發(fā)布時(shí)間：2018-02-08 16:56

  本文關(guān)鍵詞： 恙蟲病 恙蟲病東方體 秋冬型 流行病學(xué)特征 疫區(qū)擴(kuò)散　出處：《山東大學(xué)》2014年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：背景 恙蟲病是由恙蟲病東方體(Orientia tsutsugamushi, Ot)感染所致的一種自然疫源性疾病,廣泛流行于亞洲太平洋沿岸約1300萬(wàn)平方公里的地區(qū),全球每年約10億人有感染恙蟲病的風(fēng)險(xiǎn)。鼠類是主要貯存宿主,恙螨為傳播媒介。我國(guó)屬于恙蟲病重點(diǎn)疫區(qū)之一。在我國(guó),恙蟲病原僅在北緯31°以南的廣大地區(qū)流行,以夏季型為主。長(zhǎng)江以北地區(qū)自1986年在山東首次發(fā)生流行以來(lái),新疫區(qū)不斷形成和擴(kuò)散,流行季節(jié)主要為秋冬季。病原體的遺傳變異、生態(tài)旅游的發(fā)展以及疾病流行強(qiáng)度和疾病負(fù)擔(dān)的低估,成為恙蟲病研究新的推動(dòng)力。監(jiān)測(cè)恙蟲病流行特征的改變,探討該病疫區(qū)迅速擴(kuò)散和疫情變化的特征和影響因素,對(duì)豐富恙蟲病的病原學(xué)、流行病學(xué)理論及該病的診斷和預(yù)防控制具有重要意義。 目的 本研究通過(guò)對(duì)秋冬型恙蟲病新、老疫區(qū)之間宿主動(dòng)物和媒介的種屬構(gòu)成和分布特點(diǎn)、Ot型特異性抗原編碼基因的變異特點(diǎn)和規(guī)律以及恙蟲病的人群流行和感染特征進(jìn)行比較與分析,探討秋冬型恙蟲病疫區(qū)擴(kuò)散的流行病學(xué)特征與機(jī)制,從而為恙蟲病的流行趨勢(shì)預(yù)測(cè)提供重要線索,為該病的預(yù)防控制和診斷治療提供科學(xué)依據(jù)。 材料與方法 自山東省秋冬型恙蟲病老疫區(qū)選取沂南縣、沂水縣,自新疫區(qū)選取新泰市、岱岳區(qū)、即墨市及膠南市為調(diào)查點(diǎn)。2010年9月至2012年3月,一年四季在各調(diào)查點(diǎn)捕獲宿主動(dòng)物,采集宿主動(dòng)物脾臟、肝臟和耳內(nèi)寄生恙螨,對(duì)宿主動(dòng)物和恙螨進(jìn)行種屬鑒定并計(jì)數(shù),計(jì)算宿主動(dòng)物的帶螨率和帶螨指數(shù)。自動(dòng)物脾(肝)臟和恙螨中提取基因組DNA,應(yīng)用巢式PCR檢測(cè)標(biāo)本中的Ot DNA,對(duì)56kDa型特異性抗原(type-specific antigen, TSA)編碼基因進(jìn)行擴(kuò)增并測(cè)序,與自Genbank中獲取的參考序列建立數(shù)據(jù)庫(kù),采用Mega5.0軟件進(jìn)行序列比對(duì),以neighbor-joining(NJ)法Kimura2-parameter distance模型構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)。采用Lasergene7.1軟件對(duì)Ot56kDa TSA核苷酸序列及其推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行同源性分析。采用BEAST1.7.4軟件基于貝葉斯蒙特卡洛馬爾科夫鏈(Bayesian Markov Chain Monte Carlo, MCMC)算法對(duì)Ot56kDa TSA編碼序列進(jìn)行進(jìn)化遺傳學(xué)分析,對(duì)序列的進(jìn)化速率、分化時(shí)間、最近共同祖先時(shí)間(the time to the most recent common ancestor, TMRCA)和分子鐘模型進(jìn)行估計(jì)。計(jì)算宿主動(dòng)物的Ot陽(yáng)性率和恙螨的最小陽(yáng)性率。對(duì)秋冬型恙蟲病新、老疫區(qū)宿主動(dòng)物、媒介的種屬構(gòu)成、Ot攜帶狀況以及Ot TSA編碼基因特征進(jìn)行比較與分析。 根據(jù)山東省疾病報(bào)告信息系統(tǒng)(Shandong Disease Report Information System, SDRIS)2006-2013年山東省恙蟲病疫情數(shù)據(jù),描述山東省恙蟲病的人群分布特征和季節(jié)分布特征。自2010年1月至2011年12月,采集恙蟲病病例急性期抗凝全血和自然脫落的焦痂標(biāo)本,進(jìn)行Ot DNA檢測(cè)、型特異性擴(kuò)增和TSA編碼基因序列分析。2010年自調(diào)查點(diǎn)的監(jiān)測(cè)醫(yī)院選取恙蟲病確診病例進(jìn)行感染特征的現(xiàn)況調(diào)查,對(duì)新、老疫區(qū)恙蟲病的臨床特征進(jìn)行比較分析。采用Epidata3.1軟件建立數(shù)據(jù)庫(kù),采用Excel和SPSS16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 結(jié)果 1.宿主種屬構(gòu)成及感染狀況 在恙蟲病新疫區(qū)捕獲小獸類1158只,包括褐家鼠(58.4%)、黑家鼠(16.3%)、小家鼠(24.2%)、黑線姬鼠(0.7%)、大倉(cāng)鼠(0.2%)和，

本文編號(hào)：1495919