本文關(guān)鍵詞：食管鱗癌TP53，HER-2，MRP-1突變及蛋白表達(dá)與臨床病理特征對(duì)預(yù)后的影響

  更多相關(guān)文章： TP53 HER2 MRP-1 外顯子測(cè)序 突變率 突變類型 免疫組化 生存分析

【摘要】：1研究背景與目的食管癌是世界上8大最常見的惡性腫瘤之一,癌癥死亡率為第6。我國(guó)是食管癌多發(fā)地域,食管鱗癌(Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)是其主要病理類型,占95%以上。目前,有關(guān)食管癌發(fā)生機(jī)制研究觀點(diǎn)漸趨一致,認(rèn)為癌癥是基因與環(huán)境交互作用的結(jié)局,涉及多基因參與、多因素影響、多階段的變異積累的演進(jìn)過程。隨著人類對(duì)腫瘤遺傳學(xué)的認(rèn)識(shí)不斷深入和第二代、第三代高通量測(cè)序新興技術(shù)發(fā)展,基因組學(xué)的研究進(jìn)入了蓬勃發(fā)展的階段。中國(guó)科研工作者獨(dú)立開展的有關(guān)ESCC基因GWAS研究,獲得了豐碩的成果。腫瘤的浸潤(rùn)深度,分化級(jí)別,淋巴結(jié)有無轉(zhuǎn)移[10-11],遠(yuǎn)處器官有無轉(zhuǎn)移等均可影響ESCC患者的生存;化療患者出現(xiàn)耐藥現(xiàn)象也是影響治療方案選擇及治療功效的主要影響因素。探討ESCC發(fā)生、進(jìn)展、化療耐藥的相關(guān)基因研究對(duì)于早期預(yù)防,阻止進(jìn)展,解除耐藥具有重要意義。而癌基因和抑癌基因的激活必須通過其編碼產(chǎn)物或影響其他編碼產(chǎn)物的方式才能引起正常細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)變,運(yùn)用免疫組織化學(xué)(Immunohistochemical,IHC)手段分析與這些易感位點(diǎn)或致病基因控制的蛋白產(chǎn)物對(duì)于探討基因改變對(duì)腫瘤的影響具有非常重要意義。本研究結(jié)合ESCC組織P53,HER-2,MRP-1三種基因外顯子測(cè)序結(jié)果分析突變基因的突變類型及突變率差異,結(jié)合三種蛋白IHC結(jié)果,探討ESCC患者三種基因的蛋白表達(dá)情況和臨床病理特征對(duì)預(yù)后之間的影響,進(jìn)一步分析P53,HER-2,MRP-1表達(dá)之間是否具有關(guān)聯(lián),判斷三種蛋白獨(dú)立或聯(lián)合表達(dá)對(duì)預(yù)后的價(jià)值。以期對(duì)ESCC發(fā)生發(fā)展的基因組水平的改變有進(jìn)一步的認(rèn)識(shí);獲得高效,敏感的特異性蛋白檢測(cè)指標(biāo),指導(dǎo)相關(guān)人群實(shí)施有效的預(yù)防和干預(yù)治療及基因治療。2材料與方法:2.1研究對(duì)象本研究分為外顯子測(cè)序組食管癌高發(fā)區(qū)ESCC患者116例和癌組織蛋白表達(dá)組ESCC患者728例,所有患者全部來自河南省鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院食管癌重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室50萬食管癌與賁門癌生物樣品信息資料庫(kù)(病例信息時(shí)間跨度為1973-2015年)。從資料庫(kù)選取術(shù)后病理為食管鱗癌,病理臨床信息核查補(bǔ)充完善,728例蛋白表達(dá)分析組具有詳細(xì)IHC結(jié)果,成功隨訪的患者進(jìn)行研究。116例外顯子測(cè)序組從治療醫(yī)院收集相應(yīng)患者癌組織及癌旁正常組織蠟塊,并置于-20度冰箱保存。