本研究以愈傷誘導(dǎo)培養(yǎng)基(CIM)誘導(dǎo)24 h的水稻(Oryza sativa)主根為材料,利用高通量轉(zhuǎn)錄組測序(RNAseq)技術(shù)進(jìn)行主根根尖和側(cè)根區(qū)的基因差異表達(dá)分析。通過對生長素信號相關(guān)基因家族進(jìn)行聚類和差異表達(dá)分析后發(fā)現(xiàn):生長素受體基因OsTIR/AFBs及其同源基因在根尖和側(cè)根區(qū)組織的愈傷誘導(dǎo)過程中均無明顯的差異表達(dá);系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系接近的OsIAA20、OsIAA9等10個OsIAA基因在根尖和側(cè)根區(qū)均增強(qiáng)表達(dá);而另一組進(jìn)化關(guān)系相鄰的Os IAA11和Os IAA13基因在根尖和側(cè)根區(qū)表現(xiàn)出相反的差異表達(dá)模式。相比而言, Os ARFs家族基因在根尖和側(cè)根區(qū)中對生長素誘導(dǎo)的表達(dá)變化具有明顯的差異性。本研究分析了在根尖和側(cè)根區(qū)組織生長素信號相關(guān)家族基因差異表達(dá)的異同,擬為根愈傷組織誘導(dǎo)中生長素響應(yīng)的組織特異性研究提供新參考。

【文章頁數(shù)】：11 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)材料
    1.2 水稻主根的獲得及其愈傷組織誘導(dǎo)
    1.3 轉(zhuǎn)錄組cDNA文庫構(gòu)建和測序
    1.4 RNA-seq數(shù)據(jù)分析
    1.5 構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    2.1 差異表達(dá)基因的功能注釋與分類
    2.2 差異表達(dá)基因的KEGG分析
    2.3 生長素信號通路相關(guān)基因的差異表達(dá)分析
    2.4 生長素生物合成和代謝相關(guān)基因表達(dá)分析
    2.5 生長素運(yùn)輸載體基因表達(dá)分析
3 討論



本文編號：3808104