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果生刺盤孢菌轉(zhuǎn)錄組分析及致病基因的挖掘

發(fā)布時間:2024-04-28 05:13
  油茶(Camellia oleifera)是我國重要的木本食用油料樹種,炭疽病是油茶最主要的病害之一,而果生刺盤孢菌(Colletotrichum fructicola)是該病的優(yōu)勢致病菌。本研究對海南五指山和湖南邵陽的果生刺盤孢菌種群進(jìn)行了生物學(xué)特性和致病力比較,并應(yīng)用RNA-seq技術(shù)分別對兩個種群的代表菌株侵染油茶前后的基因表達(dá)情況進(jìn)行分析,旨在從分子水平上明確兩個地理種群在侵染后期的代謝過程及其調(diào)控基因的異同,有助于理解果生刺盤孢菌的進(jìn)化機制和致病機制。研究結(jié)果如下:(1)生物學(xué)特性和菌絲侵染試驗結(jié)果表明,兩個地理種群的菌絲生長速率、產(chǎn)孢量和接種油茶嫩葉96h后產(chǎn)生的病斑數(shù)量均無明顯差異,但是五指山種群造成的平均病斑直徑更大。同一種群內(nèi)不同菌株間的致病力差異較大,選取各自種群中致病力最強且穩(wěn)定的菌株作為轉(zhuǎn)錄組測序用的供試菌株。(2)分別對兩個地理種群代表菌株的分生孢子樣品和侵染油茶葉96h后的病斑樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。孢子組和侵染組樣品的clean data平均數(shù)據(jù)量分別為60M和84M,比對到參考基因組的reads平均數(shù)據(jù)量分別為53M和17M。邵陽代表菌株篩選出侵染前后差異表...

【文章頁數(shù)】:71 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2.1邵陽和五指山的果生刺盤孢菌的生長速率與產(chǎn)孢量比較??A:邵陽和五指山果生刺盤孢菌的生長速率;B:邵陽和五指山果生刺盤孢菌的產(chǎn)孢量??

圖2.1邵陽和五指山的果生刺盤孢菌的生長速率與產(chǎn)孢量比較??A:邵陽和五指山果生刺盤孢菌的生長速率;B:邵陽和五指山果生刺盤孢菌的產(chǎn)孢量??

中南林業(yè)科技大學(xué)碩士學(xué)位論文?果生刺盤孢菌轉(zhuǎn)錄組分析及致病基因的挖掘??2.3.2兩個種群的菌落生長速率和產(chǎn)孢量比較??為了比較湖南邵陽和海南五指山的果生刺盤孢菌種群的營養(yǎng)生長是否有差異,將??兩個種群的菌株均接種于PDA平板上培養(yǎng)4d,每個菌株3個重復(fù)。結(jié)果顯示,邵陽??種群的....


圖2.2邵陽和五指山果生刺盤孢菌種群對油茶葉片的致病力??A:邵陽和五指山果生刺盤孢菌在油茶葉片上產(chǎn)生的病斑直徑;B:邵陽和五指山果生刺盤孢菌??

圖2.2邵陽和五指山果生刺盤孢菌種群對油茶葉片的致病力??A:邵陽和五指山果生刺盤孢菌在油茶葉片上產(chǎn)生的病斑直徑;B:邵陽和五指山果生刺盤孢菌??

中南林業(yè)科技大學(xué)碩士學(xué)位論文?果生刺盤孢菌轉(zhuǎn)錄組分析及致病基因的挖掘??統(tǒng)計侵染96h時病斑的直徑,結(jié)果如圖2.2所示,邵陽種群的病斑平均直徑為0.37cm,??五指山種群的病斑平均直徑為0.56cm;同一種群內(nèi)病斑大小差異較大,邵陽種群和??五指山種群的病斑大小方差分別為0.2....


圖2.4邵陽果生刺盤孢菌致病力比較??Fig.2.4?Pathogenicity?of?4?C.fructicola?strains?from?Shaoyang??

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圖2.3五指山果生刺盤孢菌致病力比較??Fig.2.3?Pathogenicity?of?7?C.fructicola?strains?from?Wuzhishan??

圖2.3五指山果生刺盤孢菌致病力比較??Fig.2.3?Pathogenicity?of?7?C.fructicola?strains?from?Wuzhishan??

中南林業(yè)科技大學(xué)碩士學(xué)位論文?果生刺盤孢菌轉(zhuǎn)錄組分析及致病基因的挖掘??為0.45cm的病斑。4個邵陽來源的果生刺盤孢菌株的致病力差異較大,病斑直徑離??散程度S值為0.21,其中SY0104b菌株的致病力最為顯著,而SY0201a的致病力最??弱。??為避免菌株個體差異,選取各....



本文編號:3966217

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