安徽省合肥市2000-2010年流行性腦脊髓膜炎流行病學(xué)和分子流行病學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2018-04-09 23:36
本文選題:流行性腦脊髓膜炎 切入點(diǎn):腦膜炎奈瑟菌 出處:《安徽醫(yī)科大學(xué)》2014年博士論文
【摘要】:1、目的 了解安徽省合肥市2000-2010年流行性腦脊髓膜炎(流腦)的流行病學(xué)特點(diǎn)、患者的臨床資料信息以及腦膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis, N. meningitidis)的耐藥性,為流腦的預(yù)防措施提供幫助。 采用MLST技術(shù)研究合肥市流腦患者體內(nèi)分離的50株N. meningitidis,基因型和克隆群,進(jìn)行分子流行病學(xué)分析,了解菌株間的遺傳進(jìn)化關(guān)系。 2、材料與方法 合肥市自建國(guó)初期建立了傳染病疫情報(bào)告制度,作為乙類(lèi)傳染病的流腦病例,2002年前納入在這個(gè)傳染病疫情報(bào)告系統(tǒng)內(nèi),2002年之后建立了流腦專(zhuān)病監(jiān)測(cè)系統(tǒng)。本研究的資料均依托上述的合肥市傳染病疫情報(bào)告系統(tǒng)收集的2000-2010年流腦的疫情報(bào)告。 根據(jù)上報(bào)匯總至合肥CDC的“流行性腦脊髓膜炎流行病學(xué)個(gè)案調(diào)查表”,收集每例患者的資料,包括流行病資料和臨床資料。其中,流行病學(xué)資料包括患者性別、年齡,發(fā)病季節(jié)等。根據(jù)流行病學(xué)資料統(tǒng)計(jì)2000-2010年每年總的年平均發(fā)病率,N. meningitidis的血清分型、以及A群和C群流腦病例的發(fā)病率,比較A群和C群流腦病例發(fā)病率的不同、年齡分別特點(diǎn)等。臨床資料包括患者的臨床表現(xiàn)、臨床分型、實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果,治療情況和轉(zhuǎn)歸。了解C群和A群病例的臨床主要特點(diǎn),比較這二組病例在臨床分型、細(xì)菌耐藥情況以及并發(fā)癥和后遺癥等方面的差異。 收集合肥市CDC和合肥市多家醫(yī)院于2010-2010年保存的N. meningitidis菌株,同時(shí)以1990-2000年的菌株作為對(duì)照,共50株。根據(jù)網(wǎng)站MLST(www.pubmlst.org)公布的N. mengingitidis MLST分型數(shù)據(jù)庫(kù),參考文獻(xiàn),擴(kuò)增abcZ、aroE、adK、fumC、gdh、pgm和pdhC等7個(gè)管家基因,擴(kuò)增產(chǎn)物雙向測(cè)序,測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比對(duì)、拼接后,擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果與MLST國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)中(www.mlst.net)保存的N. meningitidis序列BLAST比對(duì)后,獲得每株N. mengingitidis,的等位基因譜,在pubMLST國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)中BLAST實(shí)驗(yàn)菌株的ST結(jié)果,獲得50株N. meningitidis的序列型。下載pubMLST全球數(shù)據(jù)庫(kù)記載的N.meningitidis2株ST-5克隆系(ID:5406,6892),2株ST-4821克隆系(ID:6755,6890),2株ST-11克隆系(ID:2286,8050)的等位基因譜數(shù)據(jù)作為參考,應(yīng)用START軟件分析各管家基因譜特征,采用eBURST軟件進(jìn)行親緣關(guān)系分析。 