基于TCGA數(shù)據(jù)挖掘分析及驗(yàn)證BTK在肺腺癌微環(huán)境重塑中的作用及意義
發(fā)布時(shí)間:2022-08-11 21:28
目的:肺癌是導(dǎo)致人類腫瘤相關(guān)致死的主要腫瘤類型,同時(shí)也是腦轉(zhuǎn)移腫瘤的主要來(lái)源,尤其是非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC),幾乎占據(jù)了一半的腦轉(zhuǎn)移病例。雖然對(duì)肺癌的治療已經(jīng)取得了相當(dāng)大的進(jìn)步,但是患者的生存預(yù)后仍不樂(lè)觀,尤其是肺癌的復(fù)發(fā)與轉(zhuǎn)移嚴(yán)重地影響著病人的生活質(zhì)量和生存時(shí)間。盡管免疫檢查點(diǎn)抑制劑的應(yīng)用極大地推動(dòng)了腫瘤免疫治療的發(fā)展與推廣,然而較為明顯的免疫相關(guān)副作用以及應(yīng)用局限性在一定程度上阻礙了其進(jìn)一步的發(fā)展與應(yīng)用。因此,有必要更進(jìn)一步地探索腫瘤微環(huán)境(tumor microenvironment,TME)與腫瘤細(xì)胞之間的相互關(guān)系及影響機(jī)制,挖掘微環(huán)境重塑的相關(guān)因子。尤其是腫瘤免疫微環(huán)境(tumor immune microenvironment,TIME)與腫瘤細(xì)胞間的相互作用與影響獲得普遍的關(guān)注,例如研究發(fā)現(xiàn)腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞(tumor-infiltrating lymphocyte,TIL)與NSCLC患者的5年生存率顯著相關(guān),腫瘤中低豐度的浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞是早期NSCLC不良預(yù)后的指標(biāo)。正是這種臨床上的相關(guān)性研究促進(jìn)了免疫治療的發(fā)展,...
【文章頁(yè)數(shù)】:96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語(yǔ)
第一部分:通過(guò)生物信息學(xué)分析挖掘腫瘤微環(huán)境重塑指示因子:基于TCGA數(shù)據(jù)挖掘分析
1 前言
2 材料和方法
2.1 主要數(shù)據(jù)來(lái)源和軟件算法
2.2 研究對(duì)象和分組
2.3 分析方法
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性分析
3 結(jié)果
3.1 研究對(duì)象基本情況
3.2 分析流程
3.3 差異基因(DEGs)的產(chǎn)生
3.4 DEGs 的熱圖聚類分析
3.5 TME免疫組分和基質(zhì)組分含量比例的生存分析
3.6 免疫和基質(zhì)成分與LUAD患者臨床病理分期的相關(guān)性分析
3.7 免疫與基質(zhì)共有DEGs的 GO和 KEGG富集分析
3.8 利用379個(gè)DEGs構(gòu)建蛋白質(zhì)互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)
3.9 DEGs單因素COX回歸分析
3.10 DEGs蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)與生存相關(guān)因子的交集分析
3.11 BTK在 LUAD腫瘤樣本中表達(dá)下調(diào),且與患者的生存相關(guān)
3.12 BTK是 TME重塑的潛在標(biāo)志物
3.13 TICs差異分析
3.14 TICs相關(guān)性分析
3.15 BTK與 TICs相關(guān)性分析
3.16 BTK與 TICs差異相關(guān)性的交集分析
3.17 BTK與 LUAD患者臨床病理分期相關(guān)性分析
3.18 BTK在肺癌腦轉(zhuǎn)移不同階段的表達(dá)分析
4 討論
5 結(jié)論
第二部分:BTK在腦轉(zhuǎn)移肺癌細(xì)胞及共培養(yǎng)巨噬細(xì)胞中的表達(dá)分析
1 前言
2 材料和方法
2.1 主要試劑和儀器
2.2 研究對(duì)象和分組
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性分析
3 結(jié)果
3.1 肺癌腦轉(zhuǎn)移模型建立
3.2 腫瘤腦轉(zhuǎn)移模型小鼠的體重和生存及偏癱率分析
3.3 慢病毒轉(zhuǎn)染腦轉(zhuǎn)移高致瘤性肺癌細(xì)胞BrM后的小鼠腦內(nèi)成瘤
3.4 小鼠腦轉(zhuǎn)移高致瘤性肺癌細(xì)胞的純度鑒定
3.5 腦轉(zhuǎn)移肺癌細(xì)胞增殖及Wound-healing能力分析
3.6 BTK在腦轉(zhuǎn)移瘤細(xì)胞中的表達(dá)
3.7 BTK在與腫瘤細(xì)胞共培養(yǎng)的巨噬細(xì)胞中的表達(dá)
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3675423
【文章頁(yè)數(shù)】:96 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語(yǔ)
第一部分:通過(guò)生物信息學(xué)分析挖掘腫瘤微環(huán)境重塑指示因子:基于TCGA數(shù)據(jù)挖掘分析
1 前言
2 材料和方法
2.1 主要數(shù)據(jù)來(lái)源和軟件算法
2.2 研究對(duì)象和分組
2.3 分析方法
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性分析
3 結(jié)果
3.1 研究對(duì)象基本情況
3.2 分析流程
3.3 差異基因(DEGs)的產(chǎn)生
3.4 DEGs 的熱圖聚類分析
3.5 TME免疫組分和基質(zhì)組分含量比例的生存分析
3.6 免疫和基質(zhì)成分與LUAD患者臨床病理分期的相關(guān)性分析
3.7 免疫與基質(zhì)共有DEGs的 GO和 KEGG富集分析
3.8 利用379個(gè)DEGs構(gòu)建蛋白質(zhì)互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)
3.9 DEGs單因素COX回歸分析
3.10 DEGs蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)與生存相關(guān)因子的交集分析
3.11 BTK在 LUAD腫瘤樣本中表達(dá)下調(diào),且與患者的生存相關(guān)
3.12 BTK是 TME重塑的潛在標(biāo)志物
3.13 TICs差異分析
3.14 TICs相關(guān)性分析
3.15 BTK與 TICs相關(guān)性分析
3.16 BTK與 TICs差異相關(guān)性的交集分析
3.17 BTK與 LUAD患者臨床病理分期相關(guān)性分析
3.18 BTK在肺癌腦轉(zhuǎn)移不同階段的表達(dá)分析
4 討論
5 結(jié)論
第二部分:BTK在腦轉(zhuǎn)移肺癌細(xì)胞及共培養(yǎng)巨噬細(xì)胞中的表達(dá)分析
1 前言
2 材料和方法
2.1 主要試劑和儀器
2.2 研究對(duì)象和分組
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性分析
3 結(jié)果
3.1 肺癌腦轉(zhuǎn)移模型建立
3.2 腫瘤腦轉(zhuǎn)移模型小鼠的體重和生存及偏癱率分析
3.3 慢病毒轉(zhuǎn)染腦轉(zhuǎn)移高致瘤性肺癌細(xì)胞BrM后的小鼠腦內(nèi)成瘤
3.4 小鼠腦轉(zhuǎn)移高致瘤性肺癌細(xì)胞的純度鑒定
3.5 腦轉(zhuǎn)移肺癌細(xì)胞增殖及Wound-healing能力分析
3.6 BTK在腦轉(zhuǎn)移瘤細(xì)胞中的表達(dá)
3.7 BTK在與腫瘤細(xì)胞共培養(yǎng)的巨噬細(xì)胞中的表達(dá)
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3675423
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/zlx/3675423.html
最近更新
教材專著