小麥蛋白激酶基因TaSnRK2.3/4單核苷酸多態(tài)性及其與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-05-05 18:23
小麥(Triticum aestivum L.)是世界上種植面積最廣的糧食作物,其生產(chǎn)與人類糧食安全密切相關(guān)。然而干旱、極端溫度等逆境條件嚴(yán)重制約了小麥的生產(chǎn)。蛋白質(zhì)的可逆磷酸化是植物在逆境下體內(nèi)能量代謝和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的重要途徑,受蛋白激酶和蛋白磷酸酶共同調(diào)節(jié)。蔗糖非發(fā)酵相關(guān)蛋白激酶(sucrose non-fermenting 1-related protein kinase,Sn RK)是一類絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,其中Sn RK2參與多種逆境信號(hào)的轉(zhuǎn)導(dǎo),在植物抗逆、根系發(fā)育等方面起關(guān)鍵作用。從農(nóng)作物種質(zhì)資源中發(fā)掘Sn RK2優(yōu)異等位基因,為種質(zhì)創(chuàng)新和分子育種提供基因和功能標(biāo)記,在小麥育種過(guò)程中具有十分重要的作用。本研究分析了小麥TaSnRK2.3和TaSnRK2.4的序列多態(tài)性,根據(jù)變異位點(diǎn)開(kāi)發(fā)功能標(biāo)記,探討TaSnRK2.3和TaSnRK2.4與小麥農(nóng)藝性狀的相關(guān)性,發(fā)掘優(yōu)異單倍型。主要研究結(jié)果如下:(1)以強(qiáng)抗旱品種旱選10號(hào)為材料克隆了TaSnRK2.3s基因,基于變異位點(diǎn)開(kāi)發(fā)了功能標(biāo)記。根據(jù)基因組來(lái)源,TaSnRK2.3位于A、B和D基因組的編碼區(qū)序列分別命名為TaSnRK2...
【文章頁(yè)數(shù)】:113 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
英文摘要
1 前言
1.1 研究目的和意義
1.2 文獻(xiàn)綜述
1.2.1 非生物逆境對(duì)小麥生產(chǎn)的影響
1.2.2 SnRK的研究進(jìn)展
1.2.3 關(guān)聯(lián)分析在主要農(nóng)作物中的應(yīng)用
1.2.4 單核苷酸多態(tài)性的應(yīng)用
1.3 主要研究?jī)?nèi)容
1.3.1 TaSnRK2.3/4 編碼區(qū)基因組序列克隆
1.3.2 TaSnRK2.3/4 序列多態(tài)性檢測(cè)及功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
1.3.3 TaSnRK2.3/4 與農(nóng)藝性狀的相關(guān)性
1.3.4 TaSnRK2.3/4 單倍型的地理分布
1.3.5 TaSnRK2.3/4 單倍型的年代分布
1.3.6 TaSnRK2.3-1B表達(dá)量分析
1.3.7 TaSnRK2.3-1B啟動(dòng)子的克隆和分析
1.4 技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料與試劑
2.1.1 植物材料
2.1.2 試驗(yàn)試劑和引物
2.1.3 載體和菌株
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.2.2 小麥莖稈可溶性糖含量的測(cè)定
2.2.3 基因組DNA提取
2.2.4 總RNA提取
2.2.5 RNA反轉(zhuǎn)錄
2.2.6 TaSnRK2.3-1B的表達(dá)量檢測(cè)
2.2.7 TaSnRK2.3 編碼區(qū)基因組序列的克隆
2.2.8 TaSnRK2.4 編碼區(qū)基因組序列的克隆
2.2.9 TaSnRK2.3-1A/1B的功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
2.2.10 TaSnRK2.4-3A的功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
2.2.11 TaSnRK2.3-1B啟動(dòng)子序列的克隆和分析
2.3 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 TaSnRK2.3 基因多態(tài)性及與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.1.1 TaSnRK2.3 編碼區(qū)基因組序列的克隆
3.1.2 TaSnRK2.3 多態(tài)性及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.1.3 TaSnRK2.3-1A與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.1.4 TaSnRK2.3-1B與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.1.5 TaSnRK2.3-1A/1B單倍型在我國(guó)十大麥區(qū)的地理分布
3.1.6 TaSn RK2.3-1A/1B優(yōu)異單倍型在不同年代品種中的頻率分布
3.1.7 TaSnRK2.3-1B表達(dá)量分析
3.1.8 TaSnRK2.3-1B單倍型啟動(dòng)子的克隆和分析
3.2 TaSnRK2.4 基因多態(tài)性及與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 TaSnRK2.4 編碼區(qū)基因組序列的克隆
3.2.2 TaSnRK2.4 染色體定位
3.2.3 TaSnRK2.4-3A多態(tài)性及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.2.4 TaSnRK2.4-3A與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2.5 TaSnRK2.4-3A單倍型在我國(guó)十大麥區(qū)的地理分布
3.2.6 TaSnRK2.4-3A優(yōu)異單倍型在不同年代品種中的頻率分布
4 討論
