本文關鍵詞：胃上皮內瘤變患者胃黏膜微生態(tài)的研究

  更多相關文章： 胃上皮內瘤變 胃黏膜微生態(tài) 細菌16s rDNA 幽門螺桿菌

【摘要】：背景：胃癌是全球第三位癌癥相關死亡原因。慢性幽門螺桿菌(H. pylori)感染,是目前已知的與胃癌發(fā)生相關的最重要因素。H.pylori在胃癌發(fā)病機制中的作用已有部分研究。但是,胃內還有大量的非H.pylori微生物,其與胃部疾病關系的研究極少。目前尚缺乏胃癌前病變,尤其是胃上皮內瘤變(Gastric intraepithelial neoplasias, GIN)患者胃黏膜微生態(tài)的相關數據。本研究通過利用細菌16S rDNA高通量測序分析技術,對胃上皮內瘤變患者胃內微生態(tài)進行分析,初步構建胃癌前病變相關胃黏膜微生態(tài)構成情況,嘗試篩選出與疾病顯著相關的菌屬。方法：胃上皮內瘤變組(GIN組)納入胃鏡下診斷并經病理學證實,未接受任何治療的GIN患者；健康對照組(HC組)納入同時期無消化系統(tǒng)癥狀、H.pylori常規(guī)臨床檢測陰性,且胃鏡檢查正常的健康志愿者。分別采集GIN患者病變組織、正常胃竇和胃體部位黏膜活檢樣本各1塊；健康志愿者正常胃竇和胃體黏膜各1塊。提取胃黏膜細菌總DNA,擴增16S rRNA基因V4區(qū)。利用Illumina Miseq高通量測序平臺進行雙末端測序。用QIIME等軟件進行操作分類單元(Operational taxonomic units, OTUs)聚類、分析、物種注釋；通過繪制稀釋曲線、Chaol曲線、Shannon旨數和Rank abundance曲線進行樣品復雜度分析；通過主坐標分析(Principal coordinate analysis, PCoA)和UPGMA (Unweighted pair group method with arithmetic mean)聚類分析進行健康人群、GIN患者胃內細菌群落結構和多樣性的比較分析等生物信息學處理。同時,根據Hpylori相對豐度將兩組分別分為低、中、高三個豐度組進行分層分析。結果：GIN組(n=25)的平均OTUs數目明顯低于HC組(n=30)(P0.05),而低級別上皮內瘤變(n=10)和高級別上皮內瘤變(n=15)亞組間的平均OTUs數目無顯著差異(P0.05)。在門分類水平,GIN組的厚壁菌門、擬桿菌門、放線菌門、梭桿菌門中位相對豐度明顯高于健康對照組；同時,GIN組的變形菌門、藍菌門、酸桿菌門、浮霉菌門、螺旋菌門等的中位相對豐度明顯低于健康對照組。在屬分類水平,螺桿菌屬相對豐度在兩組間無差異(P0.05)。GIN組的鏈球菌屬、普雷沃氏菌屬、奈瑟氏菌屬、鹽單胞菌屬、羅氏菌屬、韋榮氏菌屬、乳桿菌屬、嗜血菌屬等的相對豐度顯著高于健康組；GIN組的不動桿菌屬、動膠菌屬、鞘脂菌屬等的相對豐度顯著低于對照組。不同H.pylori相對豐度分層分析顯示：H.pylori相對豐度越高,HC組和GIN組的菌群物種多樣性越低。在門水平,低、中、高組GIN患者的相對豐度均較高的是厚壁菌門,較低的是浮霉菌門、螺旋菌門等。屬水平,三組GIN患者的相對豐度均較高的是乳桿菌屬等,較低的是動膠菌屬、鞘脂菌屬、氫噬胞菌屬等。PCoA、UPGMA聚類分析顯示：健康人群和GIN患者菌群結構存在顯著差異,組間聚類明顯。且無論H. pylori目對豐度高低,在同一H. pylori豐度水平的疾病和健康組間的菌群結構均存在顯著差異,組間聚類明顯。但組內胃竇和胃體之間,胃竇／胃體正常黏膜和病變黏膜之間,以及低級別和高級別上皮內瘤變患者之間胃內菌群結構相似,無法完全聚類分開。結論：胃上皮內瘤變患者胃黏膜相關微生態(tài)物種多樣性顯著低于健康人群,群落結構也與健康人群有顯著區(qū)別,提示胃上皮內瘤變與胃黏膜微生態(tài)變化可能存在一定關系。
【關鍵詞】：胃上皮內瘤變 胃黏膜微生態(tài) 細菌16s rDNA 幽門螺桿菌
【學位授予單位】：中國人民解放軍醫(yī)學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R735.2
【目錄】：

• 英文縮略詞表5-6
• 中文摘要6-8
• Abstract8-10
• 前言10-11
• 材料方法11-19
• 結果19-49
• 1. 研究對象臨床資料19-20
• 2. DNA提取及擴增20-21
• 3. 測序數據質量控制21
• 4. 健康對照組胃黏膜菌群分析21-27
• 5. 胃高級別上皮內瘤變組胃黏膜菌群分析27-35
• 6. 健康人群和胃上皮內瘤變患者胃黏膜菌群的對比分析35-45
• 7. 根據H.pylori相對豐度分層對比分析HC和GIN患者胃黏膜菌群45-49
• 討論49-56
• 結論56-57
• 參考文獻57-60
• 綜述60-74
• 參考文獻67-74
• 論文發(fā)表情況(第一作者)74
• 致謝74

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本文編號：771948