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蘋果屬無融合生殖SERK1基因的克隆與生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-10-20 16:42
【摘要】:[目的]為探討蘋果屬植物無融合生殖分子機(jī)制。[方法]以蘋果屬平邑甜茶及雜種后代33#為試材,以蘋果基因組CDS序列設(shè)計(jì)引物,通過PCR擴(kuò)增技術(shù)克隆出SERK同源基因的c DNA全長序列,命名為Mh SERK1和MhdSERK1(Gen Bank登錄號JQ231273和JQ231272),利用實(shí)時定量RTq PCR的方法檢測了這兩個基因在平邑甜茶和雜種后代各組織和器官中的表達(dá)模式。[結(jié)果]序列分析顯示Mh SERK1和Mhd SERK1編碼區(qū)序列全長為1 899 bp和1 881 bp,分別編碼632和626個氨基酸,其氨基酸序列與其他植物的SERK1同源基因所編碼的氨基酸同源性都在80%以上,特別是與葡萄科龍眼品種同源性最高,高達(dá)92.56%,與模式植物擬南芥、煙草等植物的SERK同源基因都具有很高的同源性。實(shí)時定量PCR結(jié)果表明,在平邑甜茶和雜種后代不同組織、花器官中SERK1基因的表達(dá)量存在差異,其中在子房中的表達(dá)量最高,在營養(yǎng)生長的組織中表達(dá)量很低,在平邑甜茶花蕾期的子房中表達(dá)量最高。[結(jié)論]推測該基因在平邑甜茶和雜種后代的生殖發(fā)育過程中可能發(fā)揮重要作用。
[Abstract]:[objective] to study the molecular mechanism of apomixis in apple. [methods] the full-length c DNA sequence of SERK homologous gene was cloned by PCR amplification with primer designed from apple genomic CDS sequence and its hybrid progeny 32#. Named Mh SERK1 and MhdSERK1 (Gen Bank accession numbers JQ231273 and JQ231272, the expression patterns of these two genes in tissues and organs of sweet tea and hybrid progenies of Pingyi were detected by real-time quantitative RTq PCR. [results] sequence analysis showed that the total length of Mh SERK1 and Mhd SERK1 coding region was 1 899 bp and 1 881 bp, encoding 632 and 626 amino acids, respectively. The amino acid sequence of the amino acid sequence was more than 80% homology with the SERK1 homologous gene of other plants. Especially with grape longan varieties the highest homology up to 92.56 and model plants such as Arabidopsis tobacco and other plants have high homology of SERK homology. The results of real-time quantitative PCR showed that there were differences in the expression of SERK1 gene in different tissues of sweet tea and hybrid progenies in Pingyi, especially in ovary and low expression in vegetative growth tissue. The highest expression level was found in the ovary of the flower bud stage of sweet tea in Pingyi. [conclusion] it is speculated that this gene may play an important role in the reproductive development of sweet tea and hybrid progenies.
【作者單位】: 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)院;沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院;遼寧省本溪市桓仁縣林業(yè)局;
【基金】:國家自然科學(xué)基金“蘋果屬四倍性皺葉矮生株系的生殖特征及形成機(jī)理研究”(30971975)
【分類號】:S661.1

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