3、結(jié)果 本研究觀察到,2000-2010年期間,合肥市出現(xiàn)了一次大的流腦疫情:2000-2010年11年期問(wèn),合肥市一共收到流腦報(bào)告病例845例,年平均發(fā)病率為4.15/10萬(wàn)。其中,2000-2002年3年間,合肥市流腦發(fā)病率維持在較低的水平,年發(fā)病率波動(dòng)在1.19/10萬(wàn)-1.57/10萬(wàn)間。2003年,年發(fā)病率為3.14/10萬(wàn),較2000-2002年段明顯升高。2004-2007年4年間,合肥市流腦發(fā)病人數(shù)明顯增多,年發(fā)病率波動(dòng)在6.92-8.43/10萬(wàn)之間。其中,2004年發(fā)病率為6.92/10萬(wàn),2005年發(fā)病率為8.43/10萬(wàn),2005年也是本研究期間發(fā)病率最高的年份。2006年發(fā)病率為7.24/10萬(wàn)。2007年則為7.08/10萬(wàn)。其后2008-2010年3年間,年平均年發(fā)病率為2.93/10萬(wàn),發(fā)病率較2004-2007年間前明顯下降,但仍然較2000-2002年的發(fā)病率升高約2.5倍。 2000-2010年11期間,A群流腦患者發(fā)病率比較穩(wěn)定,發(fā)病率一直保持在1/10萬(wàn)左右。即使在2004-2007年期間,總的流腦患者人數(shù)明顯增加的時(shí)候,由A群導(dǎo)致的的病例也沒(méi)有明顯升高。發(fā)生于合肥市2000-2010年期間流腦疫情系有C群菌株所致:自2003年開(kāi)始,C群流腦明顯增多,所占全部流腦患者比例升高達(dá)57%,發(fā)病率升至1.78/10萬(wàn),2004-2007年4年期間,C群流腦病例所占比例一直維持在所有病例80%以上,年發(fā)病率則波動(dòng)于5.57/10萬(wàn)-6.05/10萬(wàn)。2008-2010年,C群患者比例逐年下降,但仍然高達(dá)40%以上,明顯超過(guò)2003年及其以前的比例。述資料充分說(shuō)明:合肥市流腦流行菌株發(fā)生了變遷,即從A群轉(zhuǎn)變?yōu)镃群,C群是合肥市出現(xiàn)的流腦疫情流行的主要菌株。 C群患者年齡中位數(shù)和平均年齡分別為17.4歲(6月齡-78歲)和19歲,均高于A群患者的年齡中位數(shù)(6.9歲,2月齡-31歲)和平均年齡(2歲)(p0.05)。C群病例最常見(jiàn)的年齡段則為15-24歲,共251例患者(43.0%),該年齡段的發(fā)病率高達(dá)13.57/10萬(wàn),其次為5-14歲,共192例患者(32.9%)。A群病例分布的最常見(jiàn)的年齡段為1-4歲,共96例,占A群所有患者54.8%,該年齡段的發(fā)病率則高達(dá)6.16/10萬(wàn)。其次為5-14歲年齡段,共51例(24.5%)。上述資料說(shuō)明:與A群菌株更容易侵犯嬰幼兒和兒童不同,C群患者年齡分布主要集中于青少年和兒童。 無(wú)論是C群N. meningitidis還是A群N. meningitidis,對(duì)頭孢曲松、頭孢噻肟以及美羅培南等敏感度均超過(guò)90%。90.7%(88/97)的A群N. meningitidis對(duì)青霉素G敏感,說(shuō)明青霉素G對(duì)A群N. meningitidis的敏感率依然保持在較高水平。與之相反,C群N. meningitidis對(duì)青霉素的敏感率只有80.7%(213/264),統(tǒng)計(jì)學(xué)分析顯示C群和A群N. meningitidis對(duì)青霉素的藥敏結(jié)果比較具有統(tǒng)計(jì)學(xué)上的差異性(P=0.023)。同樣的現(xiàn)象也發(fā)生在磺胺類(lèi)藥物,A群N. meningitidis對(duì)復(fù)方新諾明依然高度敏感(91.9%),但是85.2%的C群N. meningitidis卻對(duì)復(fù)方新諾明耐藥(P0.001)。 具有完整臨床資料的C群患者和A群患者分別為84%(493/584)和85%(177/208)。