發(fā)布時(shí)間：2017-08-01 14:02

  本文關(guān)鍵詞：MicroRNA靶序列單核苷酸多態(tài)性與乳腺癌預(yù)后的關(guān)聯(lián)研究

  更多相關(guān)文章： 乳腺腫瘤 microRNA 種子區(qū)結(jié)合序列 單核苷酸多態(tài)性 GREM1 miRNA-633

【摘要】：目的乳腺癌是世界范圍內(nèi)女性發(fā)病率最高的惡性腫瘤,也是導(dǎo)致女性癌癥相關(guān)死亡的最主要原因。研究證明乳腺癌預(yù)后受環(huán)境、行為方式及遺傳差異等多因素影響。越來(lái)越的研究表明micro RNA靶序列單核苷酸多態(tài)性(SNP)在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的重要作用。micro RNA靶序列SNP能夠調(diào)節(jié)micro RNA下游靶基因的表達(dá),若下游靶基因存在調(diào)控細(xì)胞遷徙和侵襲等能力,則micro RNA靶序列單核苷酸多態(tài)性有可能影響癌癥患者結(jié)局。本研究通過(guò)篩選全基因組micro RNA靶序列SNP并分析不同基因型患者預(yù)后的差異,探索micro RNA靶序列SNP與乳腺癌患者預(yù)后的關(guān)系,以期能為準(zhǔn)確評(píng)估乳腺癌患者預(yù)后提供有利線索。方法1.全基因組micro RNA種子區(qū)結(jié)合序列SNP的篩選本次研究采用全基因組關(guān)聯(lián)研究策略,從公認(rèn)的micro RNA變異數(shù)據(jù)庫(kù)“Patrocles”篩選出全基因組192個(gè)位于micro RNA種子區(qū)的高頻SNP位點(diǎn),遍布22條常染色體。2.病例來(lái)源納入的乳腺癌患者為自2006年1月1日起在天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院確診的乳腺癌新發(fā)病例,共有2647名乳腺癌患者最終納入了本次研究。研究分為篩選階段和驗(yàn)證階段,篩選階段納入1297例乳腺癌病例,驗(yàn)證階段納入1350例病例。3.實(shí)驗(yàn)方法篩選階段采用Illumina goldengate SNP分型技術(shù)對(duì)全基因組192個(gè)位點(diǎn)的基因型進(jìn)行檢測(cè)。驗(yàn)證階段采用Taqman SNP分型技術(shù)對(duì)篩選階段篩選出的位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)。4.隨訪我們對(duì)納入研究的2647名乳腺癌患者采用電話、郵件以及信件等方式進(jìn)行隨訪以了解病人現(xiàn)階段生存情況,隨訪每年進(jìn)行一次,隨訪時(shí)間截止到2015年10月。計(jì)算患者的乳腺癌特異性生存、總生存和無(wú)病生存時(shí)間。5.統(tǒng)計(jì)分析利用Kaplan-Meier和多因素Cox回歸模型分析SNP各基因型間乳腺癌患者的生存差異。利用多因素logistic回歸模型分析各基因型與乳腺癌患者臨床特征間的關(guān)聯(lián)。采用雙側(cè)檢驗(yàn),P0.05為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果1.篩選階段發(fā)現(xiàn)乳腺癌患者預(yù)后在8個(gè)SNP位點(diǎn)不同基因型間存在差異(P0.05);驗(yàn)證階段最終確認(rèn)GREM1基因上rs10318位點(diǎn)與乳腺癌預(yù)后相關(guān)(P0.05)。2.相比于rs10318位點(diǎn)呈現(xiàn)CC,攜帶TT基因型患者有較差的乳腺癌特性生存(HR=1.911;95%CI:1.204-3.031,P=0.006)和較差的總生存(HR=1.862;95%CI:1.208-2.871,P=0.005)。rs10318s位點(diǎn)位于GREM1基因上,GREM1極有可能通過(guò)CTATTAA序列接受mi RNA-633的調(diào)控。3.流行病學(xué)資料分層分析發(fā)現(xiàn),母乳喂養(yǎng)、已絕經(jīng)、無(wú)腫瘤家族史、不吸煙、無(wú)乳腺良性疾病史、活產(chǎn)次數(shù)1次、懷孕次數(shù)2次和A、O型血患者中rs10318位點(diǎn)為T(mén)T基因型相較于CC基因型生存較差;按臨床資料分層分析發(fā)現(xiàn),腫瘤最大徑≤2.5cm、淋巴結(jié)活檢陰性和浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌患者中rs10318位點(diǎn)為T(mén)T基因型相較于CC基因型生存較差。4.在rs10318位點(diǎn)與臨床特征的關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),rs10318位點(diǎn)基因型與ER狀態(tài)(陰性=1,陽(yáng)性=2)相關(guān),相比CC基因型,攜帶有TT基因型的患者ER易呈陰性(OR=0.634;95%CI:0.472-0.852,P=0.007)。結(jié)論1.我們發(fā)現(xiàn)GREM1基因上rs10318位點(diǎn)與乳腺癌的預(yù)后相關(guān),與CC基因型相比,攜帶有TT基因型的患者預(yù)后較差,自此我們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的SNP位點(diǎn)與乳腺癌的預(yù)后相關(guān)。2.rs10318位點(diǎn)與ER狀態(tài)相關(guān),攜帶有TT基因型(相較于CC基因型)的患者ER易呈陰性。
【關(guān)鍵詞】：乳腺腫瘤 microRNA 種子區(qū)結(jié)合序列 單核苷酸多態(tài)性 GREM1 miRNA-633
【學(xué)位授予單位】：天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R737.9
【目錄】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-9
• 縮略語(yǔ)/符號(hào)說(shuō)明9-10
• 前言10-13
• 研究現(xiàn)狀、成果10-12
• 研究目的、方法12-13
• 1 對(duì)象和方法13-19
• 1.1 micro-RNA種子區(qū)結(jié)合序列SNP的全基因組篩選13
• 1.2 研究對(duì)象13-14
• 1.3 實(shí)驗(yàn)方法14-17
• 1.4 隨訪情況17-18
• 1.5 統(tǒng)計(jì)分析18-19
• 2 結(jié)果19-44
• 2.1 患者特征與乳腺癌患者預(yù)后的影響19
• 2.2 micro-RNA靶序列SNPs與乳腺癌預(yù)后的關(guān)聯(lián)性分析19-20
• 2.3 rs10318與乳腺癌臨床特征的關(guān)聯(lián)20
• 2.4 患者相關(guān)特征分層分析20-44
• 討論44-48
• 結(jié)論48-49
• 參考文獻(xiàn)49-54
• 發(fā)表論文和參加科研情況說(shuō)54-55
• 附錄55-63
• 綜述 乳腺癌預(yù)后生物標(biāo)志物研究進(jìn)展63-73
• 綜述參考文獻(xiàn)69-73
• 致謝73-74
• 個(gè)人簡(jiǎn)歷74

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 周學(xué);杜宜蘭;金萍;馬飛;;癌癥相關(guān)microRNA與靶基因的生物信息學(xué)分析[J];遺傳;2015年09期

2 Kejin Zhang;Jesse Civan;Sushmita Mukherjee;Fenil Patel;Hushan Yang;;Genetic variations in colorectal cancer risk and clinical outcome[J];World Journal of Gastroenterology;2014年15期

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本文編號(hào)：604571