紅蓋鱗毛蕨花青素合成關(guān)鍵酶DFR的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-03 04:18
蕨類植物是一類通過(guò)孢子繁殖的維管束植物,它的進(jìn)化地位位于苔蘚植物和種子植物之間。根據(jù)報(bào)道蕨類植物富含黃酮類化合物,其總黃酮含量的平均值高于苔蘚植物和種子植物,但在蕨類植物中關(guān)于黃酮類化合物重要類群的花青素類化合物的研究卻很少;ㄇ嗨仡惢衔锊粌H是重要的植物色素,還具有保護(hù)植物免受多種生物和非生物因素脅迫的功能,能夠清除自由基,減少光損傷,保護(hù)植物光合作用的順利進(jìn)行。一些蕨類植物的葉片呈現(xiàn)出深紅色,這些色素類物質(zhì)是否為花青素類化合物此前并沒有報(bào)道。由于大多數(shù)蕨類植物的染色體數(shù)目多,已建立的可參考基因組較少等原因,目前對(duì)蕨類植物功能基因的研究還很少。盡管顯花植物花青素合成途徑及其分子機(jī)制研究已有一定基礎(chǔ),但在蕨類植物中的花青素類化合物合成過(guò)程還有很多不清楚的地方。尤其是參與花青素類化合物和原花青素合成的關(guān)鍵酶二氫黃酮醇4-還原酶(Dihydroflavonol 4-reductase,DFR),此前未有它在孢子植物中的功能報(bào)道。為了探討蕨類植物中的花青素類化合物的成分以及其合成過(guò)程,本研究首先對(duì)44種蕨類的花青素含量和種類進(jìn)行檢測(cè),分析花青素在蕨類中的分布情況。根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果選擇紅蓋鱗毛蕨(...
【文章來(lái)源】:華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:145 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖3-1蕨類植物花青素提取物的液相色譜圖??Fig.?3-1?HPLC?chromatograms?of?anthocyanidin?extract?from?ferns??(A)花青素標(biāo)準(zhǔn)品的色譜圖
圖4-1紅蓋鱗毛蕨的拳卷葉??Fig.4-1?Rolled?immature?fronds?of?Dryopteris?erythrosora??
?第四章紅蓋鱗毛跋的轉(zhuǎn)錄組分析???4.1轉(zhuǎn)錄組的質(zhì)置控制??瓊脂糖凝膠電泳和Agilent?2100?Bioanalyzer的檢測(cè)結(jié)果顯示提取的紅蓋鱗毛??蕨拳卷葉的總RNA質(zhì)量高,符合轉(zhuǎn)錄測(cè)序要求(圖4-2)。質(zhì)檢報(bào)告顯示提取的??總?RNA?濃度為?1561?ng/ul,260/280?為?2.09,260/230?為?2.01,RNA?完整性指數(shù)??(RIN)為9.5,28srRNA和18srRNA條帶清晰且無(wú)降解,28s/18s為1.8,可以甩??于后續(xù)RNA-seq文:庫(kù)的構(gòu)建。??A?B??B[FU]」,?,??i?I??200-?|??100-?I??0-?-1-1?….?1_??I?I?I?I?I ̄? ̄I?■??25?200?1000?4000?[nt]??圖4-2紅蓋鱗毛蕨的RNA完整性檢測(cè)??Fig.?4-2?The?RNA?integrity?analysis?of?D.?erythrosora??(A)總RNA的瓊脂糖凝膠電泳圖;(B)?Agilent?2100的檢測(cè)結(jié)果。??4.2轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析??4.2.1序列分析,組裝和注釋??通過(guò)Illumina?HiSeq?2000平臺(tái)對(duì)紅蓋鱗毛蕨拳卷葉轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,過(guò)濾后共獲??得8,504,366,760坩的產(chǎn)出數(shù)據(jù),£:^11此&£15為94,492,964,〇20即過(guò)濾后質(zhì)量不??低于20的堿基的比例為97.88%,GC含暈為46.89%?(表4-1)。通過(guò)短reads組??裝軟件Trinity拼接數(shù)據(jù),共獲得143,604個(gè)Unigenes,平均長(zhǎng)度為914bp,N50??為1875?bp。紅蓋鱗毛蕨組
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Cloning and characterization of a potato StAN11 gene involved in anthocyanin biosynthesis regulation[J]. Wang Li,Bing Wang,Man Wang,Min Chen,Jing-Ming Yin,Ghullam Murtaza Kaleri,Rui-Jie Zhang,Tie-Niu Zuo,Xiong You,Qing Yang. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(04)
