目的探討腫瘤芯片數(shù)據(jù)庫（Oncomine）,生存分析數(shù)據(jù)庫（Kaplan-Meier Plotter）和蛋白-蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫（String）平臺中CK-19基因在乳腺癌中的表達及臨床意義。方法分別對Oncomine、KaplanMeier Plotter和String進行乳腺癌CK-19基因表達情況數(shù)據(jù)挖掘。比較乳腺癌組織和對應(yīng)正常組織中CK-19mRNA表達是否存在差異。根據(jù)CK-19高低表達情況繪制生存曲線進行CK-19與乳腺癌患者預(yù)后關(guān)系分析。同時分析CK-19蛋白共表達網(wǎng)路,推測CK-19可能的相互作用蛋白及其生物學(xué)功能。結(jié)果檢索Oncomine數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),在乳腺癌中有9個數(shù)據(jù)集均顯示乳腺癌中CK-19高表達。CK-19 mRNA聚類分析顯示,CK-19mRNA與KRT18,ERBB3,PRR5等基因mRNA存在共表達;在String蛋白互作數(shù)據(jù)庫中對CK-19蛋白共表達進行了分析,結(jié)果顯示CK-19與KRT8,KRT18等蛋白具有共表達關(guān)系。Oncomine數(shù)據(jù)庫中,有3項基因表達芯片數(shù)據(jù)關(guān)于CK-19 mRNA在乳腺癌與正常組織中的差異表達分?jǐn)?shù)數(shù)據(jù),結(jié)果顯示乳腺癌組織中... 

【文章來源】：轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)雜志. 2020,9(04)

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CK-19基因mRNA在多種實體腫瘤與對應(yīng)正常組織中的整體表達

Oncomine數(shù)據(jù)庫中對CK-19 mRNA在乳腺癌中的共表達基因進行聚類分析顯示，CK-19 mRNA與KRT18,ERBB3,PRR5等基因mRNA存在共表達，提示上述基因在生物學(xué)功能上可能具相關(guān)性，圖2。進一步在String蛋白數(shù)據(jù)庫中對CK-19蛋白共表達進行了分析，結(jié)果顯示CK-19與KRT8,KRT18等蛋白具有共表達關(guān)系，圖3。圖3 CK-19基于String數(shù)據(jù)庫的基因共表達分析

CK-19基于String數(shù)據(jù)庫的基因共表達分析

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3493478