2.2實(shí)驗(yàn)方法對(duì)外顯子測(cè)序分析組116例ESCC進(jìn)行石蠟組織DNA提取,獲得DNA后進(jìn)行電泳及DNA濃度測(cè)量及標(biāo)化,使符合外顯子測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)。進(jìn)行測(cè)序。2.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法使用SPSS 21.0對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。運(yùn)用x2檢驗(yàn)進(jìn)行組間差異比較,Spearman秩相關(guān)分析變量之間的相關(guān)性;Kaplan-Meier法繪制生存曲線,進(jìn)行生存率的估計(jì),log-rank法檢驗(yàn)生存差異;Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型篩選食管鱗癌患者預(yù)后的影響因素。檢驗(yàn)水準(zhǔn):α=0.05。3結(jié)果3.1 ESCC癌組織全基因外顯子測(cè)序結(jié)果3.1.1整體突變情況檢測(cè)116例ESCC外顯子范圍內(nèi)的突變進(jìn)行分析,共發(fā)現(xiàn)166945個(gè)突變事件,其中SNP突變?yōu)橹?占94.96%,Insertion和Deletion僅占2.29%與2.74%。3'Flank,5'Flank,RNA突變率較高,分別為15.32%,15.36%,42.81%。3.1.2 TP53基因突變結(jié)果TP53外顯子發(fā)生突變例數(shù)為80例,發(fā)生突變的頻率是68.6%。共發(fā)生100個(gè)突變事件,包括83個(gè)SNP、9個(gè)Insertion和8個(gè)Deletion。錯(cuò)義突變發(fā)生率最高為58%,無義突變發(fā)生率次之為20%,然后是移碼插入發(fā)生率為9%。TP53基因外顯子發(fā)生SNP突變率明顯低于全外顯子組的SNP突變發(fā)生率,發(fā)生Deletion和Insertion的突變率明顯高于全外顯子組的SNP突變發(fā)生率。3.1.3 HER2與MRP-1基因突變結(jié)果HER2基因發(fā)生突變頻率為1.72%(2/116),共兩個(gè)突變事件;MRP-1基因發(fā)生突變頻率為3.45%(4/116),共10個(gè)突變事件。3.2 IHC蛋白表達(dá)分子組結(jié)果3.2.1 ESCC組織中P53,HER-2,MRP-1三種蛋白表達(dá)分別與臨床病理特征之間的關(guān)系(1)P53蛋白陽(yáng)性表達(dá)比例44.1%(321/728)。P53蛋白表達(dá)在淋巴結(jié)未發(fā)生轉(zhuǎn)移組陽(yáng)性率明顯低于淋巴結(jié)發(fā)生轉(zhuǎn)移組;P53表達(dá)在病理分級(jí)III,IV及中陽(yáng)性率明顯高于I,II級(jí)組;P53蛋白在中晚期陽(yáng)性表達(dá)率是早期患者的陽(yáng)性率的2倍以上。(2)HER-2蛋白陽(yáng)性表達(dá)比例46.0%(280/728)。隨著在腫瘤分化較差,淋巴結(jié)發(fā)生轉(zhuǎn)移,遠(yuǎn)處器官轉(zhuǎn)移,病理分級(jí)加重,臨床分期加重,HER-2在ESCC組織中的陽(yáng)性表達(dá)率隨之升高。(3)MRP-1蛋白陽(yáng)性表達(dá)比例51.5%(375/728)。