[2]井岡山自然保護(hù)區(qū)蕨類植物資源[J]. 肖宜安,何平,李曉紅,時(shí)明芝,胡文海. 植物研究. 2004(01)
博士論文
[1]蕨類植物抱石蓮的化學(xué)成分及抗氧化活性研究[D]. 張麗媛.廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2015
碩士論文
[1]紅蓋鱗毛蕨查爾酮異構(gòu)酶(DeCHI)基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 付秋爽.上海師范大學(xué) 2017
[2]紅蓋鱗毛蕨查爾酮合成酶基因的克隆與功能分析[D]. 謝穎華.上海師范大學(xué) 2014
本文編號(hào):3565554
【文章來(lái)源】:華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:145 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖3-1蕨類植物花青素提取物的液相色譜圖??Fig.?3-1?HPLC?chromatograms?of?anthocyanidin?extract?from?ferns??(A)花青素標(biāo)準(zhǔn)品的色譜圖
圖4-1紅蓋鱗毛蕨的拳卷葉??Fig.4-1?Rolled?immature?fronds?of?Dryopteris?erythrosora??
?第四章紅蓋鱗毛跋的轉(zhuǎn)錄組分析???4.1轉(zhuǎn)錄組的質(zhì)置控制??瓊脂糖凝膠電泳和Agilent?2100?Bioanalyzer的檢測(cè)結(jié)果顯示提取的紅蓋鱗毛??蕨拳卷葉的總RNA質(zhì)量高,符合轉(zhuǎn)錄測(cè)序要求(圖4-2)。質(zhì)檢報(bào)告顯示提取的??總?RNA?濃度為?1561?ng/ul,260/280?為?2.09,260/230?為?2.01,RNA?完整性指數(shù)??(RIN)為9.5,28srRNA和18srRNA條帶清晰且無(wú)降解,28s/18s為1.8,可以甩??于后續(xù)RNA-seq文:庫(kù)的構(gòu)建。??A?B??B[FU]」,?,??i?I??200-?|??100-?I??0-?-1-1?….?1_??I?I?I?I?I ̄? ̄I?■??25?200?1000?4000?[nt]??圖4-2紅蓋鱗毛蕨的RNA完整性檢測(cè)??Fig.?4-2?The?RNA?integrity?analysis?of?D.?erythrosora??(A)總RNA的瓊脂糖凝膠電泳圖;(B)?Agilent?2100的檢測(cè)結(jié)果。??4.2轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析??4.2.1序列分析,組裝和注釋??通過(guò)Illumina?HiSeq?2000平臺(tái)對(duì)紅蓋鱗毛蕨拳卷葉轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,過(guò)濾后共獲??得8,504,366,760坩的產(chǎn)出數(shù)據(jù),£:^11此&£15為94,492,964,〇20即過(guò)濾后質(zhì)量不??低于20的堿基的比例為97.88%,GC含暈為46.89%?(表4-1)。通過(guò)短reads組??裝軟件Trinity拼接數(shù)據(jù),共獲得143,604個(gè)Unigenes,平均長(zhǎng)度為914bp,N50??為1875?bp。紅蓋鱗毛蕨組
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Cloning and characterization of a potato StAN11 gene involved in anthocyanin biosynthesis regulation[J]. Wang Li,Bing Wang,Man Wang,Min Chen,Jing-Ming Yin,Ghullam Murtaza Kaleri,Rui-Jie Zhang,Tie-Niu Zuo,Xiong You,Qing Yang. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(04)
[2]井岡山自然保護(hù)區(qū)蕨類植物資源[J]. 肖宜安,何平,李曉紅,時(shí)明芝,胡文海. 植物研究. 2004(01)
博士論文
[1]蕨類植物抱石蓮的化學(xué)成分及抗氧化活性研究[D]. 張麗媛.廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2015
碩士論文
[1]紅蓋鱗毛蕨查爾酮異構(gòu)酶(DeCHI)基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 付秋爽.上海師范大學(xué) 2017
[2]紅蓋鱗毛蕨查爾酮合成酶基因的克隆與功能分析[D]. 謝穎華.上海師范大學(xué) 2014
本文編號(hào):3565554
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