本文關鍵詞： 恙蟲病 恙蟲病東方體 秋冬型 流行病學特征 疫區(qū)擴散　出處：《山東大學》2014年博士論文　論文類型：學位論文

【摘要】：背景 恙蟲病是由恙蟲病東方體(Orientia tsutsugamushi, Ot)感染所致的一種自然疫源性疾病,廣泛流行于亞洲太平洋沿岸約1300萬平方公里的地區(qū),全球每年約10億人有感染恙蟲病的風險。鼠類是主要貯存宿主,恙螨為傳播媒介。我國屬于恙蟲病重點疫區(qū)之一。在我國,恙蟲病原僅在北緯31°以南的廣大地區(qū)流行,以夏季型為主。長江以北地區(qū)自1986年在山東首次發(fā)生流行以來,新疫區(qū)不斷形成和擴散,流行季節(jié)主要為秋冬季。病原體的遺傳變異、生態(tài)旅游的發(fā)展以及疾病流行強度和疾病負擔的低估,成為恙蟲病研究新的推動力。監(jiān)測恙蟲病流行特征的改變,探討該病疫區(qū)迅速擴散和疫情變化的特征和影響因素,對豐富恙蟲病的病原學、流行病學理論及該病的診斷和預防控制具有重要意義。 目的 本研究通過對秋冬型恙蟲病新、老疫區(qū)之間宿主動物和媒介的種屬構成和分布特點、Ot型特異性抗原編碼基因的變異特點和規(guī)律以及恙蟲病的人群流行和感染特征進行比較與分析,探討秋冬型恙蟲病疫區(qū)擴散的流行病學特征與機制,從而為恙蟲病的流行趨勢預測提供重要線索,為該病的預防控制和診斷治療提供科學依據。 材料與方法 自山東省秋冬型恙蟲病老疫區(qū)選取沂南縣、沂水縣,自新疫區(qū)選取新泰市、岱岳區(qū)、即墨市及膠南市為調查點。2010年9月至2012年3月,一年四季在各調查點捕獲宿主動物,采集宿主動物脾臟、肝臟和耳內寄生恙螨,對宿主動物和恙螨進行種屬鑒定并計數,計算宿主動物的帶螨率和帶螨指數。自動物脾(肝)臟和恙螨中提取基因組DNA,應用巢式PCR檢測標本中的Ot DNA,對56kDa型特異性抗原(type-specific antigen, TSA)編碼基因進行擴增并測序,與自Genbank中獲取的參考序列建立數據庫,采用Mega5.0軟件進行序列比對,以neighbor-joining(NJ)法Kimura2-parameter distance模型構建系統(tǒng)發(fā)生樹。采用Lasergene7.1軟件對Ot56kDa TSA核苷酸序列及其推導的氨基酸序列進行同源性分析。采用BEAST1.7.4軟件基于貝葉斯蒙特卡洛馬爾科夫鏈(Bayesian Markov Chain Monte Carlo, MCMC)算法對Ot56kDa TSA編碼序列進行進化遺傳學分析,對序列的進化速率、分化時間、最近共同祖先時間(the time to the most recent common ancestor, TMRCA)和分子鐘模型進行估計。計算宿主動物的Ot陽性率和恙螨的最小陽性率。對秋冬型恙蟲病新、老疫區(qū)宿主動物、媒介的種屬構成、Ot攜帶狀況以及Ot TSA編碼基因特征進行比較與分析。 根據山東省疾病報告信息系統(tǒng)(Shandong Disease Report Information System, SDRIS)2006-2013年山東省恙蟲病疫情數據,描述山東省恙蟲病的人群分布特征和季節(jié)分布特征。自2010年1月至2011年12月,采集恙蟲病病例急性期抗凝全血和自然脫落的焦痂標本,進行Ot DNA檢測、型特異性擴增和TSA編碼基因序列分析。2010年自調查點的監(jiān)測醫(yī)院選取恙蟲病確診病例進行感染特征的現(xiàn)況調查,對新、老疫區(qū)恙蟲病的臨床特征進行比較分析。采用Epidata3.1軟件建立數據庫,采用Excel和SPSS16.0軟件進行統(tǒng)計分析。 結果 1.宿主種屬構成及感染狀況 在恙蟲病新疫區(qū)捕獲小獸類1158只,包括褐家鼠(58.4%)、黑家鼠(16.3%)、小家鼠(24.2%)、黑線姬鼠(0.7%)、大倉鼠(0.2%)和，

本文編號：1495919