本文關(guān)鍵詞：TLR9遺傳變異、基因—環(huán)境交互作用對順德人群原發(fā)性肝癌易感性的影響

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【摘要】：目的1.探討廣東順德人群原發(fā)性肝癌發(fā)病相關(guān)的環(huán)境危險因素;2.探討TLR9基因的遺傳變異與廣東順德人群原發(fā)性肝癌易感性的關(guān)聯(lián);3.綜合分析TLR9、TLR4遺傳變異的基因-基因和基因-環(huán)境交互作用對廣東順德人群原發(fā)性肝癌發(fā)生的影響。方法本研究采用病例-對照研究設(shè)計,納入經(jīng)臨床確診為原發(fā)性肝癌的新發(fā)病例611例,納入按性別、年齡和居住地匹配的對照611例。對研究對象進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查,探討廣東順德地區(qū)原發(fā)性肝癌的主要環(huán)境危險因素。采用生物信息學(xué)技術(shù)篩選TLR9基因上的潛在功能遺傳變異,作為本研究的目標(biāo)遺傳變異。對TLR9基因的rs187084、rs352140和rs5743836遺傳變異與原發(fā)性肝癌發(fā)病風(fēng)險的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行分析。結(jié)合課題組前期在同一人群中檢測的TLR4基因的rs10116253、rs10759932和rs11536889遺傳變異數(shù)據(jù),綜合運(yùn)用logistic回歸的相乘和相加模型以及MDR法挖掘TLR9、TLR4遺傳變異之間、遺傳變異與環(huán)境因素之間的交互作用對順德地區(qū)原發(fā)性肝癌發(fā)病的影響。結(jié)果1.經(jīng)logistic回歸模型分析,有7個因素進(jìn)入多因素模型:飲酒史、飲用溝塘水史、經(jīng)常參加運(yùn)動、乙肝病毒感染史、乙肝家族史、肝癌家族史和腫瘤家族史的,經(jīng)調(diào)整年齡因素后的OR和95%CI分別為1.69(1.28-2.26)、1.62(1.21-2.16)、0.57(0.42-0.78)、13.16(9.75-17.76)、1.52(1.04-2.22)、2.66(1.52-4.66)和1.47(1.00-2.17)。2.利用卡方檢驗(yàn)對TLR9的遺傳變異基因型在病例組和對照組中的頻率分布差異進(jìn)行檢驗(yàn),結(jié)果顯示rs5743836基因型在兩組中的頻率分布存在統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.0105)。3.經(jīng)多因素logistic回歸模型分析,與AA基因型相比,rs5743836的AG基因型與肝癌發(fā)病風(fēng)險的上升相關(guān)(OR=1.44;95%CI=1.12-1.84)。單體型分析結(jié)果顯示,與ACA單體型相比,攜帶ACG單倍型人群與肝癌發(fā)病風(fēng)險升高相關(guān)(OR=2.41;95%CI=1.21-4.80)。4.對兩兩基因-基因、基因-環(huán)境交互分析結(jié)果顯示,TLR9 rs187084與肝癌家族史的相乘交互和相加交互作用均有統(tǒng)計學(xué)意義(P相乘交互=0.0026;P相加交互=0.0001)。TLR9rs352140與乙肝病毒感染史具有相乘交互及相加交互作用(P相乘交互=0.0186;P相加交互=0.0001)rs187084與飲酒史之間存在相乘交互作用(P相乘交互=0.0003)。下列TLR9遺傳變異與環(huán)境因素之間存在相加交互作用:rs187084與乙肝病毒感染(P相加交互=0.0001)、rs5743836與乙肝病毒感染(P相加交互=0.0101)、rs5743836與肝癌家族史(P相加交互=0.0036)。采用MDR對多因素基因-環(huán)境交互作用分析,結(jié)果顯示,肝癌家族史,HBV感染,TLR4-rs10116253,TLR9-rs187084,TLR9-rs574383在原發(fā)性肝癌的發(fā)病中有統(tǒng)計學(xué)意義的交互作用。結(jié)論1.飲酒、曾飲用溝塘水、乙肝病毒感染、乙肝家族史和肝癌家族史可能是順德地區(qū)原發(fā)性肝癌的獨(dú)立環(huán)境危險因素;經(jīng)常參加運(yùn)動可能是保護(hù)因素。2.rs5743836、ACG單體型可能與順德地區(qū)原發(fā)性肝癌易感性關(guān)聯(lián),攜帶rs5743836的AG基因型或rs187084-rs352140-rs5743836的ACG單體型的個體具有較高的肝癌發(fā)病風(fēng)險。3.TLR9遺傳變異與飲酒、乙肝病毒感染和肝癌家族史之間的交互作用可能對順德地區(qū)肝癌發(fā)生具有重要影響。
【關(guān)鍵詞】：原發(fā)性肝癌 遺傳變異 環(huán)境危險因素 交互作用
【學(xué)位授予單位】：廣東藥學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.7
【目錄】：

