粗糙脈孢菌無性產(chǎn)孢過程中增量表達基因的功能分析
本文選題:粗糙脈孢菌 切入點:無性產(chǎn)孢 出處:《菌物學(xué)報》2017年03期
【摘要】:無性產(chǎn)孢是絲狀真菌主要的繁殖方式,也是病原真菌傳播的基礎(chǔ)。為了全面分析絲狀真菌無性產(chǎn)孢的調(diào)控機制,我們以粗糙脈孢菌為模式菌株,利用RNA seq比較了誘導(dǎo)無性產(chǎn)孢前后的轉(zhuǎn)錄組變化。對誘導(dǎo)前后差異表達基因的聚類分析發(fā)現(xiàn),無性產(chǎn)孢誘導(dǎo)主要影響氧化還原過程與代謝過程,與ROS(reactive oxygen species)相關(guān)的基因差異表達明顯,無性產(chǎn)孢誘導(dǎo)階段伴隨ROS的升高。同時,與產(chǎn)孢相關(guān)的基因(包括調(diào)控基因和結(jié)構(gòu)基因)出現(xiàn)特異性表達。為揭示其他誘導(dǎo)表達基因在無性產(chǎn)孢中的功能,我們對這些基因缺失突變體的無性產(chǎn)孢表型進行了分析,新發(fā)現(xiàn)6個正向影響無性產(chǎn)孢的基因[NCU09792、NCU05159、NCU06112、NCU05079、NCU00461、NCU07521(fwd 2)]。這6個基因在無性產(chǎn)孢過程中增量表達,相應(yīng)的基因突變體無性產(chǎn)孢量與野生菌株相比有明顯降低,說明它們對無性產(chǎn)孢具有正調(diào)控作用。以上結(jié)果進一步加深了我們對粗糙脈孢菌無性產(chǎn)孢發(fā)育及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的認識。
[Abstract]:Asexual sporulation is the main reproductive mode of filamentous fungi and the basis for the transmission of pathogenic fungi.In order to fully analyze the regulatory mechanism of asexual sporulation of filamentous fungi, we compared the transcriptional changes before and after asexual sporulation induction by RNA seq.Cluster analysis of differentially expressed genes before and after induction showed that asexual sporulation mainly affected the redox process and metabolism, and the differentially expressed genes related to ROS(reactive oxygen specieswere obvious. The asexual sporulation induction was accompanied by the increase of ROS.At the same time, the genes related to sporulation, including regulatory genes and structural genes, were expressed specifically.In order to reveal the function of other inducible expression genes in asexual sporulation, we analyzed the asexual sporulation phenotype of these gene deletion mutants, and found six genes that have positive effect on asexual sporulation [NCU09792NCU05159NCU06112NCU05079NCU00461NCU07521fwd 2].The six genes were expressed incrementally during asexual sporulation, and the asexual sporulation capacity of the corresponding mutant was significantly lower than that of wild strains, which indicated that they had positive regulation on asexual sporulation.The above results further deepen our understanding of asexual sporulation development and regulatory network of C. crassa.
【作者單位】: 齊魯工業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院;中國科學(xué)院微生物研究所真菌學(xué)國家重點實驗室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31370024)~~
【分類號】:Q949.32
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3 何U,
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