鈣黏素家族中與肺腺癌預(yù)后相關(guān)的差異表達(dá)基因的研究
發(fā)布時間:2021-11-15 16:10
研究背景及目的肺癌是近年來世界范圍內(nèi)發(fā)病率不斷上升,死亡率居高不下的惡性腫瘤,其病理分型有許多種,而肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)是其中發(fā)病率最高的一種,且在所有肺癌死亡病人占有較高的比例。目前靶向治療已廣泛應(yīng)用于肺腺癌的治療,并且針對部分病人已經(jīng)取得了顯著的療效,但由于靶向治療的局限性如耐藥性的產(chǎn)生等嚴(yán)重影響了現(xiàn)有靶向藥物的治療效果,更多影響肺腺癌發(fā)生和預(yù)后的潛在治療靶位基因需要我們?nèi)グl(fā)現(xiàn)。許多研究已經(jīng)證實鈣黏素家族中某些基因表達(dá)的改變對許多腫瘤的生成有著深刻的影響,但其與肺腺癌的關(guān)系至今仍沒有研究和闡明。研究方法本文通過應(yīng)用一系列生物信息學(xué)相關(guān)的分析方法,力求找出鈣黏素家族中基因差異表達(dá)與肺腺癌之間的關(guān)系。首先使用腫瘤基因圖譜數(shù)據(jù)庫(TheCancer Genome Atlas,TCGA)和基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus,GEO)找出鈣黏素家族在肺腺癌和正常組織中表達(dá)有差異的基因。接著應(yīng)用Kaplan-Meier Plotter數(shù)據(jù)庫找出這些差異表達(dá)基因當(dāng)中與預(yù)后相關(guān)的基因,并且這種差異表達(dá)將進(jìn)一步使用山東大學(xué)附屬省立...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?.從TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫中得到的鈣黏素超家族差異表達(dá)基因
圖2.?A.?Kaplan-Meier?Plotter證實6個差異表達(dá)基因與預(yù)后相關(guān),這6個基因包??括?CDH3,CDH5,??
圖3.?methHC分析6個臺異表達(dá)基因的甲基化水平以及甲基化與其表達(dá)間的相關(guān)??性
本文編號:3497103
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?.從TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫中得到的鈣黏素超家族差異表達(dá)基因
圖2.?A.?Kaplan-Meier?Plotter證實6個差異表達(dá)基因與預(yù)后相關(guān),這6個基因包??括?CDH3,CDH5,??
圖3.?methHC分析6個臺異表達(dá)基因的甲基化水平以及甲基化與其表達(dá)間的相關(guān)??性
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