癌癥基因組圖譜(TCGA)是一個具有里程碑意義的癌癥基因組計劃,它從分子上表征了32000多個原發(fā)癌癥樣本,分別歸屬于39種癌型及其亞型,且具有對應(yīng)病人的正常細(xì)胞樣本。本文主要從基因表達(dá)譜分析流程出發(fā),針對Broad GDAC Firehose數(shù)據(jù)庫中來自TCGA數(shù)據(jù)庫的1098套乳腺癌、631套結(jié)直腸腺癌、551套肺腺癌基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),挖掘原發(fā)腫瘤和轉(zhuǎn)移瘤的特征表達(dá)譜及其對應(yīng)的生物學(xué)功能。

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
一、研究背景及意義
二、TCGA腫瘤數(shù)據(jù)來源及分析流程
    1.Broad GDAC Firehose數(shù)據(jù)庫
    2.數(shù)據(jù)分類及病人信息擬合
    3.差異表達(dá)分析及下游富集分析流程
    4. TCGA腫瘤數(shù)據(jù)分析結(jié)果
        (1)三種癌癥樣本的表達(dá)譜及聚類全圖
        (2)差異表達(dá)分析及結(jié)果匯總
        (3)生物學(xué)功能性富集分析及匯總結(jié)果
        (4)三種癌癥中轉(zhuǎn)移瘤富集分析結(jié)果匯總
        (5)差異表達(dá)基因及不同癌癥的特征基因選擇
        (6)特征基因表達(dá)量與病人總體生存率的相關(guān)性分析
三、總結(jié)



本文編號：3827173