本文關(guān)鍵詞：胃上皮內(nèi)瘤變患者胃黏膜微生態(tài)的研究

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【摘要】：背景：胃癌是全球第三位癌癥相關(guān)死亡原因。慢性幽門(mén)螺桿菌(H. pylori)感染,是目前已知的與胃癌發(fā)生相關(guān)的最重要因素。H.pylori在胃癌發(fā)病機(jī)制中的作用已有部分研究。但是,胃內(nèi)還有大量的非H.pylori微生物,其與胃部疾病關(guān)系的研究極少。目前尚缺乏胃癌前病變,尤其是胃上皮內(nèi)瘤變(Gastric intraepithelial neoplasias, GIN)患者胃黏膜微生態(tài)的相關(guān)數(shù)據(jù)。本研究通過(guò)利用細(xì)菌16S rDNA高通量測(cè)序分析技術(shù),對(duì)胃上皮內(nèi)瘤變患者胃內(nèi)微生態(tài)進(jìn)行分析,初步構(gòu)建胃癌前病變相關(guān)胃黏膜微生態(tài)構(gòu)成情況,嘗試篩選出與疾病顯著相關(guān)的菌屬。方法：胃上皮內(nèi)瘤變組(GIN組)納入胃鏡下診斷并經(jīng)病理學(xué)證實(shí),未接受任何治療的GIN患者；健康對(duì)照組(HC組)納入同時(shí)期無(wú)消化系統(tǒng)癥狀、H.pylori常規(guī)臨床檢測(cè)陰性,且胃鏡檢查正常的健康志愿者。分別采集GIN患者病變組織、正常胃竇和胃體部位黏膜活檢樣本各1塊；健康志愿者正常胃竇和胃體黏膜各1塊。提取胃黏膜細(xì)菌總DNA,擴(kuò)增16S rRNA基因V4區(qū)。利用Illumina Miseq高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行雙末端測(cè)序。用QIIME等軟件進(jìn)行操作分類(lèi)單元(Operational taxonomic units, OTUs)聚類(lèi)、分析、物種注釋?zhuān)煌ㄟ^(guò)繪制稀釋曲線、Chaol曲線、Shannon旨數(shù)和Rank abundance曲線進(jìn)行樣品復(fù)雜度分析；通過(guò)主坐標(biāo)分析(Principal coordinate analysis, PCoA)和UPGMA (Unweighted pair group method with arithmetic mean)聚類(lèi)分析進(jìn)行健康人群、GIN患者胃內(nèi)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性的比較分析等生物信息學(xué)處理。同時(shí),根據(jù)Hpylori相對(duì)豐度將兩組分別分為低、中、高三個(gè)豐度組進(jìn)行分層分析。結(jié)果：GIN組(n=25)的平均OTUs數(shù)目明顯低于HC組(n=30)(P0.05),而低級(jí)別上皮內(nèi)瘤變(n=10)和高級(jí)別上皮內(nèi)瘤變(n=15)亞組間的平均OTUs數(shù)目無(wú)顯著差異(P0.05)。在門(mén)分類(lèi)水平,GIN組的厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)、放線菌門(mén)、梭桿菌門(mén)中位相對(duì)豐度明顯高于健康對(duì)照組；同時(shí),GIN組的變形菌門(mén)、藍(lán)菌門(mén)、酸桿菌門(mén)、浮霉菌門(mén)、螺旋菌門(mén)等的中位相對(duì)豐度明顯低于健康對(duì)照組。在屬分類(lèi)水平,螺桿菌屬相對(duì)豐度在兩組間無(wú)差異(P0.05)。GIN組的鏈球菌屬、普雷沃氏菌屬、奈瑟氏菌屬、鹽單胞菌屬、羅氏菌屬、韋榮氏菌屬、乳桿菌屬、嗜血菌屬等的相對(duì)豐度顯著高于健康組；GIN組的不動(dòng)桿菌屬、動(dòng)膠菌屬、鞘脂菌屬等的相對(duì)豐度顯著低于對(duì)照組。不同H.pylori相對(duì)豐度分層分析顯示：H.pylori相對(duì)豐度越高,HC組和GIN組的菌群物種多樣性越低。在門(mén)水平,低、中、高組GIN患者的相對(duì)豐度均較高的是厚壁菌門(mén),較低的是浮霉菌門(mén)、螺旋菌門(mén)等。屬水平,三組GIN患者的相對(duì)豐度均較高的是乳桿菌屬等,較低的是動(dòng)膠菌屬、鞘脂菌屬、氫噬胞菌屬等。PCoA、UPGMA聚類(lèi)分析顯示：健康人群和GIN患者菌群結(jié)構(gòu)存在顯著差異,組間聚類(lèi)明顯。且無(wú)論H. pylori目對(duì)豐度高低,在同一H. pylori豐度水平的疾病和健康組間的菌群結(jié)構(gòu)均存在顯著差異,組間聚類(lèi)明顯。但組內(nèi)胃竇和胃體之間,胃竇／胃體正常黏膜和病變黏膜之間,以及低級(jí)別和高級(jí)別上皮內(nèi)瘤變患者之間胃內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)相似,無(wú)法完全聚類(lèi)分開(kāi)。結(jié)論：胃上皮內(nèi)瘤變患者胃黏膜相關(guān)微生態(tài)物種多樣性顯著低于健康人群,群落結(jié)構(gòu)也與健康人群有顯著區(qū)別,提示胃上皮內(nèi)瘤變與胃黏膜微生態(tài)變化可能存在一定關(guān)系。
【關(guān)鍵詞】：胃上皮內(nèi)瘤變 胃黏膜微生態(tài) 細(xì)菌16s rDNA 幽門(mén)螺桿菌
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：R735.2
【目錄】：

• 英文縮略詞表5-6
• 中文摘要6-8
• Abstract8-10
• 前言10-11
• 材料方法11-19
• 結(jié)果19-49
• 1. 研究對(duì)象臨床資料19-20
• 2. DNA提取及擴(kuò)增20-21
• 3. 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制21
• 4. 健康對(duì)照組胃黏膜菌群分析21-27
• 5. 胃高級(jí)別上皮內(nèi)瘤變組胃黏膜菌群分析27-35
• 6. 健康人群和胃上皮內(nèi)瘤變患者胃黏膜菌群的對(duì)比分析35-45
• 7. 根據(jù)H.pylori相對(duì)豐度分層對(duì)比分析HC和GIN患者胃黏膜菌群45-49
• 討論49-56
• 結(jié)論56-57
• 參考文獻(xiàn)57-60
• 綜述60-74
• 參考文獻(xiàn)67-74
• 論文發(fā)表情況(第一作者)74
• 致謝74

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本文編號(hào)：771948