nt=CRF01-AE/B'構(gòu)成的O1B重組毒株10024、10115、11103結(jié)構(gòu)與CRF52-01B、CRF55-01B、CRF59-01B結(jié)構(gòu)很相近,以CRF01-AE為骨架分別在2532-3290nt,2609-3290nt、2509-3290nt位置處插入了B’亞型基因片段；CRF01-AE/C構(gòu)成的重組毒株08102、11064、11085、11103與以往發(fā)現(xiàn)的CRF01-AE/C重組結(jié)構(gòu)有所不同,但是08102與11103結(jié)構(gòu)相似,分別在2548-3021nt、2555-3019nt處插入了C片段；而毒株11064與11085結(jié)構(gòu)相似,C亞型基因片段分別出現(xiàn)在1725-2449nt與1730-2363nt處。 綜上所述,本研究建立了簡單而有效的測序分型方法,基于該方法我們對03～12年云南各口岸出入境駕駛員感染HIV人群進(jìn)行了系統(tǒng)分析,為以后HIV-1患者的藥物治療、預(yù)防控制措施的制定以及疫苗的研制提供了重要的分子流行病學(xué)資料。
【學(xué)位授予單位】：昆明理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：R512.91

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 張勛;王軍;;云南12個(gè)口岸出入境人員HIV感染的流行病學(xué)分析[J];中國國境衛(wèi)生檢疫雜志;2006年01期

2 梁躍波;李洪;李亞平;王春梅;張光彩;楊瑞清;王志堅(jiān);;瑞麗口岸出入境緬甸籍卡車司機(jī)中HIV新感染情況的調(diào)查[J];中國國境衛(wèi)生檢疫雜志;2007年02期

3 張光彩;梁躍波;李亞平;王春梅;張建生;張建春;侯中生;劉宇夫;高風(fēng);王志堅(jiān);;云南口岸1623例出入境人員HIV感染者分析[J];中國國境衛(wèi)生檢疫雜志;2007年06期

4 侯中生;;騰沖口岸2000～2006年出入境人員HIV感染情況分析[J];旅行醫(yī)學(xué)科學(xué);2008年02期

5 周衍衡;龐偉;鄭永唐;;云南省HIV-1分子流行病學(xué)研究進(jìn)展[J];皮膚病與性病;2010年01期

6 沈成利,吳昊;抗HIV治療的副作用(一)——核苷類及非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑[J];中國艾滋病性病;2005年03期

7 萬卓越;李杰;付笑冰;林萍;鄢心革;刁麗梅;;應(yīng)用HIV-1耐藥性基因型檢測廣東部分地區(qū)HIV耐藥株[J];中國艾滋病性病;2006年03期

8 尹春煜;盧洪洲;婁國強(qiáng);李曉鷗;蔣衛(wèi)民;胡越凱;張繼明;潘孝彰;翁心華;;中國部分地區(qū)應(yīng)用高效抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療HIV-1患者的耐藥性檢測[J];中華傳染病雜志;2006年03期

9 李韓平,李宏,楊坤,王哲,鮑作義,辛天義,莊道民,李敬云;河南省部分艾滋病患者抗病毒治療的臨床效果以及基因型耐藥性分析[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2005年03期

10 邢輝,梁浩,萬卓越,陳曦,魏民,馬鵬飛,關(guān)琪,全宇,洪坤學(xué),邵一鳴;中國CRF01-AE亞型人類免疫缺陷病毒毒株的分子流行病學(xué)研究[J];中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2004年05期

，

本文編號：2539162