一株達菲耐藥的甲型H1N1流感病毒全基因特征分析
本文選題:甲型HN流感病毒 切入點:達菲耐藥 出處:《中國微生態(tài)學雜志》2016年08期
【摘要】:目的分析1株甲型H1N1流感達菲耐藥病毒株的全基因特征,為指導流感臨床治療與防控提供依據(jù)。方法采用雞胚進行病毒分離,提取病毒RNA,通過RT-PCR擴增其全基因組8個基因片段,測定核苷酸序列,利用生物信息軟件拼接全基因組序列,繪制基因進化樹并分析重要基因位點變異情況。結果 A/Fuzhou/SWL11609/2013(H1N1)流感毒株的8個節(jié)段基因均處于2013-2014年度進化簇中,且與A/California/07/2009(H1N1)疫苗株高度同源,8個基因同源性均在97.4%以上;其HA和NA基因與A/Hubei-Wuchang/SWL1322/2013(H1N1)達菲耐藥株同源性最高,分別為100.0%和99.6%;初步判斷該毒株未發(fā)生重配現(xiàn)象,其重要致病性基因位點未發(fā)生變異;NA基因中具有H275Y典型達菲耐藥位點特征,缺失一個糖基化位點(N386K),降低了基因結構的穩(wěn)定性,同時在V241I和N369K的作用下降低了病毒的適應性。結論本次研究的甲型H1N1流感達菲耐藥病毒株表現(xiàn)為低致病性流感病毒特征,但具備較好的人傳人能力,需進一步加強監(jiān)測,謹防耐藥株的廣泛流行。
[Abstract]:Objective to analyze the genetic characteristics of 1 strains of influenza a H1N1 influenza Tamiflu resistant strains, provide the basis for clinical treatment and prevention of influenza. Methods the chicken virus was isolated, viral RNA extracted from the whole genome of 8 gene fragments amplified by RT-PCR, sequenced, using whole genome bioinformatics software splicing, phylogenetic the tree and analysis of important gene variation. The results of A/Fuzhou/SWL11609/2013 (H1N1) flu strain of 8 segments which are in the 2013-2014 year evolution of gene clusters, and A/California/07/2009 (H1N1) vaccine strains are highly homologous, 8 genes homology was more than 97.4%; the HA and NA gene and A/Hubei-Wuchang/SWL1322/2013 (H1N1) of Tamiflu resistant strains the highest homology were 100% and 99.6%; the preliminary judgment of reassortment happened on the virus, its important pathogenic gene loci did not mutate; NA H275Y has the typical characteristics of Tamiflu resistance loci gene, deletion of a glycosylation site (N386K), reduced the stability of gene structure, and lower the virus adaptability in V241I and N369K. The conclusion of the study of the H1N1 influenza virus strains showed Tamiflu resistant low pathogenic characteristics of influenza virus. But good person ability, need to further strengthen the monitoring, beware of popular drug resistant strains.
【作者單位】: 福建省疾病預防控制中心福建省人獸共患病研究重點實驗室;福建醫(yī)科大學公共衛(wèi)生學院;
【基金】:福建省自然科學基金(2015J01294) 福建省醫(yī)學創(chuàng)新課題(2014-CX-9)資助 福建省衛(wèi)生系統(tǒng)中青年骨干人才培養(yǎng)項目(2015-ZQN-ZD-10)
【分類號】:R511.7
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,本文編號:1728369
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