C群患者中,普通型流腦114例(23.1%),而爆發(fā)性流腦比例為76.9%,而A群患者中,普通型和爆發(fā)性患者的比例分別是52%和48%(p0.001)。584例C群患者中,91例患者出現(xiàn)休克,占18.5%,明顯高于A群患者的7.3%(13/177)(p0.001)。C群和A群患者出現(xiàn)DIC的比例分別為12.2%(60/584)和4.0%(7/177)(p=0.002)。上述資料充分說(shuō)明,C群N.meningitidis致病性更強(qiáng),感染C群菌株的患者更加容易出現(xiàn)休克和DIC等嚴(yán)重并發(fā)癥。 共有655例患者,可以進(jìn)行后遺癥的比較,其中C群484例,A群171例。C群患者中,46例出現(xiàn)后遺癥,比例為9.5%(46/484),明顯高于A群患者3.5%(6/171)(p=0.013)。2000-2010年,共發(fā)生流腦死亡病例64人,病死率為7.6%,死亡病例中,85.9%(55/64)為C群流腦患者,其余的均為A群患者(9/171,5.3%),C群流腦患者的病死率為11.4%(55/484),明顯高于A群流腦患者的5.3%(9/171)。(p=0.021),說(shuō)明C群N. meningitidis致病性明顯強(qiáng)于A群,從而導(dǎo)致較高的病死率。單因素分析發(fā)現(xiàn),C群N. meningitidis感染、爆發(fā)性流腦、15-24歲年齡段是流腦死亡的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。多因素分析顯示:爆發(fā)性流腦、年齡是流腦死亡的危險(xiǎn)因素,C群N. meningitidis菌株感染則接近相關(guān)(OR=2.73:p=0.052)。 分離于我國(guó)合肥市的C群20株N. eningitidis共有10種STs,其中,ST-4821克隆群比例高達(dá)85%(17株),提示該克隆群在合肥市C群N. meningitidis為優(yōu)勢(shì)菌株,也提示C群N, meningitidis的基因型高度集中,C群20株N. eningitidis中沒(méi)有分離出其他國(guó)家主要流行的ST-41/44、ST-8、ST-11和ST-32高致病性克隆群。10株B群N. meningitidis中,5株B群菌株未能夠分群,其余5株B群菌株屬于ST-4821克隆群,提示合肥市B群菌株的基因型較分散,也說(shuō)明了我市B群菌株有ST-4821克隆化趨勢(shì)。合肥市1990-2010年的20株A群N. meningitidis中,ST-5克隆群比例高達(dá)70%(14株),表明ST-5克隆群在合肥市A群N. meningitidis為流行菌株。除了ST-5克隆群,A群菌株中尚有20%(5株)ST-7克隆群和10%(1株)ST-1克隆群,表明合肥市A群N. meningitidis中以ST-5克隆群為流行優(yōu)勢(shì)株,同時(shí)多克隆群并存的現(xiàn)象。 4、結(jié)論 1、2000-2010年期間,安徽省合肥市出現(xiàn)了流腦疫情,并且合肥市的流腦菌群發(fā)生了變遷,C群N. meningitidis取代了A群,成為該次疫情的主要流行株。 2、與A群流腦病例相比,C群菌株感染者病情更加危重,致殘率和死亡率高。所以需要特別重視C群感染者的臨床救治工作。 3、合肥市的ST-4821克隆群為C群N. meningitidis的優(yōu)勢(shì)菌株,C群N. meningitidis的基因型高度集中。B群ST-4821有克隆化趨勢(shì),而A群N. meningitidis中以ST-5克隆群為流行優(yōu)勢(shì)株,同時(shí)多克隆群并存的現(xiàn)象。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類(lèi)號(hào)】:R515.2
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1728692
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