細(xì)葉百合轉(zhuǎn)錄組分析及LpPEX5、LpPEX7基因功能的初步探究
發(fā)布時間:2021-11-14 07:32
近年來,土壤鹽堿化越來越嚴(yán)重,僅本國的鹽堿地面積就有9913萬公頃。在東北的鹽堿土壤中,只有少數(shù)幾種百合可以生長,細(xì)葉百合就是其中之一。PEX家族的基因是植物中參與過氧化物酶體合成的重要基因,PEX家族的基因過表達(dá)將增加過氧化物酶體的數(shù)量,而過氧化物酶體中的各種酶對減輕鹽堿脅迫帶來的損傷至關(guān)重要。對20 mM NaHCO3處理后的細(xì)葉百合轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序,對轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果分析后找出了與鹽堿關(guān)系較大的基因,并以此轉(zhuǎn)錄組序列為基礎(chǔ)設(shè)計引物,以細(xì)葉百合鱗莖的cDNA為模板,克隆分別得到LpPEX5、LpPEX7基因序列,進(jìn)行生物信息學(xué)分析,通過實時熒光定量PCR分析基因的表達(dá)模式。并成功構(gòu)建了 PBI121-LpPEX7和pMCP1-LpPEX5植物表達(dá)載體,通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化到擬南芥中,對LpPEX5 OE、LpPEX7 OE基因的擬南芥進(jìn)一步進(jìn)行了抗逆性分析。同時構(gòu)建了 pQE-LpPEX5和pGEX-LpPEX7蛋白表達(dá)載體并成功純化蛋白,從而為LpPEX5、LpPEX7基因的進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。具體研究結(jié)果如下:1.通過對細(xì)葉百合鱗莖進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得23.4Gb的數(shù)據(jù),通過組裝...
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]PEX5參與調(diào)控擬南芥根系抗逆性的初步研究[J]. 詹爽,梁綺雯,羅為桂,肖帥,蘇益,蕭浪濤. 激光生物學(xué)報. 2019(04)
[2]細(xì)葉百合LpWRKY20基因的克隆和表達(dá)分析[J]. 楊柳慧,汪王,劉艷秋,楊伊如,周蘊(yùn)薇. 西北林學(xué)院學(xué)報. 2019(03)
[3]細(xì)葉百合LpSVP基因的克隆及其表達(dá)分析[J]. 汪王,蘇小霞,楊柳慧,周蘊(yùn)薇. 西北林學(xué)院學(xué)報. 2018(04)
[4]鹽堿脅迫及植物耐鹽堿分子機(jī)制研究[J]. 劉奕媺,于洋,方軍. 土壤與作物. 2018(02)
[5]胡楊PePEX11基因參與調(diào)節(jié)鹽脅迫下擬南芥的抗氧化能力[J]. 姚琨,練從龍,王菁菁,王厚領(lǐng),劉超,尹偉倫,夏新莉. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(05)
[6]鹽脅迫下卷丹百合MAPK基因的克隆和序列分析[J]. 蔡東,陳麗靜,孫少坤,程福星,張麗,李天來. 分子植物育種. 2016(09)
[7]過氧化物酶體生物發(fā)生研究進(jìn)展[J]. 孫艷,孫雪培,姜玲玲,石蕓. 生物學(xué)雜志. 2015(02)
[8]百合APX基因的克隆及轉(zhuǎn)LlAPX提高擬南芥耐鹽性[J]. 陳莉,辛海波,孫向榮,尹慧,李曉昕,義鳴放. 園藝學(xué)報. 2010(12)
[9]包涵體蛋白質(zhì)的復(fù)性研究進(jìn)展[J]. 張婷婷,葉波平. 藥物生物技術(shù). 2007(04)
[10]棉花PTS2受體基因(GhPex7)的克隆及表達(dá)分析[J]. 李德謀,肖月華,羅明,侯磊,羅小英,羅克明,裴炎. 遺傳學(xué)報. 2003(09)
博士論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組和miRNA測序的細(xì)葉百合鱗莖休眠解除的分子機(jī)理[D]. 蘇小霞.東北林業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]細(xì)葉百合2型金屬硫蛋白(LpMT2)基因的克隆及其功能解析[D]. 趙婧競.東北林業(yè)大學(xué) 2019
[2]細(xì)葉百合LpNAC6和LpNAC20基因的克隆及其在煙草中的抗鹽功能分析[D]. 曹尚杰.東北林業(yè)大學(xué) 2019
[3]細(xì)葉百合3個NAC轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其對煙草的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 關(guān)春景.東北林業(yè)大學(xué) 2018
[4]堿性鹽脅迫下百合的生理響應(yīng)機(jī)制[D]. 李雅男.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[5]蠟梅過氧化物酶體生成蛋白基因CpPEX22的克隆及功能初步分析[D]. 趙亞虹.西南大學(xué) 2013
本文編號:3494219
【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-2?Nr注釋分類圖??Figure?2-2?Nr?annotation?classification?diagram??共55433個Unigene被注釋到Nr數(shù)據(jù)庫中,其中,注釋到油棕(£7沉/5?gz//>7em^)??