MRP-1蛋白隨著病理分級(jí)的加重陽(yáng)性率依次上升,I,II,III,IV期的陽(yáng)性率依次為34.4%,50.8%,52.4%,72.7%;MRP-1蛋白在早期中晚期患者的陽(yáng)性率也依次升高34.4%,51.6%,72.7%;MRP-1表達(dá)的陽(yáng)性率53.5%明顯高于未發(fā)生器官轉(zhuǎn)移組的陽(yáng)性率48.9%。(4)P53的表達(dá)與HER-2,MRP-1三者的表達(dá)均不具有相關(guān)性。3.2.2 ESCC組織中P53,HER-2,MRP-1三種蛋白表達(dá)差異對(duì)患者預(yù)后的影響(1)P53蛋白表達(dá)陽(yáng)性組生存較陰性組差c2=6.522,p=0.01,中位生存期分別為2.638,4.016,相差1.5倍;發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移組(M0)P53蛋白表達(dá)較未發(fā)生轉(zhuǎn)移組預(yù)后差,中位生存期分別為2.732,4.197。(2)HER-2蛋白陽(yáng)性組較陰性組預(yù)后差c2=8.199,p=0.004,中位生存期分別為2.732,4.170。發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組(N1)的HER-2表達(dá)陰性組較陽(yáng)性組預(yù)后好;發(fā)生遠(yuǎn)處器官轉(zhuǎn)移組(M1)與未發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移組(M0)HER-2表達(dá)陰性組均較陽(yáng)性組預(yù)后好。(3)生存分析結(jié)果顯示MRP-1與腫瘤的生存之間不存在相關(guān)性。(4)P53,HER-2的表達(dá)進(jìn)行組合組生存分析發(fā)現(xiàn),P53,HER-2雙陽(yáng)性表達(dá)組與單陽(yáng)性組、雙陰性組相比預(yù)后最差。4.結(jié)論4.1外顯子測(cè)序組結(jié)論(1)116食管鱗癌患者均發(fā)生了不同程度的基因外顯子突變,共發(fā)生166945個(gè)突變事件,其中SNP突變?yōu)橹?占94.96%。(2)TP53外顯子發(fā)生突變例數(shù)為80例,發(fā)生突變的頻率是68.6%。共發(fā)生100個(gè)突變事件,錯(cuò)義突變發(fā)生率最高為58%。(3)TP53外顯子發(fā)生SNP突變率明顯低于WES,發(fā)生Deletion和Insertion的突變率明顯高于全基因組外顯子測(cè)序。(4)本研究顯示河南省林州等地高發(fā)區(qū)食管鱗癌HER2和MRP-1發(fā)生外顯子突變率分別為1.72%和3.45%。4.2蛋白表達(dá)分析組結(jié)論(1)P53蛋白過表達(dá)是影響食管鱗癌患者生存的獨(dú)立影響因素之一,陽(yáng)性組生存較陰性組差,P53與食管鱗癌患者預(yù)后不良相關(guān),且無論是否發(fā)生遠(yuǎn)處器官的轉(zhuǎn)移。(2)HER-2蛋白表達(dá)是影響食管鱗癌患者生存的獨(dú)立影響因素之一,HER-2過表達(dá)與食管鱗癌患者預(yù)后不良相關(guān),且無論是否發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移或遠(yuǎn)處器官的轉(zhuǎn)移。(3)MRP-1與腫瘤的生存之間不存在相關(guān)性。(4)P53與HER-2兩種蛋白同時(shí)過度表達(dá)組的預(yù)后較單純表達(dá)一種蛋白組差。
【關(guān)鍵詞】：TP53 HER2 MRP-1 外顯子測(cè)序 突變率 突變類型 免疫組化 生存分析
【學(xué)位授予單位】：鄭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R735.1
【目錄】：

