癌癥是一種由細(xì)胞增殖異常引起的復(fù)雜疾病,具有細(xì)胞分化異常、持續(xù)存在的生長增殖信號(hào)、抵御細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)移和浸潤的激活等生物學(xué)特征。由于癌癥的復(fù)雜性、樣本間甚至樣本內(nèi)異質(zhì)性,其發(fā)生、發(fā)展機(jī)制目前仍不清晰。在癌癥的發(fā)生、發(fā)展過程中往往伴隨著驅(qū)動(dòng)基因突變以及甲基化水平的變化等一些基因組不穩(wěn)定性和表觀遺傳的改變導(dǎo)致正常細(xì)胞功能發(fā)生變化。因此,揭示癌癥中基因組和表觀遺傳修飾對(duì)轉(zhuǎn)錄的調(diào)控,對(duì)于我們理解癌癥的發(fā)生、發(fā)展的至關(guān)重要,為癌癥的精準(zhǔn)醫(yī)療提供理論依據(jù)。本研究旨在構(gòu)建泛癌癥中驅(qū)動(dòng)基因突變、DNA甲基化以及其與基因表達(dá)之間的調(diào)控關(guān)系,揭示驅(qū)動(dòng)基因突變和其相關(guān)的表觀調(diào)控紊亂在癌癥進(jìn)程的潛在作用機(jī)制�；赥CGA數(shù)據(jù)庫中常見的8種癌癥類型的DNA甲基化芯片、全外顯子測序以及轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),通過對(duì)DNA甲基化數(shù)據(jù)進(jìn)行層次聚類,對(duì)癌癥進(jìn)行亞分型并將亞分型結(jié)果與樣本的臨床表型以及分子特征進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。篩選出了與全局DNA甲基化水平相關(guān)的驅(qū)動(dòng)基因突變,重點(diǎn)鑒定了TP53突變相關(guān)的差異DNA甲基化位點(diǎn)與差異表達(dá)基因,構(gòu)建了TP53突變相關(guān)的DNA甲基化水平改變-基因差異表達(dá)的調(diào)控關(guān)系,具體研究結(jié)果如下:1、本研究...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1本文研究思路流程圖

第一章緒論9圖1-1本文研究思路流程圖Fig.1-1Flowchartofthisresearch.

圖2-1泛癌癥樣本DNA甲基化水平降維可視化

華南理工大學(xué)碩士學(xué)位論文14水平上都存在一定的差異，而且不同種類癌癥間差異要顯著大于同種癌癥不同樣本間的差異。乳腺癌、頭頸癌、肝癌、肺腺癌四種癌癥有部分樣本在降維后的平面上距離較近，可能是因?yàn)槿橄侔┖头蜗侔颖�，包括肝癌、頭頸癌的部分樣本都是屬于腺癌，這些樣本的腫瘤細(xì)胞都來源于腺....

圖2-2每種癌癥基于DNA甲基化水平的亞分型和癌癥亞型間的生存分析

第二章泛癌癥中DNA甲基化與基因突變整合分析

圖2-3乳腺癌中突變頻率前10的驅(qū)動(dòng)基因在樣本間突變情況

第二章泛癌癥中DNA甲基化與基因突變整合分析17不同亞型中存在顯著差異，而這種差異可能與腫瘤樣本間DNA甲基化水平異質(zhì)性相關(guān)。以下我們將詳細(xì)介紹各種癌癥中的結(jié)果：乳腺癌中共篩選出了356個(gè)驅(qū)動(dòng)基因，圖2-3展示了突變頻率前10的基因在樣本中的突變情況。乳腺癌中突變頻率最高的基因是....

本文編號(hào)：3962796