圖2-3?KOG注釋結(jié)果??Figure?2-3?KOG?annotation?results??
圖2-4?GO注釋結(jié)果??Figure?2-4?GO?annotation?results??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]PEX5參與調(diào)控擬南芥根系抗逆性的初步研究[J]. 詹爽,梁綺雯,羅為桂,肖帥,蘇益,蕭浪濤. 激光生物學(xué)報. 2019(04)
[2]細(xì)葉百合LpWRKY20基因的克隆和表達(dá)分析[J]. 楊柳慧,汪王,劉艷秋,楊伊如,周蘊(yùn)薇. 西北林學(xué)院學(xué)報. 2019(03)
[3]細(xì)葉百合LpSVP基因的克隆及其表達(dá)分析[J]. 汪王,蘇小霞,楊柳慧,周蘊(yùn)薇. 西北林學(xué)院學(xué)報. 2018(04)
[4]鹽堿脅迫及植物耐鹽堿分子機(jī)制研究[J]. 劉奕媺,于洋,方軍. 土壤與作物. 2018(02)
[5]胡楊PePEX11基因參與調(diào)節(jié)鹽脅迫下擬南芥的抗氧化能力[J]. 姚琨,練從龍,王菁菁,王厚領(lǐng),劉超,尹偉倫,夏新莉. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(05)
[6]鹽脅迫下卷丹百合MAPK基因的克隆和序列分析[J]. 蔡東,陳麗靜,孫少坤,程福星,張麗,李天來. 分子植物育種. 2016(09)
[7]過氧化物酶體生物發(fā)生研究進(jìn)展[J]. 孫艷,孫雪培,姜玲玲,石蕓. 生物學(xué)雜志. 2015(02)
[8]百合APX基因的克隆及轉(zhuǎn)LlAPX提高擬南芥耐鹽性[J]. 陳莉,辛海波,孫向榮,尹慧,李曉昕,義鳴放. 園藝學(xué)報. 2010(12)
[9]包涵體蛋白質(zhì)的復(fù)性研究進(jìn)展[J]. 張婷婷,葉波平. 藥物生物技術(shù). 2007(04)
[10]棉花PTS2受體基因(GhPex7)的克隆及表達(dá)分析[J]. 李德謀,肖月華,羅明,侯磊,羅小英,羅克明,裴炎. 遺傳學(xué)報. 2003(09)
博士論文
[1]基于轉(zhuǎn)錄組和miRNA測序的細(xì)葉百合鱗莖休眠解除的分子機(jī)理[D]. 蘇小霞.東北林業(yè)大學(xué) 2018
碩士論文
[1]細(xì)葉百合2型金屬硫蛋白(LpMT2)基因的克隆及其功能解析[D]. 趙婧競.東北林業(yè)大學(xué) 2019
[2]細(xì)葉百合LpNAC6和LpNAC20基因的克隆及其在煙草中的抗鹽功能分析[D]. 曹尚杰.東北林業(yè)大學(xué) 2019
[3]細(xì)葉百合3個NAC轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其對煙草的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 關(guān)春景.東北林業(yè)大學(xué) 2018
[4]堿性鹽脅迫下百合的生理響應(yīng)機(jī)制[D]. 李雅男.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[5]蠟梅過氧化物酶體生成蛋白基因CpPEX22的克隆及功能初步分析[D]. 趙亞虹.西南大學(xué) 2013
本文編號:3494219
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