基于蛋白質(zhì)芯片篩選腫瘤相關(guān)抗原自身抗體及肺癌診斷模型構(gòu)建
發(fā)布時間:2023-10-27 18:21
肺癌(Lungcancer,LC)是世界上最常見的惡性腫瘤之一,由于缺乏有效的早期診斷方法,其五年生存率較低,僅為19.8%,因此尋找一種有效且低損低耗的早期檢測方法具有重大意義。近年來研究表明,腫瘤相關(guān)抗原(Tumor associated antigen,TAA)在多種腫瘤患者血清中異常表達,可以引發(fā)自身免疫反應(yīng),產(chǎn)生相應(yīng)的抗腫瘤相關(guān)抗原自體抗體(Anti-tumor associated autoantibody,TAAb)。相較于TAAs,TAAbs在血清中更穩(wěn)定且更持久,具有成為腫瘤血清標志物的優(yōu)勢。目的通過蛋白質(zhì)芯片篩選,間接酶聯(lián)免疫吸附測定(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)實驗驗證得到對肺癌具有診斷價值的候選TAAbs,運用多種數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)構(gòu)建肺癌自身抗體診斷模型,并比較各個模型對肺癌的診斷價值,從而獲得一種能對早期肺癌進行高效診斷的模型。方法1)蛋白質(zhì)芯片篩選TAAbs基于138個癌癥驅(qū)動基因定制蛋白質(zhì)芯片,對100例肺癌患者和50例正常對照(Normalconrtol,NC)血清中的自身抗體進行檢測,應(yīng)用多種數(shù)據(jù)分析方法...
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 引言
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 血清標本
2.1.2 癌癥驅(qū)動基因及編碼蛋白種類
2.1.3 實驗儀器設(shè)備
2.1.4 實驗試劑及耗材
2.1.5 常用溶液的配制
2.2 實驗方法
2.2.1 技術(shù)路線
2.2.2 蛋白質(zhì)芯片定制及篩選肺癌候選TAAbs
2.2.3 間接ELISA實驗確證及驗證TAAbs
2.2.4 建模并篩選最佳組合模型
3 結(jié)果
3.1 研究對象基本特征
3.1.1 蛋白質(zhì)芯片研究對象基本信息
3.1.2 間接ELISA實驗研究對象基本信息
3.2 蛋白質(zhì)芯片篩選結(jié)果
3.2.1 芯片實驗結(jié)果
3.2.2 芯片實驗篩選候選TAAbs結(jié)果
3.2.3 候選TAAbs的基本信息
3.3 間接ELISA實驗確證和驗證肺癌抗TAAs自身抗體
3.3.1 小樣本量確證實驗
3.3.2 大樣本量驗證實驗
3.4 數(shù)據(jù)挖掘建立肺癌診斷模型及其應(yīng)用價值評價
3.4.1 肺癌診斷模型的建立
3.4.2 單個抗體及決策樹C5.0模型對早晚期肺癌的診斷價值
3.4.3 最佳模型對良性肺部疾病的鑒別價值
4 討論
4.1 癌癥驅(qū)動基因及蛋白質(zhì)芯片
4.2 肺癌相關(guān)抗原自身抗體功能及診斷價值
4.3 肺癌預測診斷模型及診斷價值
4.4 研究的優(yōu)點和局限性
4.5 研究工作展望
5 結(jié)論
參考文獻
附錄 138種癌癥驅(qū)動基因基本信息
綜述 生物標志物在肺癌篩查中的成就、前景和挑戰(zhàn)
參考文獻
個人簡歷、在學期間發(fā)表的學術(shù)論文與研究成果
致謝
本文編號:3857034
【文章頁數(shù)】:94 頁
【學位級別】:碩士
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摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 引言
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 血清標本
2.1.2 癌癥驅(qū)動基因及編碼蛋白種類
2.1.3 實驗儀器設(shè)備
2.1.4 實驗試劑及耗材
2.1.5 常用溶液的配制
2.2 實驗方法
2.2.1 技術(shù)路線
2.2.2 蛋白質(zhì)芯片定制及篩選肺癌候選TAAbs
2.2.3 間接ELISA實驗確證及驗證TAAbs
2.2.4 建模并篩選最佳組合模型
3 結(jié)果
3.1 研究對象基本特征
3.1.1 蛋白質(zhì)芯片研究對象基本信息
3.1.2 間接ELISA實驗研究對象基本信息
3.2 蛋白質(zhì)芯片篩選結(jié)果
3.2.1 芯片實驗結(jié)果
3.2.2 芯片實驗篩選候選TAAbs結(jié)果
3.2.3 候選TAAbs的基本信息
3.3 間接ELISA實驗確證和驗證肺癌抗TAAs自身抗體
3.3.1 小樣本量確證實驗
3.3.2 大樣本量驗證實驗
3.4 數(shù)據(jù)挖掘建立肺癌診斷模型及其應(yīng)用價值評價
3.4.1 肺癌診斷模型的建立
3.4.2 單個抗體及決策樹C5.0模型對早晚期肺癌的診斷價值
3.4.3 最佳模型對良性肺部疾病的鑒別價值
4 討論
4.1 癌癥驅(qū)動基因及蛋白質(zhì)芯片
4.2 肺癌相關(guān)抗原自身抗體功能及診斷價值
4.3 肺癌預測診斷模型及診斷價值
4.4 研究的優(yōu)點和局限性
4.5 研究工作展望
5 結(jié)論
參考文獻
附錄 138種癌癥驅(qū)動基因基本信息
綜述 生物標志物在肺癌篩查中的成就、前景和挑戰(zhàn)
參考文獻
個人簡歷、在學期間發(fā)表的學術(shù)論文與研究成果
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本文編號:3857034
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