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人類乙醇脫氫酶1A的生物信息學(xué)分析及在肺癌中的功能分析

發(fā)布時間:2024-02-21 09:07
  研究背景:目前全球癌癥發(fā)病率和死亡率正在迅速增長,造成全球嚴(yán)重的健康負(fù)擔(dān)。其中,肺癌是最常見的癌癥和癌癥相關(guān)死亡的主要原因。已有研究報道乙醇脫氫酶A(ADH)基因家族中的ADH1基因在包括肺癌在內(nèi)的多種實(shí)體瘤中均發(fā)揮著重要作用。ADH1基因包括三個基因型ADH1A、ADH1B以及ADH1C,目前關(guān)于ADH1A在腫瘤中的研究甚少,所以本研究選取了 ADH1A作為ADH1的代表基因,探討其在各種實(shí)體瘤,特別是肺癌中的作用,以進(jìn)一步地了解腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程,并為進(jìn)一步研究提供理論基礎(chǔ)。方法與材料:通過GTEx數(shù)據(jù)庫、TCGA數(shù)據(jù)庫在RNA水平上初步探索ADH1A在人類正常組織和多種實(shí)體瘤中的表達(dá),隨后收集38例腫瘤患者的腫瘤和正常組織,收集5只雄性BALB/c小鼠組織,進(jìn)行免疫組化分析以探索ADH1A在蛋白質(zhì)水平上的差異分布。利用基因差異共表達(dá)分析、主成分分析、功能富集分析、免疫浸潤分析以及生存分析等方法探索ADH1A在腫瘤組織發(fā)揮的功能,并采用多個miRNA數(shù)據(jù)庫及轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫預(yù)測并構(gòu)建出ADH1A在肺腺癌中的上游調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及其下游互助蛋白網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果:在RNA水平上,ADH1A主要在肝臟中...

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1?GTEx數(shù)據(jù)庫中的ADH1A基因表達(dá)??Figure?1-1?ADHIAgene?expression?from?GTEx.??10??

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?第一章探討ADH1A在人組織和BALB/c小鼠組織中的表達(dá)???log1?0(TPM-?-1?)??cr>?o?—?■?—^?ro?c〇??'〇?cn?o?cn?<=??cn?<=>??I?|?|?|?|?|?i?i??^????爲(wèi)參:-??,、>多::2S*??-??雜:_?....


圖1?-2通過免疫組織化學(xué)分析ADH1A蛋白在BALB/c小鼠組織中的分布??-

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圖2-1?(2)中聚集的實(shí)體腫瘤數(shù)據(jù)集中(n?=?20),?12,164個與ADH1A共表達(dá)的基因??

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圖2-4在肺腺癌中,趨化因子系統(tǒng)與ADH1A表達(dá)量之間相關(guān)性的熱圖

圖2-4在肺腺癌中,趨化因子系統(tǒng)與ADH1A表達(dá)量之間相關(guān)性的熱圖

?第二章ADH1A在多種實(shí)體瘤中的共表達(dá)基因的差異分析???^?O?O???T??M.?_??Hi?。螅?^?§8?88fs?r??§i§?bi111^1111a?s?§?iii?i?f?f?i??—H:-?Expression?of?ADH1A??1?■?M?1????Met....



本文編號:3905263

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