目的:檢測(cè)長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）在Kaposi肉瘤組織和瘤旁正常組織中的表達(dá)。方法:利用高通量lncRNA芯片技術(shù)檢測(cè)5例Kaposi肉瘤組織及其瘤旁正常組織的lncRNA表達(dá)譜,篩選差異表達(dá)的lncRNA,并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）方法進(jìn)一步驗(yàn)證芯片結(jié)果,同時(shí)采用生物信息學(xué)分析差異lncRNA靶基因KEGG通路注釋。結(jié)果:與正常組織相比,Kaposi肉瘤組織中共篩選出717個(gè)差異表達(dá)的lncRNA,其中上調(diào)表達(dá)408個(gè),下調(diào)表達(dá)309個(gè);與正常組織相比,lnc-PXDN-3:3和lnc-PERP-10:2在Kaposi肉瘤組織中均表達(dá)上調(diào),與芯片結(jié)果一致。生物學(xué)過(guò)程注釋集中在Wnt信號(hào)通路、泛素化代謝、TGF-beta信號(hào)通路、P53信號(hào)通路。結(jié)論:lncRNA可能與Kaposi肉瘤發(fā)病有關(guān)。 

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【文章目錄】：
1 資料與方法
    1.1 一般資料
    1.2 實(shí)驗(yàn)材料
    1.3 實(shí)驗(yàn)方法
        1.3.1 組織總RNA的抽提和純化
        1.3.2 芯片雜交、掃描及數(shù)據(jù)讀取分析
        1.3.3 qRT-PCR
    1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 樣本總RNA抽提質(zhì)檢結(jié)果
    2.2 lncRNA在Kaposi肉瘤中差異表達(dá)譜分析
    2.3 lncRNA差異表達(dá)聚類圖
    2.4 qRT-PCR驗(yàn)證
    2.5 差異表達(dá)的lncRNA的靶基因預(yù)測(cè)
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3703261