• 摘要4-9
• Abstract9-16
• 符號(hào)說明16-17
• 第一部分 食管鱗癌組織TP53,HER-2 和MRP-1 基因外顯子突變結(jié)果分析17-32
• 1 研究背景與目的17-19
• 2 材料與方法19-22
• 3 結(jié)果22-24
• 4 討論24-26
• 5 結(jié)論26-27
• 參考文獻(xiàn)27-29
• 附表29-32
• 第二部分 食管鱗癌組織TP53,HER-2 和MRP-1 蛋白表達(dá)與臨床病理特征對(duì)預(yù)后的影響32-63
• 1 研究背景與目的32-35
• 2 材料與方法35-37
• 3 結(jié)果37-42
• 4 討論42-47
• 5 結(jié)論47-48
• 參考文獻(xiàn)48-53
• 附表53-63
• 綜述 中國(guó)人群食管鱗癌全基因組外顯子測(cè)序研究進(jìn)展63-76
• 參考文獻(xiàn)72-76
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷76-78
• 致謝78-79

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 董淑曉;訾力;亓健;;原發(fā)性胃鱗癌的臨床病理特點(diǎn)[J];中國(guó)臨床醫(yī)生;2011年11期

2 趙鎮(zhèn)清;張熙曾;劉亦庸;;賁門鱗癌[J];中國(guó)腫瘤臨床;1987年04期

3 王懷娥,任德印,崔允峰;肺炎樣鱗癌誤診原因探討(附5例報(bào)告)[J];醫(yī)學(xué)影像學(xué)雜志;1994年03期

4 劉建良,周鑫官,張勤;賁門鱗癌的外科治療[J];江蘇醫(yī)藥;1995年08期

5 ;中咽部鱗癌前壁型的治療[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(耳鼻咽喉科學(xué)分冊(cè));1998年01期

6 ;鱗癌中人類乳頭狀瘤病毒的表達(dá)及P~(53)突變[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(耳鼻咽喉科學(xué)分冊(cè));1999年01期

7 張地君,許速,徐小珂;表皮內(nèi)鱗癌2例報(bào)告[J];皮膚病與性病;1999年01期

8 錢偉明;原發(fā)性附睪鱗癌1例[J];診斷病理學(xué)雜志;2002年04期

9 崔云龍,李強(qiáng);膽囊鱗癌6例報(bào)告[J];天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2003年04期

10 劉永祥;龜頭部鱗癌誤診一例[J];臨床誤診誤治;2004年11期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 胡偉漢;徐韜;伍國(guó)號(hào);郭朱明;高遠(yuǎn)紅;王芳;蔡修宇;;151例下咽鱗癌的治療與預(yù)后[A];2007第六屆全國(guó)放射腫瘤學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2007年

2 俞新民;;鱗癌1例[A];2009年浙江省皮膚病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2009年

3 高明陽(yáng);;頭部鱗癌伴嗜酸性粒細(xì)胞增多一例[A];2003中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合皮膚性病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2003年

4 徐致祥;譚家駒;陳風(fēng)蘭;司建華;韓建英;;農(nóng)家肥料污染水源誘發(fā)大小鼠前胃鱗癌[A];全國(guó)腫瘤流行病學(xué)和腫瘤病因?qū)W學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2007年

5 李梅嬌;王鵬;符磊;吳偉偉;;伴有多臟器功能損害的老年鱗癌(翻花瘡)患者的處理體會(huì)[A];2012全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合皮膚性病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2012年

6 曾蕾;曾珠;趙瓊;;EGFR突變的女性鱗癌臀肌轉(zhuǎn)移1例并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)[A];中國(guó)腫瘤內(nèi)科進(jìn)展 中國(guó)腫瘤醫(yī)師教育（2014）[C];2014年

7 賈軍;楊世勇;張志明;;血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子在食管鱗癌中的表達(dá)及臨床意義[A];2000全國(guó)腫瘤學(xué)術(shù)大會(huì)論文集[C];2000年

8 賈志新;;西黃丸配合化療治療下咽鱗癌1例[A];西黃丸臨床應(yīng)用研究論文集[C];2009年

9 姜玉章;熊化生;郭偉;胡傳賢;金云;錢強(qiáng);潘漢胤;;具家族史食管鱗癌及癌旁組織基因表達(dá)譜的初步研究[A];中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)功能基因組學(xué)研討會(huì)論文集[C];2006年

10 溫登瑰;王士杰;張立瑋;王小玲;魏麗珍;鄒文娣;秦鵬;;食管鱗癌家族性病例比散發(fā)病例發(fā)生年齡早、雙灶同發(fā)率高以及預(yù)后差的特點(diǎn)提示抑癌基因第一次打擊可作為遺傳易感性的分子基礎(chǔ)[A];中國(guó)第九屆全國(guó)食管癌學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2009年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 上海龍華醫(yī)院腫瘤科 王菊勇 副研究員;胃鱗癌的治療[N];上海中醫(yī)藥報(bào);2010年

2 記者 王丹 通訊員 高翠峰;食管鱗癌基因組研究告別“盲人摸象”[N];健康報(bào);2014年

3 記者 譚嘉;中國(guó)人食管鱗癌重要突變基因被揭示[N];健康報(bào);2014年

4 楊國(guó)平;食管鱗癌非手術(shù)治療取得新進(jìn)展[N];健康報(bào);2014年

5 黃春燕;50歲以上男性易發(fā)頭皮鱗癌[N];健康時(shí)報(bào);2007年

6 吳一福;HSP70異常表達(dá)與外陰鱗癌發(fā)生發(fā)展有關(guān)[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2006年