• 中文摘要6-8
• 英文摘要8-10
• 引言10-14
• 第一部分 原發(fā)性肝癌的環(huán)境危險因素14-26
• 材料與方法14-16
• 1 研究對象14-15
• 2 流行病學(xué)調(diào)查15
• 3 調(diào)查的質(zhì)量控制15
• 4 統(tǒng)計分析方法15-16
• 結(jié)果16-22
• 1 一般人口學(xué)特征16
• 2 原發(fā)性肝癌環(huán)境因素的單因素分析16-20
• 3 原發(fā)性肝癌的相關(guān)危險因素的多因素分析20-21
• 4 環(huán)境-環(huán)境因素交互MDR分析21-22
• 討論22-26
• 1 一般人口學(xué)特征22-23
• 2 一般情況與原發(fā)性肝癌23-24
• 3 飲食生活習(xí)慣與原發(fā)性肝癌24
• 4 疾病史及疾病家族史與原發(fā)性肝癌24-26
• 第二部分 TLR9 遺傳變異與肝癌易感性分析26-39
• 材料與方法26-33
• 1 研究對象26
• 2 統(tǒng)計學(xué)檢驗(yàn)效能的估計26
• 3 基因組DNA的提取26-29
• 3.1 血液樣本的采集與處理26
• 3.2 DNA提取的主要儀器和試劑26-27
• 3.3 基因組DNA的提取方法27-29
• 3.4 DNA純度和濃度的測定29
• 4 TLR9 基因SNP位點(diǎn)的選擇29
• 5 基因SNP檢測29-31
• 5.1 主要儀器和試劑29-30
• 5.2 等位基因分型實(shí)驗(yàn)步驟30-31
• 5.3 結(jié)果的判讀31
• 6 實(shí)驗(yàn)的質(zhì)量控制31-32
• 7 統(tǒng)計分析方法32-33
• 結(jié)果33-37
• 1 TLR9 基因型分布Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)33
• 2 TLR9 基因型和等位基因頻率在病例組與對照組中的分布33-34
• 3 基因型與原發(fā)性肝癌易感性的關(guān)聯(lián)分析34-35
• 4 單倍體與原發(fā)性肝癌易感性的關(guān)聯(lián)分析35-37
• 討論37-39
• TLR9 遺傳變異與原發(fā)性肝癌易感性37-39
• 第三部分TLR9、TLR4 遺傳變異與環(huán)境因素之間交互作用分析39-50
• 材料與方法39
• 1 研究對象39
• 2 統(tǒng)計學(xué)方法39
• 結(jié)果39-48
• 1 兩水平的基因-環(huán)境的交互作用分析39-43
• 2 TLR9 與TLR4 基因-基因交互作用分析43-47
• 3 TLR9 與TLR4 基因-環(huán)境交互作用分析47-48
• 討論48-50
• 總結(jié)50-52
• 1 創(chuàng)新點(diǎn)50
• 2 不足之處50
• 3 結(jié)論50-51
• 3.1 原發(fā)性肝癌的相關(guān)環(huán)境因素50-51
• 3.2 TLR9 遺傳變異與原發(fā)性肝癌易感性關(guān)聯(lián)51
• 3.3 基因-基因、基因-環(huán)境交互作用對原發(fā)性肝癌易感性的影響51
• 4 展望51-52
• 參考文獻(xiàn)52-56
• 綜述56-64
• 參考文獻(xiàn)62-64
• 碩士期間發(fā)表的論文64-65
• 附錄1 原發(fā)性肝癌流行病學(xué)調(diào)查表65-79
• 附錄2 質(zhì)量控制管理表 1、279-81
• 附錄3 主要縮略詞中英文對照（按字母序排列）81-82
• 致謝82

【引證文獻(xiàn)】

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 張繚云;李海英;;家族性乙肝原發(fā)性肝癌發(fā)病相關(guān)因素臨床流行病學(xué)調(diào)查[A];中華醫(yī)學(xué)會第十六次全國病毒性肝炎及肝病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2013年

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本文編號：688454