本文關鍵詞：基于~1H-NMR譜食管鱗狀細胞癌血清代謝組學分析

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【摘要】：背景和目的:食管癌發(fā)病率極高,在世界惡性腫瘤發(fā)病率排行榜中名列第九,惡性腫瘤死亡率排行榜名列第八;我國是食管癌高發(fā)地區(qū),其死亡率躍居腫瘤死亡的第四位。食管癌對人類的健康和生存構成了極大的威脅,每年大約有30萬人死于食管癌。食管癌傳統(tǒng)診斷手段有諸多不足之處,尋找能夠診斷食管癌的新方法顯得尤為重要。代謝組學是一門新興學科,能綜合性評估代謝產物的變化水平,從而實現(xiàn)對疾病的診斷。通過核磁共振波譜技術研究食管癌患者血清中代謝譜的變化,試圖尋找與食管癌密切相關的血清代謝產物,探討與食管癌發(fā)生相關的代謝機制,為食管癌的臨床診斷提供參考依據(jù)。方法:收集川北醫(yī)學院附屬醫(yī)院初診食管癌患者的血清作為實驗組(39例),同時收集健康志愿者血清作為對照組(15例)。利用BRUKER400 MHz核磁共振波譜成像儀,采集一維核磁共振氫譜(1H-nuclear magnetic resonance spectroscopy,1H-NMRS),并對其進行分段積分,利用主成分分析法(principal component analysis,PCA)、偏最小二乘判別分析法(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)對上述血清樣品1H-NMRS數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析,在PLS-DA載荷圖中,找出變量權重重要性排序(variable importance in the projection,VIP)值,篩選出特征性變量(VIP1,P0.01)。查找文獻及代謝數(shù)據(jù)庫對這些特征變量進行指認,鑒定出特異性代謝產物。結果:1.血清中代謝物本身濃度較低,其中小分子代謝物水平變化比較細微,直接比較食管癌患者與志愿者核磁共振波譜圖不能找出差異性代謝物。2.在PCA模型得分圖中,PC1(principle component 1)在PCA模型中的百分比為48.6%;PC2為16.5%。在PCA得分圖中實驗組與對照組樣本有一定的區(qū)分度,但不顯著。3.PLS-DA得分圖及3D得分圖能將實驗組與對照完全區(qū)分開,通過交叉驗證,R2=0.749、Q2=0.639,模型穩(wěn)健,預測精度為0.98,預測能力強。通過PLS-DA載荷圖鑒別出8種差異性代謝物分別是脲基丙酸、乙酸、胍乙酸、丙酮酸、左旋谷酰胺、壬二酸、甲硫醚、赤蘚糖醇,與對照組相比較實驗組代謝物水平均降低(P0.01)。結論:1.利用磁共振波譜儀檢測血清代謝物的變化可以區(qū)分實驗組和對照組,與對照組相比,食管癌患者糖代謝、脂肪代謝、核酸代謝發(fā)生明顯改變。2.食管癌代謝組學分析與代謝通路分析相結合,有助于從代謝角度探索食管癌發(fā)生、發(fā)展的機制。
【關鍵詞】：食管腫瘤 核磁共振波譜 代謝組學 偏最小二乘判別分析法
【學位授予單位】：川北醫(yī)學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R735.1
【目錄】：

• 致謝4-6
• 摘要6-8
• Abstract8-11
• 前言11-15
• 材料與方法15-22
• 結果22-31
• 討論31-36
• 結論36-37
• 附圖37-38
• 參考文獻38-42
• 綜述：代謝組學在食管癌的研究現(xiàn)狀42-54
• 參考文獻51-54
• 個人簡歷54

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本文編號：717436