白洗豬PID1基因克隆及序列分析
發(fā)布時(shí)間:2017-08-22 07:28
本文關(guān)鍵詞:白洗豬PID1基因克隆及序列分析
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【摘要】:本研究旨在對(duì)白洗豬磷酸酪氨酸互作結(jié)構(gòu)域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因進(jìn)行克隆和生物信息學(xué)分析。采用Nest PCR及T克隆技術(shù)對(duì)白洗豬PID1基因進(jìn)行克隆測(cè)序,運(yùn)用生物學(xué)分析軟件分析其結(jié)構(gòu)功能及其在種內(nèi)及種間的遺傳進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果表明,白洗豬PID1基因CDS區(qū)全長(zhǎng)654bp,編碼217個(gè)氨基酸,白洗豬與山東萊蕪豬、廣西陸川豬PID1蛋白氨基酸同源性為98.2%與97.7%;進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果表明白洗豬與兩個(gè)豬種間遺傳關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),種間比對(duì)黃牛、牦牛、獼猴、小鼠、眼鏡王蛇、人、原雞、非洲爪蟾、大鼠和斑馬魚(yú)PID1蛋白氨基酸同源性依次為96.6%、96.6%、96.3%、95.0%、93.9%、91.7%、90.8%、88.2%、69.7%和67.3%;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明PID1基因在多物種之間的進(jìn)化高度保守,結(jié)構(gòu)功能分析表明白洗豬PID1基因功能區(qū)主要是編碼鏈氨基酸C端的PTB結(jié)構(gòu)域。本研究成功克隆了白洗豬PID1基因,為探究其對(duì)白洗豬肌內(nèi)脂肪沉積方面的影響及為白洗豬種資源開(kāi)發(fā)利用奠定理論基礎(chǔ)。
【作者單位】: 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院高原山地動(dòng)物遺傳育種與繁殖省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室貴州省動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;貴州省畜牧獸醫(yī)學(xué)校;
【關(guān)鍵詞】: 白洗豬 肉質(zhì) 肌內(nèi)脂肪 PID基因 克隆 PTB
【基金】:貴州省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項(xiàng)目(黔科合NY[2013]3071號(hào));貴州省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項(xiàng)目(黔科合NY[2015]3008-1號(hào))
【分類號(hào)】:S828.2
【正文快照】: 白洗豬是貴州省東南部一個(gè)優(yōu)質(zhì)地方豬種[1]。貴州白洗豬選育與產(chǎn)業(yè)化示范課題組研究發(fā)現(xiàn),白洗豬不含氟烷基因[2],肌肉肌內(nèi)脂肪(intramuscular fat,IMF)為3.63%±0.91%,粗蛋白質(zhì)為21.86%±1.62%,大理石紋為3.74±0.36,剪切力為2.74kg±0.17kg,必需氨基酸占總氨基酸含量的38.27%
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條
1 楊倫;徐正剛;王慧;陳其美;陳偉;胡艷霞;石元;祝洪磊;曾勇慶;;RNA干擾沉默PID1基因在C2C12細(xì)胞中表達(dá)的研究[J];山東大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版);2013年01期
2 ;[J];;年期
,本文編號(hào):717834
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