4.1 TaSnRK2.3-1A和TaSn RK2.3-1B與株高、千粒重等關(guān)聯(lián)
4.2 TaSnRK2.3-1B與株高關(guān)聯(lián)得到了驗(yàn)證
4.3 Sn RK2亞家族基因可能參與糖代謝
4.4 TaSnRK2.3-1B啟動(dòng)子序列中的逆境響應(yīng)順式作用元件
4.5 TaSnRK2.3-1B的未知功能
4.6 功能標(biāo)記的優(yōu)越性
4.7 單倍型具有較高的基因型分辨率
4.8 下一步研究計(jì)劃
4.8.1 TaSnRK2.3-1B的啟動(dòng)子活性研究
4.8.2 TaSnRK2.4-3B和TaSnRK2.4-3D與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點(diǎn)
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號(hào):3808157
【文章頁(yè)數(shù)】:113 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
英文摘要
1 前言
1.1 研究目的和意義
1.2 文獻(xiàn)綜述
1.2.1 非生物逆境對(duì)小麥生產(chǎn)的影響
1.2.2 SnRK的研究進(jìn)展
1.2.3 關(guān)聯(lián)分析在主要農(nóng)作物中的應(yīng)用
1.2.4 單核苷酸多態(tài)性的應(yīng)用
1.3 主要研究?jī)?nèi)容
1.3.1 TaSnRK2.3/4 編碼區(qū)基因組序列克隆
1.3.2 TaSnRK2.3/4 序列多態(tài)性檢測(cè)及功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
1.3.3 TaSnRK2.3/4 與農(nóng)藝性狀的相關(guān)性
1.3.4 TaSnRK2.3/4 單倍型的地理分布
1.3.5 TaSnRK2.3/4 單倍型的年代分布
1.3.6 TaSnRK2.3-1B表達(dá)量分析
1.3.7 TaSnRK2.3-1B啟動(dòng)子的克隆和分析
1.4 技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料與試劑
2.1.1 植物材料
2.1.2 試驗(yàn)試劑和引物
2.1.3 載體和菌株
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
2.2.2 小麥莖稈可溶性糖含量的測(cè)定
2.2.3 基因組DNA提取
2.2.4 總RNA提取
2.2.5 RNA反轉(zhuǎn)錄
2.2.6 TaSnRK2.3-1B的表達(dá)量檢測(cè)
2.2.7 TaSnRK2.3 編碼區(qū)基因組序列的克隆
2.2.8 TaSnRK2.4 編碼區(qū)基因組序列的克隆
2.2.9 TaSnRK2.3-1A/1B的功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
2.2.10 TaSnRK2.4-3A的功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
2.2.11 TaSnRK2.3-1B啟動(dòng)子序列的克隆和分析
2.3 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 TaSnRK2.3 基因多態(tài)性及與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.1.1 TaSnRK2.3 編碼區(qū)基因組序列的克隆
3.1.2 TaSnRK2.3 多態(tài)性及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.1.3 TaSnRK2.3-1A與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.1.4 TaSnRK2.3-1B與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.1.5 TaSnRK2.3-1A/1B單倍型在我國(guó)十大麥區(qū)的地理分布
3.1.6 TaSn RK2.3-1A/1B優(yōu)異單倍型在不同年代品種中的頻率分布
3.1.7 TaSnRK2.3-1B表達(dá)量分析
3.1.8 TaSnRK2.3-1B單倍型啟動(dòng)子的克隆和分析
3.2 TaSnRK2.4 基因多態(tài)性及與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 TaSnRK2.4 編碼區(qū)基因組序列的克隆
3.2.2 TaSnRK2.4 染色體定位
3.2.3 TaSnRK2.4-3A多態(tài)性及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.2.4 TaSnRK2.4-3A與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2.5 TaSnRK2.4-3A單倍型在我國(guó)十大麥區(qū)的地理分布
3.2.6 TaSnRK2.4-3A優(yōu)異單倍型在不同年代品種中的頻率分布
4 討論
4.1 TaSnRK2.3-1A和TaSn RK2.3-1B與株高、千粒重等關(guān)聯(lián)
4.2 TaSnRK2.3-1B與株高關(guān)聯(lián)得到了驗(yàn)證
4.3 Sn RK2亞家族基因可能參與糖代謝
4.4 TaSnRK2.3-1B啟動(dòng)子序列中的逆境響應(yīng)順式作用元件
4.5 TaSnRK2.3-1B的未知功能
4.6 功能標(biāo)記的優(yōu)越性
4.7 單倍型具有較高的基因型分辨率
4.8 下一步研究計(jì)劃
4.8.1 TaSnRK2.3-1B的啟動(dòng)子活性研究
4.8.2 TaSnRK2.4-3B和TaSnRK2.4-3D與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點(diǎn)
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號(hào):3808157
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