稀有細胞的單細胞基因突變檢測
本文關鍵詞:稀有細胞的單細胞基因突變檢測,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:血液內存在一些數(shù)量稀少卻具有重要臨床價值的稀有細胞,如循環(huán)腫瘤細胞、循環(huán)內皮細胞、良性的循環(huán)上皮細胞、以及孕婦外周血中胎兒有核紅細胞等,其中循環(huán)腫瘤細胞(Circulating Tumor Cells,CTCs)因為可能提示了體內腫瘤的存在與復發(fā)風險,以及成為體內除原位病灶以外的腫瘤細胞的來源而成為了癌癥研究的熱點。目前絕大部分研究主要針對外周血中全體CTC進行計數(shù)以及基因突變分析,而忽略了CTC的異質性,尤其是CTC在遺傳學上的異質性與功能上異質性的相互關系,因此必須發(fā)展針對單個CTC的基因檢測技術。本文主要基于顯微操作平臺,用毛細玻璃管獲取單個細胞,然后進行全基因組放大,從而擴增目的基因并檢測突變。同時,我們根據(jù)單細胞尺度上功能蛋白與基因協(xié)同檢測的需要,將單個細胞在芯片上裂解后先進行功能蛋白檢測,然后抽取單個細胞的裂解產(chǎn)物進行基因檢測。最后,我們將基于微流控芯片的外周血中CTC的捕獲技術與單細胞基因突變檢測相結合,對肺癌患者進行實際的臨床樣本檢測。我們所發(fā)展的集成式微流控芯片系統(tǒng)能夠高效分選出患者血液中的CTC,并通過紅細胞與白細胞的負選芯片除去由于非特異性捕獲而混在CTC中的血細胞,從而得到高純度的CTC用于后續(xù)檢測。
【關鍵詞】:循環(huán)腫瘤細胞 微流控芯片 單細胞基因檢測 EGFR
【學位授予單位】:上海交通大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R730.4
【目錄】:
- 摘要5-6
- ABSTRACT6-11
- 第一章:緒論11-30
- 1.1 背景11-14
- 1.2 早期診斷14-16
- 1.3 腫瘤的轉移和診斷16-18
- 1.3.1 腫瘤轉移16-17
- 1.3.2 腫瘤診斷17-18
- 1.4 循環(huán)腫瘤細胞檢測18-24
- 1.4.1 循環(huán)腫瘤細胞18-19
- 1.4.2 循環(huán)腫瘤細胞研究平臺—Cell Search19-20
- 1.4.3 CTC捕獲的快速發(fā)展20-24
- 1.4.3.1 基于單抗體的捕獲20-21
- 1.4.3.2 上皮間質轉化21-23
- 1.4.3.3 負性選擇23-24
- 1.5 肺癌中的常見基因檢測24-30
- 1.5.1 非小細胞肺癌(NSCLC)24
- 1.5.2 常見的基因突變檢測24-29
- 1.5.2.1 KRAS25-27
- 1.5.2.2 EGFR27-29
- 1.5.3 主要研究基因29-30
- 第二章:單個腫瘤細胞的基因突變檢測30-47
- 2.1 研究目的30
- 2.2 材料與方法30-47
- 2.2.1 實驗材料30-35
- 2.2.1.1 細胞系30-31
- 2.2.1.2 實驗試劑31-33
- 2.2.1.3 實驗設備33-34
- 2.2.1.4 基因突變引物34-35
- 2.2.2 實驗方法35-47
- 2.2.2.1 顯微操作獲取單細胞35-37
- 2.2.2.2 單細胞檢測37-47
- 2.2.2.2.1 少量細胞(10個)基因組DNA放大37-44
- 2.2.2.2.2 檢測方法的靈敏度44-46
- 2.2.2.2.3 懸浮狀態(tài)的單細胞基因檢測46
- 2.2.2.2.4 微操獲取經(jīng)固定的單個細胞46-47
- 第三章:單個腫瘤細胞核的基因突變檢測47-66
- 3.1 細胞裂解產(chǎn)物的基因檢測47-51
- 3.1.1 A549的實驗結果47-48
- 3.1.2 NCI-H1650的實驗結果48-49
- 3.1.3 NCI-H1975的實驗結果49-51
- 3.2 芯片內單個細胞核的基因檢測51-60
- 3.2.1 微流控芯片設計52-53
- 3.2.2 顯微操作取微芯片中裂解后的細胞核53-56
- 3.2.2.1 無修飾操作53
- 3.2.2.2 BSA修飾微芯片后的顯微操作53-54
- 3.2.2.3 雙重修飾后操作54-55
- 3.2.2.4 優(yōu)化55-56
- 3.2.3 芯片內單個細胞核的基因檢測56-60
- 3.3 臨床患者單個循環(huán)腫瘤細胞的基因檢測60-66
- 第四章:腫瘤細胞的分選66-76
- 4.1 魚骨型芯片中負載DNA的驗證67
- 4.2 同質性CTC捕獲理論67-68
- 4.3 CTC捕獲的模擬68-70
- 4.4 臨床樣本檢測70-71
- 4.5 CTC的釋放71-73
- 4.6 CTC的純化73-74
- 4.7 分離具有特定表型的CTC子群74-76
- 第五章:結論76-78
- 5.1 研究結論76-77
- 5.2 研究展望77-78
- 參考文獻78-84
- 致謝84-86
- 攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術成果86
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