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SELL基因與蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-14 07:48
  [目的]分析SELL基因的基因表達(dá)情況、Cp G島、啟動(dòng)子、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn);分析SELL蛋白的亞細(xì)胞定位、同源性、理化性質(zhì)、信號(hào)肽和跨膜區(qū)域、蛋白質(zhì)二三級(jí)結(jié)構(gòu)及相互作用蛋白。[方法]利用Promoter2.0、MethPrime、Ali Baba2.1、Prot Param、Prot Scale、Clustal Omega、PSORTII、Signal P4.1、TMHMM、SWISS-MODEL、STRING等生物信息學(xué)軟件對(duì)SELL進(jìn)行系統(tǒng)分析。[結(jié)果]SELL基因至少含有1個(gè)啟動(dòng)子,啟動(dòng)子區(qū)不存在Cp G島。SELL基因在人體多種正常組織中均有表達(dá),在全血中表達(dá)最高。SELL蛋白是有信號(hào)肽由372個(gè)氨基酸組成的、有跨膜區(qū)域的親水蛋白。主要定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核,二級(jí)結(jié)構(gòu)以隨機(jī)卷曲為主。分析結(jié)果顯示SELPLG、MADCAM1、CD34、CD44、PTPRC、CD69、CCR7、ITGAM、FOXP3、IL7R蛋白可能與SELL蛋白存在相互作用。[結(jié)論]對(duì)人SELL基因和編碼蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析,獲得了基因的特征及蛋白發(fā)揮的功能。 

【文章來源】:生物技術(shù). 2020,30(06)

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

SELL基因與蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析


SELL基因在多種組織中的表達(dá)

軟件,基因


EMBOSS CPGplot軟件預(yù)測CpG島結(jié)果

軟件,轉(zhuǎn)錄因子,位點(diǎn),基因


Meth Prime軟件預(yù)測CpG島結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]人超極化激活環(huán)核苷酸門控通道1基因啟動(dòng)子區(qū)及蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 黎銀潮,林婉蓉,陳樹達(dá),趙怡然,陳傲寒,周列民.  癲癇雜志. 2020(04)
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[4]ICAM-1和L-選擇素水平與肺癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系[J]. 侯欣,王志偉,段永建,張悅?cè)A,賈夢英,朱倩倩,李夢亞,張君娜,李東航.  實(shí)用癌癥雜志. 2020(03)
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[9]p27Kip1基因啟動(dòng)子區(qū)的生物信息學(xué)分析[J]. 管曉翔,陳巍魏,陳龍邦,王靖華.  醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2010(10)
[10]人LAIR-1/CD305基因啟動(dòng)子的生物信息學(xué)分析[J]. 楊樹德,曹奇志,馮小英,張曉姝,薛江楠.  細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志. 2010(08)

碩士論文
[1]探討DDB2基因?qū)︷畀徳錾择:坌纬杉癟GF-β/Smads信號(hào)通路的影響[D]. 熊夢媛.西南醫(yī)科大學(xué) 2019
[2]SELL基因在中國漢族重型痤瘡分子水平的研究[D]. 鄭琪.昆明醫(yī)科大學(xué) 2015



本文編號(hào):3494243

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