7 東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院臨床腫瘤中心主任 李蘇宜　整理 本報(bào)記者程守勤;食管鱗癌化療釋疑[N];健康報(bào);2010年

8 記者 劉傳書;我科學(xué)家發(fā)現(xiàn)食管鱗癌相關(guān)基因突變[N];科技日?qǐng)?bào);2014年

9 記者 白毅;8個(gè)重要基因突變與食管鱗癌相關(guān)[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2014年

10 記者 田雅婷;8個(gè)與食管鱗癌相關(guān)基因突變被發(fā)現(xiàn)[N];光明日?qǐng)?bào);2014年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 范虹;TRPC6通道對(duì)食管鱗癌的增殖及放療增敏作用的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2013年

2 王娜娜;RACK1在食管鱗癌預(yù)后及進(jìn)展中的作用及與上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的相關(guān)性研究[D];山東大學(xué);2015年

3 孟慧;miR-330-3p和miR-26b在食管鱗癌中的功能及其調(diào)控機(jī)制探討[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

4 周韶梅;miR-100在食管鱗癌中的調(diào)控作用及機(jī)制研究[D];北京工業(yè)大學(xué);2015年

5 曾薇;食管鱗癌中Survivin對(duì)NF-κB p65調(diào)控機(jī)制的研究[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2015年

6 楊宏麗;PRKDC、XRCC4多態(tài)性與中國(guó)安陽(yáng)地區(qū)食管鱗癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)性研究[D];山東大學(xué);2015年

7 崔瑤;STAT3對(duì)缺氧誘導(dǎo)食管鱗癌上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的調(diào)控作用[D];鄭州大學(xué);2016年

8 楊璇;miR-1207-5p對(duì)食管鱗癌發(fā)生的影響[D];鄭州大學(xué);2016年

9 江亞南;T-LAK細(xì)胞來源的蛋白激酶(TOPK)在食管鱗癌增殖中的功能研究[D];鄭州大學(xué);2016年

10 寧忠華;系統(tǒng)性炎癥和臨床病理因素對(duì)食管鱗癌的預(yù)后影響[D];蘇州大學(xué);2016年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 范玉宏;Caveolin-1在食管鱗癌浸潤(rùn)進(jìn)展中的作用研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

2 張廣釗;抗感染治療對(duì)兔舌VX-2鱗癌炎癥組織中MMP9、VEGF表達(dá)的影響[D];遵義醫(yī)學(xué)院;2016年

3 周瑩;c-met siRNA轉(zhuǎn)染對(duì)食管鱗癌細(xì)胞生物學(xué)特性的影響[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2016年

4 閆坤;擴(kuò)散峰度成像與宮頸癌病理學(xué)特征相關(guān)性的初步探索[D];蘭州大學(xué);2016年

5 蔡履娟;EGFR、Her-2及c-Fos在食管鱗癌中的表達(dá)及意義[D];福建醫(yī)科大學(xué);2015年

6 韓煌煌;JWA等基因多態(tài)性與食管鱗癌發(fā)生及預(yù)后相關(guān)性研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2015年

7 夏海峰;癌基因RMP在食管鱗癌中的表達(dá)及與腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移及EMT相關(guān)性研究[D];蘇州大學(xué);2016年

8 陳增超;TCR免疫組庫(kù)對(duì)食管鱗癌免疫治療的指導(dǎo)研究[D];山東大學(xué);2016年

9 韓利會(huì);術(shù)前全身炎癥反應(yīng)相關(guān)指標(biāo)在食管鱗癌中的臨床價(jià)值[D];山東大學(xué);2016年

10 賀璐璐;食管鱗癌KYSE150細(xì)胞與M_2型巨噬細(xì)胞對(duì)淋巴管內(nèi)皮細(xì)胞的協(xié)同影響[D];鄭州大學(xué);2016年

，

本文編號(hào)：668160