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云南省2015年急性弛緩性麻痹病例腸道病毒分子生物學(xué)研究

發(fā)布時間:2018-03-26 20:28

  本文選題:急性弛緩性麻痹 切入點:腸道病毒 出處:《昆明醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文


【摘要】:[目的]1、掌握2015年云南省AFP病例流行病學(xué)特征,描述NPEV陽性病例三間分布情況;2、熟悉NPEV的基因特征分析原理、方法及步驟,了解其分子進化及基因重組情況;3、為NPEV引起的AFP病例的防控提供理論依據(jù);4、提供云南省NPEV研究的基礎(chǔ)資料。[方法]1、細胞培養(yǎng),L20B細胞及RD細胞的培養(yǎng),確保使用的細胞達到實驗室病毒分離的標(biāo)準(zhǔn)。對2015年云南省AFP監(jiān)測系統(tǒng)中的病例標(biāo)本按照相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范處理,提取便懸液采用細胞培養(yǎng)的方法進行病毒分離。2、對病毒分離陽性標(biāo)本提取核酸并進行VP1完整編碼區(qū)序列的擴增和測定。將獲取的VP1完整編碼區(qū)序列,在NCBI提供的BLAST程序搜索,利用MEGA5.0軟件對分離株及對應(yīng)原型株進行核苷酸和氨基酸序列比對,通過HEVs分子定型方法進行序列比對和型別鑒定。3、收集病例的基本信息,利用描述流行病學(xué)方法描述其分布特征。4、將鑒定出的EV71分離株與GenBank中其他國家和地區(qū)分離株,利用MEGA5.0軟件,對其VP1區(qū)核苷酸序列及其推導(dǎo)的氨基酸序列進行同源性比較;以鄰位法(Neighbor-joining Method)構(gòu)建VP1區(qū)系統(tǒng)發(fā)生樹,對分離株進行親緣進化分析。5、利用VP1區(qū)基因特征對CVB5分離株進行進一步分型研究。對一株EV71分離株進行全基因組序列測定,對其與原型株及其代表株基因組序列進行比對;使用Simplot3.5.1軟件,分析其在基因組中的重組情況。[結(jié)果]云南省2015年213例AFP病例流行病學(xué)特征與全國基本一致,AFP病例中共檢測到23株NPEV,7株為HEVA組,分離到的EV71均屬于C4亞型。14株為人類腸道病毒B組,分離到的CVB5均屬于D亞型,2株為人類腸道病毒C組,未分離到人類腸道病毒D組病毒及新型人類腸道病毒。AFP病例流行病學(xué)特征為:16個州(市)中15個州(市)有病例報告,僅迪慶州無病例。全年各周均有病例報告,未見明顯季節(jié)分布。男性135例,女性78例,男女性別比1.73:1。NPEV陽性病例的分布特征為:人群分布為男性12例,女性11例;地區(qū)分布為德宏5例,普洱3例,除大理及迪慶沒有外,其他州市均為1~2例;時間分布為4、5月份各有4例,6、7月份各有3例,4~7月占總病例數(shù)的60.9%,除2、9月份沒有以外其他月份均為1~2例。EV71分離株VP1區(qū)基因特征為6株EV71聚為一組,6株EV71與C4a亞型代表株最為接近;CVB5分離株VP1區(qū)基因特征為3株CVB5聚為一組,并且與代表株JN712675、KF751191等最為接近。本次CVB5分離株及其代表株可劃分為A、B、C、D四個基因型。2015年EV71分離株32-YN-2015與其他EV71代表株未發(fā)現(xiàn)基因重組情況,但在P2段的2A區(qū)CA4代表株High Point、P2段的2C區(qū)CA5代表株Swartz與32-YN-2015分離株以及P3段的3D區(qū)CA16代表株G-10同樣與32-YN-2015分離株存在基因重組事件。另外,在非編碼區(qū)5'UTR段,CA8代表株Donovan與32-YN-2015也存在基因重組情況。[結(jié)論]本研究發(fā)現(xiàn),2015年云南省AFP病例中NPEV以HEV A,B,C組為主,未分離到D組人類腸道病毒和新型人類腸道病毒。分析NPEV陽性病例分布特征可看出男女比例無明顯差異,大多數(shù)病例均在5歲及以下,病例主要分布在德宏及普洱兩個地區(qū),從分布時間上看,NPEV陽性病例主要分布在4~7月份。分離到的6株EV71屬于C4a亞型,而分離到的3株CVB5則屬于D亞型,與引起AM的山東分離株(JN712675)以及引起HFMD的安徽分離株(KF751191)有密切關(guān)系。EV71分離株32-YN-2015基因重組研究結(jié)果表明,病毒型內(nèi)未發(fā)現(xiàn)基因重組情況,但在型間,分離株32-YN-2015與CA4、CA5、CA8和CA16存在基因重組情況。
[Abstract]:Objective : To study the epidemiological characteristics of AFP cases in Yunnan province in 2015 and to describe the three distributions of NPEV positive cases . The results showed that there were 23 strains of EV71 and 7 strains of HEV . There were no cases in other cities except Dali and Dubai .

【學(xué)位授予單位】:昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R512.5

【參考文獻】

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本文編號:1669480

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