基于高通量測(cè)序技術(shù)的膽管癌患者腸道菌群多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2022-11-12 15:14
目的:腸道菌群在消化系統(tǒng)惡性腫瘤的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮著重要的作用,然而腸道菌群在膽管癌發(fā)病機(jī)制中的作用仍不明確,本研究通過16SrDNA高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)膽管癌患者與健康人群的腸道菌群物種構(gòu)成及多樣性進(jìn)行分析,分析膽管癌患者的腸道微生態(tài)變化,尋找膽管癌與腸道菌群的潛在關(guān)聯(lián),為探討膽管癌的病因、發(fā)病機(jī)制等與腸道菌群的關(guān)系提供一定的理論基礎(chǔ)。方法:選取2018年8月到2019年8月就診于青島大學(xué)附屬青島市市立醫(yī)院消化內(nèi)科、肝膽外科的膽管癌患者,共20例,選擇同時(shí)期行健康查體的20例健康志愿者作為對(duì)照組,收集兩組人群的糞便標(biāo)本,提取DNA并進(jìn)行PCR擴(kuò)增,對(duì)其產(chǎn)物進(jìn)行純化、定量和均一化形成測(cè)序文庫,基于Illumina Hi Seq2500測(cè)序平臺(tái),采用雙末端測(cè)序的方法,構(gòu)建小片段文庫進(jìn)行測(cè)序,通過對(duì)Reads拼接、過濾,OTUs聚類,進(jìn)行物種注釋及豐度分析,揭示兩組人群腸道菌群的物種構(gòu)成,并進(jìn)行α多樣性、β多樣性及組間物種差異性分析等。結(jié)果:1.兩組樣本共得到2534941個(gè)有效序列數(shù),其中膽管癌組共獲得1272740個(gè),對(duì)照組共獲得1262201個(gè)。2.在門水平上,厚壁菌門(Firmicute...
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
膽管癌組(A)與對(duì)照組(B)OTU的數(shù)目
圖240份樣本在門水平物種分布柱狀圖
膽管癌組(A)與對(duì)照組(B)在門水平上相對(duì)豐度
本文編號(hào):3706601
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
膽管癌組(A)與對(duì)照組(B)OTU的數(shù)目
圖240份樣本在門水平物種分布柱狀圖
膽管癌組(A)與對(duì)照組(B)在門水平上相對(duì)豐度
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