發(fā)布時間：2017-04-25 13:00

  本文關(guān)鍵詞：圈養(yǎng)林麝MHC基因和線粒體序列的遺傳多樣性，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：林麝(Moschus berezovskii)是一種分布于中國西部和越南北部的高海拔動物。它歷史上數(shù)量眾多,但棲息地喪失和偷獵已經(jīng)使得這一物種種群數(shù)劇烈下降,并因此而被IUCN列為瀕危動物。本文主要研究結(jié)果為：1.描述了一個主要組織相容性復(fù)合體(MHC)基因座位的遺傳多樣性,并將促使這種多樣性產(chǎn)生的動力因子區(qū)分開來。作者從四川的一個圈養(yǎng)林麝種群里發(fā)現(xiàn)了7個DRB第二外顯子的等位基因。和其它瀕危或者圈養(yǎng)有蹄類動物相比,圈養(yǎng)林麝的MHC遺傳多樣性水平較低。2.利用該圈養(yǎng)林麝種群的MHC等位基因進行分析,作者發(fā)現(xiàn),非同義替換主要發(fā)生于推定的肽結(jié)合區(qū)域(PBR),進一步分析表明,重組和選擇共同塑造了這一基因座位的遺傳多樣性。具體來講,等位基因的重組產(chǎn)生了新的等位基因,正選擇作用于PBR區(qū)域,而負選擇(或凈化選擇)作用于非PBR區(qū)域。了解MHC功能基因的變異有利于優(yōu)化林麝圈養(yǎng)繁育項目的規(guī)劃和管理。3.本實驗在之前研究的基礎(chǔ)上進一步分析了來自四川西部和陜西秦嶺兩個區(qū)域圈養(yǎng)種群的林麝線粒體控制區(qū)和MHC DRB基因座位的空間遺傳變異,揭示了這兩個區(qū)域林麝的遺傳結(jié)構(gòu)和進化歷史。4.本實驗觀測到兩個區(qū)域圈養(yǎng)種群之間有中等水平的遺傳分化,這種分化可能是由它們祖先的分化所導(dǎo)致的,分化時間可以追溯到大約37,800-56,700年前。MHC數(shù)據(jù)表明選擇作用影響了這兩個區(qū)域種群的DRB等位基因頻率,這很可能反映了林麝對當(dāng)?shù)夭≡w的適應(yīng)性。而且,秦嶺種群的DBR等位基因和線粒體序列的遺傳多樣性水平要高于四川西部的種群,說明了四川西部的林麝歷史上可能源于秦嶺,種群數(shù)量歷史的模型基本上支持這一點。5.基于兩個區(qū)域圈養(yǎng)種群的遺傳分化和地理分離,作者建議把這些區(qū)域作為不同的管理單元,從而維持這一物種的進化潛力。
【關(guān)鍵詞】：林麝 MHC 線粒體 遺傳多樣性 種群數(shù)量
【學(xué)位授予單位】：北京林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S865.41
【目錄】：

• 摘要3-4
• Abstract4-7
• 第一部分 引言7-18
• 1. 林麝的研究背景7-11
• 1.1. 林麝的生物學(xué)特征7
• 1.2. 林麝的地理分布和棲息地7-8
• 1.3. 林麝瀕危狀況和原因8-9
• 1.4. 林麝的保護現(xiàn)狀9
• 1.5. 人工養(yǎng)麝進展及問題9-10
• 1.6. 林麝的行為生態(tài)學(xué)研究10
• 1.7. 林麝的生理和疾病研究10-11
• 1.8. 林麝的分子生物學(xué)研究11
• 2. 保護遺傳學(xué)的應(yīng)用11-14
• 2.1. 保護遺傳學(xué)的研究進展11-12
• 2.2. 保護遺傳學(xué)使用的分子標(biāo)記12-14
• 2.2.1. 線粒體控制區(qū)(D-Loop區(qū))12-13
• 2.2.2. 主要組織相容性復(fù)合體(MHC)基因13-14
• 3. 基因分型的方法及進展14-16
• 3.1. 基于PCR的基因分型技術(shù)15
• 3.2. 基因分型技術(shù)的問題15-16
• 4. 本研究的立題依據(jù)、目的和內(nèi)容16-18
• 第二部分 研究內(nèi)容18-41
• 5. 以四川片仔癀圈養(yǎng)種群為例調(diào)查林麝MHC遺傳多樣性及產(chǎn)生機制18-31
• 5.1. 實驗材料18-19
• 5.1.1. 實驗樣品18
• 5.1.2. 主要實驗儀器18-19
• 5.1.3. 主要實驗試劑19
• 5.2. 實驗方法19-20
• 5.2.1. 血液基因組DNA的提取19
• 5.2.2. PCR擴增及條件19-20
• 5.3. 基因分型20-21
• 5.3.1. 基于克隆測序的基因分型20-21
• 5.3.2. 單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)分型21
• 5.4. 數(shù)據(jù)分析21-24
• 5.4.1. 分析序列多態(tài)性21-22
• 5.4.2. 檢測基因重組22-24
• 5.4.3. 檢測選擇作用24
• 5.5. 結(jié)果分析24-28
• 5.5.1. 林麝基因組DNA提取結(jié)果24
• 5.5.2. PCR擴增24-25
• 5.5.3. 序列變異25-26
• 5.5.4. 分析重組和選擇26-28
• 5.6. 討論28-31
• 6. 川西和陜西秦嶺圈養(yǎng)林麝種群遺傳多樣性的差異31-41
• 6.1. 實驗材料31-32
• 6.1.1. 實驗樣品31-32
• 6.1.2. 主要實驗儀器32
• 6.1.3. 主要實驗試劑32
• 6.2. 實驗方法32-33
• 6.2.1. 血液基因組DNA的提取32
• 6.2.2. PCR擴增及條件32-33
• 6.3. 數(shù)據(jù)分析33-35
• 6.3.1. 線粒體序列分析33-35
• 6.3.2. MHC等位基因分析35
• 6.4. 結(jié)果分析35-39
• 6.4.1. 線粒體控制區(qū)的種群遺傳和系統(tǒng)發(fā)生分析35-38
• 6.4.2. 基于MHC基因的林麝種群遺傳結(jié)構(gòu)38-39
• 6.5 討論39-41
• 第三部分 結(jié)論41-43
• 7. 結(jié)論、創(chuàng)新及展望41-43
• 7.1 結(jié)論41
• 7.2 創(chuàng)新41
• 7.3 展望41-43
• 參考文獻43-50
• 作者簡介50-51
• 導(dǎo)師簡介51-52
• 獲得成果目錄清單52-53
• 致謝53

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