發(fā)布時間：2023-06-01 22:46

　　癌癥基因組圖譜(TCGA)是一個具有里程碑意義的癌癥基因組計劃,它從分子上表征了32000多個原發(fā)癌癥樣本,分別歸屬于39種癌型及其亞型,且具有對應病人的正常細胞樣本。本文主要從基因表達譜分析流程出發(fā),針對Broad GDAC Firehose數據庫中來自TCGA數據庫的1098套乳腺癌、631套結直腸腺癌、551套肺腺癌基因表達譜數據,挖掘原發(fā)腫瘤和轉移瘤的特征表達譜及其對應的生物學功能。

【文章頁數】：4 頁

【文章目錄】：
一、研究背景及意義
二、TCGA腫瘤數據來源及分析流程
    1.Broad GDAC Firehose數據庫
    2.數據分類及病人信息擬合
    3.差異表達分析及下游富集分析流程
    4. TCGA腫瘤數據分析結果
        (1)三種癌癥樣本的表達譜及聚類全圖
        (2)差異表達分析及結果匯總
        (3)生物學功能性富集分析及匯總結果
        (4)三種癌癥中轉移瘤富集分析結果匯總
        (5)差異表達基因及不同癌癥的特征基因選擇
        (6)特征基因表達量與病人總體生存率的相關性分析
三、總結



本文編號：3827173