目的探討GLDN基因在結(jié)直腸癌中的表達及其意義。方法從GEO數(shù)據(jù)庫下載GSE50760數(shù)據(jù)包。利用R語言對數(shù)據(jù)包進行分析,得出與結(jié)直腸癌相關(guān)的差異表達基因,并繪制熱圖和火山圖。運用starbase在線數(shù)據(jù)庫對獲得的差異基因在結(jié)直腸癌與癌旁組織中的表達水平進行分析。進一步利用Onco Lnc在線數(shù)據(jù)庫進行差異基因與結(jié)直腸癌的預(yù)后分析。在臨床樣本層面,利用q PCR及免疫組化技術(shù)探索GLDN基因在結(jié)直腸癌中的表達差異。結(jié)果通過分析GSE50760數(shù)據(jù)包獲得前100個差異表達的基因。利用starbase在線數(shù)據(jù)庫對這100個差異表達基因的表達水平進行分析發(fā)現(xiàn),GLDN基因在結(jié)直腸癌組織中的表達比癌旁組織明顯下調(diào)。生存分析也提示,當(dāng)GLDN基因高表達時,結(jié)直腸癌患者的預(yù)后相對較好。q PCR及免疫組化技術(shù)也驗證了GLDN臨床樣本的癌旁組織中高表達,并且GLDN表達量與患者預(yù)后密切相關(guān)。結(jié)論 GLDN是結(jié)直腸癌的潛在抑癌基因,并且可以作為判斷結(jié)直腸癌患者預(yù)后的重要生物學(xué)標(biāo)記物。 

【文章來源】：臨床和實驗醫(yī)學(xué)雜志. 2020,19(16)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

GSE50760基因芯片數(shù)據(jù)分析

OncoLnc(包含220例CRC和220例癌旁組織)在線數(shù)據(jù)庫對GLDN基因在CRC患者中的表達數(shù)據(jù)進行生存分析，結(jié)果顯示，相對于GLDN基因高表達組，GLDN基因低表達患者的預(yù)后相對較好，差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.008)。見圖2。2.3 GLDN在臨床樣本中的表達差異

運用q PCR技術(shù)對CRC臨床樣本中的GLDN基因表達差異進行驗證，結(jié)果顯示，GLDN在CRC組織中低表達(見圖3A)。免疫組化結(jié)果也顯示，GLDN在CRC組織中低表達(見圖3B)。多因素相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)，GLDN基因的表達與腫瘤大小(P=0.018)和臨床分期(P=0.016)有關(guān)。見表1。3 討論


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