發(fā)布時間：2021-11-13 22:58

　　目的探索吸煙肺腺癌組織中和自噬相關(guān)聯(lián)的基因,并確定吸煙導(dǎo)致肺腺癌的潛在的自噬相關(guān)因素和預(yù)后因素。方法從GEO數(shù)據(jù)庫下載2個數(shù)據(jù)集（GSE32863和GSE75037）的基因表達譜,同時下載來自TCGA數(shù)據(jù)庫的吸煙肺腺癌患者的數(shù)據(jù)集。采用R中的微陣列數(shù)據(jù)包的線性模型探索來自吸煙的肺腺癌患者的樣本與癌旁肺組織之間的差異基因。采用數(shù)據(jù)庫DAVID進行差異基因的富集分析。采用相互作用基因/蛋白質(zhì)檢索的搜索工具和Cytoscape軟件獲得蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)并識別關(guān)鍵基因。此外,構(gòu)建自噬相關(guān)基因和差異基因之間的網(wǎng)絡(luò)。采用Kaplan-Meier分析總生存率。結(jié)果在GSE32863數(shù)據(jù)集確定了71個差異基因,在GSE75037數(shù)據(jù)集確定了641個差異基因,在TCGA數(shù)據(jù)集中確定了4 070個差異基因。3個數(shù)據(jù)集的交集顯示了52個差異基因,并選擇這些數(shù)據(jù)進行進一步研究。采用GO基因功能注釋將52個差異基因分為生物學(xué)過程、分子功能和細胞組分3個類別,進行京都基因和基因組百科全書分析�？偣灿�17個差異基因和自噬相關(guān)基因密切關(guān)聯(lián),其中LYVE1、RGCC、FOSB、ETV4、CDC20與自噬基因關(guān)聯(lián)... 

【文章來源】：國際呼吸雜志. 2020,40(22)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3493881