本文關(guān)鍵詞：BRCA1基因功能性遺傳突變與中國人群食管鱗癌患病風(fēng)險的相關(guān)性研究

  更多相關(guān)文章： BRCA1 rs799917 單核苷酸多態(tài)性 食管鱗癌 患病風(fēng)險

【摘要】：作為一種抑癌基因,BRCA1基因在維持基因穩(wěn)定性方面發(fā)揮著重要作用。近年來,越來越多的研究表明BRCA1基因與食管癌的發(fā)生發(fā)展以及預(yù)后相關(guān)。在食管鱗癌細(xì)胞系中,位于BRCA1基因編碼區(qū)的SNP位點rs799917 TC能夠影響miR-638介導(dǎo)的BRCA1表達(dá)。因此,我們想要在中國人群中驗證位于BRCA1基因編碼區(qū)的SNP位點rs799917 TC與食管鱗癌患病風(fēng)險之間的關(guān)系以及與BRCA1表達(dá)量之間的關(guān)系。采用病例-對照的方法,在濟南人群和淮安人群兩個獨立的研究組中(共包含1128例食管鱗癌和1150例對照)進(jìn)行基因分型,研究了BRCA1rs799917 TC與中國人群食管鱗癌患病風(fēng)險之間的關(guān)系。運用邏輯回歸模型計算出相應(yīng)的95%的置信區(qū)間和OR值。此外,我們還采用實時定量PCR的方法,在29對食管鱗癌組織和癌旁組織中,檢驗了BRCA1 rs799917TC與BRCA1表達(dá)量之間的關(guān)系。研究發(fā)現(xiàn),BRCA1 rs799917 C等位基因是風(fēng)險位點,與TT基因型的個體相比,CT基因型和CC基因型的個體患食管鱗癌的風(fēng)險增加(OR=1.48,p=0.005；OR=1.34,p=5.3×10-5);分層分析發(fā)現(xiàn),BRCAl rs799917與吸煙和飲酒存在多重相互作用(基因-吸煙：Pinteraction:5.8×10-5;基因-飲酒：Pinteraction=7.1×10-7),吸煙和飲酒都能夠增加食管鱗癌的患病風(fēng)險(P值均小于0.05)。體內(nèi)BRCA1表達(dá)量檢測的實驗表明無論在食管鱗癌組織中還是癌旁組織中,BRCA1 rs799917C等位基因能夠降低BRCA1的表達(dá)量。這也說明BRCA1 rs799917是一種基因-環(huán)境相互作用的方式影響食管鱗癌的患病風(fēng)險。
【關(guān)鍵詞】：BRCA1 rs799917 單核苷酸多態(tài)性 食管鱗癌 患病風(fēng)險
【學(xué)位授予單位】：北京化工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.1
【目錄】：

• 摘要4-6
• ABSTRACT6-14
• 符號和縮略詞說明14-15
• 第一章 緒論15-23
• 1.1 BRCA1基因概述15-17
• 1.1.1 BRCA1基因簡介15
• 1.1.2 BRCA1基因的結(jié)構(gòu)15-16
• 1.1.3 BRCA1基因的功能16-17
• 1.2 食管癌17-19
• 1.2.1 食管癌簡介18
• 1.2.2 食管癌患病的危險因素18-19
• 1.2.3 食管癌的治療19
• 1.3 單核苷酸多態(tài)性19-21
• 1.3.1 單核苷酸多態(tài)性介紹20
• 1.3.2 單核苷酸多態(tài)性的檢測方法20-21
• 1.4 BRCA1基因與食管癌21
• 1.5 miRNA21
• 1.6 立項背景與研究意義21-22
• 1.7 本論文的主要研究內(nèi)容22-23
• 第二章 BRCA1基因多態(tài)性與中國人群食管鱗癌患病風(fēng)險的相關(guān)性研究23-49
• 2.1 實驗材料23-26
• 2.1.1 實驗試劑23-24
• 2.1.2 實驗設(shè)備24-25
• 2.1.3 實驗耗材25-26
• 2.1.4 實驗研究對象26
• 2.2 實驗方法26-36
• 2.2.1 血液中全基因組DNA提取26-29
• 2.2.1.1 相關(guān)溶液的配制27-28
• 2.2.1.2 用酚氯仿法提取血液中全基因組DNA具體步驟28-29
• 2.2.2 基因分型29-35
• 2.2.2.1 PCR-RFLP基因分型原理29-30
• 2.2.2.2 PCR反應(yīng)體系參數(shù)以及反應(yīng)條件優(yōu)化30-32
• 2.2.2.3 限制性內(nèi)切酶酶切32-33
• 2.2.2.4 瓊脂糖凝膠電泳33-35
• 2.2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析35-36
• 2.3 實驗結(jié)果與討論36-45
• 2.3.1 引物設(shè)計結(jié)果與討論36-37
• 2.3.2 PCR反應(yīng)條件優(yōu)化結(jié)果與討論37-39
• 2.3.3 酶切條件的優(yōu)化結(jié)果與討論39-40
• 2.3.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析結(jié)果與討論40-45
• 2.3.4.1 食管鱗癌病例組和正常對照組選擇性特征資料分布情況的結(jié)果與討論40-41
• 2.3.4.2 Hardy-Weinberg平衡檢測結(jié)果與討論41-42
• 2.3.4.3 BRCA1 rs799917與食管鱗癌患病風(fēng)險關(guān)系的研究結(jié)果與討論42-44
• 2.3.4.4 分層分析BRCA1 rs799917基因分型與食管鱗癌患病風(fēng)險的關(guān)系的結(jié)果與討論44-45
• 2.4 注意事項45-47
• 2.4.1 血液中全基因組DNA提取過程中的注意事項45
• 2.4.2 引物設(shè)計過程中的注意事項45
• 2.4.3 PCR過程中的注意事項45-47
• 2.4.4 瓊脂糖凝膠電泳過程中的注意事項47
• 2.5 本章小結(jié)47-49
• 第三章 rs799917 T/C與BRCA1表達(dá)量之間關(guān)聯(lián)研究49-61
• 3.1 實驗材料49-52
• 3.1.1 實驗試劑49-50
• 3.1.2 實驗設(shè)備50-51
• 3.1.3 實驗耗材51-52
• 3.1.4 相關(guān)溶液的配制52
• 3.1.5 實驗研究對象52
• 3.2 實驗方法52-57
• 3.2.1 組織中RNA的提取52-53
• 3.2.2 反轉(zhuǎn)錄53-54
• 3.2.3 實時定量PCR檢測BRCA1表達(dá)量54-56
• 3.2.4 組織中全基因組DNA的提取56-57
• 3.2.5 組織樣本的基因分型57
• 3.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析57
• 3.3 實驗結(jié)果與討論57-58
• 3.4 注意事項58
• 3.5 本章小結(jié)58-61
• 第四章 結(jié)論、創(chuàng)新點與展望61-63
• 4.1 本論文的相關(guān)結(jié)論61
• 4.2 本論文的創(chuàng)新點61
• 4.3 展望61-63
• 參考文獻(xiàn)63-69
• 致謝69-70
• 研究成果及學(xué)術(shù)論文70-71
• 作者和導(dǎo)師簡介71-72
• 附件72-73

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：660052