急性髓系白血病中轉(zhuǎn)錄激活因子ATF5的發(fā)現(xiàn)及臨床意義
發(fā)布時間:2022-01-23 22:15
研究目的急性髓系白血。ˋcute myeloid leukemia,AML)是一類髓系造血細(xì)胞惡性克隆增殖引起的高度異質(zhì)性疾病,病情發(fā)展迅速,自然病程僅幾個月。除了特殊類型的急性早幼粒細(xì)胞白血病外,大部分AML患者化療緩解后易復(fù)發(fā),長期生存率低,預(yù)后差,而AML的靶向藥物種類也十分有限。因此,發(fā)現(xiàn)AML發(fā)生發(fā)展中新分子、挖掘新的治療靶標(biāo)十分重要。生物信息學(xué)方法是尋找白血病致病分子的重要篩選工具,本研究運(yùn)用生物信息學(xué)對基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫GEO中急性髓系白血病數(shù)據(jù)深度挖掘,篩查AML發(fā)生發(fā)展與預(yù)后評估的候選分子,探究被發(fā)現(xiàn)候選分子ATF5在不同階段AML患者中表達(dá)狀況、與其它預(yù)后指標(biāo)間的相關(guān)性、在AML細(xì)胞中發(fā)揮的生物學(xué)效應(yīng)及其可能的機(jī)制,從而初步評估其作為AML候選靶向干預(yù)分子的價值。研究方法1.GEO數(shù)據(jù)庫中急性髓系白血病差異基因分析在GEO(Gene Expression Omnibus)數(shù)據(jù)庫中選擇同時包含急性髓系白血病組和對照組臨床樣本的基因表達(dá)數(shù)據(jù),運(yùn)用R語言在R Studio進(jìn)行基因芯片質(zhì)量的檢驗,合格后再應(yīng)用R Studio進(jìn)行差異表達(dá)基因(differentially ex...
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2?GEO數(shù)據(jù)庫不同基因芯片中ATF5在AML中高表達(dá)??(A)?GE0數(shù)據(jù)庫中ATF家族分子在AML患者中表現(xiàn)狀況,其中ATF3,ATF5,??ATF6表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(p<0.?0001),但以ATF5變化差異最明顯;??(B,?C)?ATF5在不同隊列AML患者中表達(dá)水平明顯高于正常對照組;(D,E)??
3臨床標(biāo)本驗證ATF5在成人AML骨髄細(xì)胞中髙表達(dá)??A)在正常對照者、AML初診患者、完全緩解和難治復(fù)發(fā)患者中qRT-PCR檢TF5表達(dá)水平,ATF5在初診者中出現(xiàn)明顯高表達(dá),當(dāng)疾病達(dá)CR時ATF5表達(dá),當(dāng)疾病復(fù)發(fā)時,ATF5表達(dá)再次升高;(B)?Western?blot檢測ATF5表達(dá):(C)免疫熒光檢測對照者、AML初診者及復(fù)發(fā)者中ATF5表達(dá)水平。圖
圖4?AML細(xì)胞系誘導(dǎo)分化后ATF5表達(dá)下調(diào)??(A,?B)?GEO數(shù)據(jù)庫中AML細(xì)胞系誘導(dǎo)分化基因芯片分析顯示,HL60細(xì)胞系經(jīng)??ATAR、PMA以及DMS0誘導(dǎo)分化后ATF5表達(dá)下降(HL60+CTR?:對照組,??HL60+ATRA:全反式維甲酸處理5天的HL60細(xì)胞,HL60+PMA:?PMA處理5天的??HL60細(xì)胞,HL60+DMSO:?DMS0處理5天的HL60細(xì)胞);(C-E)?U937細(xì)胞系依??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]激活轉(zhuǎn)錄因子5啟動子區(qū)甲基化水平的研究(英文)[J]. Xiao-min HUA,Juan WANG,Dong-meng QIAN,Jing-yi SONG,Hao CHEN,Xiu-li ZHU,Rui ZHOU,Yu-dan ZHAO,Xiu-zhi ZHOU,Ling LI,Li ZHANG,Xu-xia SONG,Bin WANG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2015(09)
本文編號:3605251
【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:55 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2?GEO數(shù)據(jù)庫不同基因芯片中ATF5在AML中高表達(dá)??(A)?GE0數(shù)據(jù)庫中ATF家族分子在AML患者中表現(xiàn)狀況,其中ATF3,ATF5,??ATF6表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義(p<0.?0001),但以ATF5變化差異最明顯;??(B,?C)?ATF5在不同隊列AML患者中表達(dá)水平明顯高于正常對照組;(D,E)??
3臨床標(biāo)本驗證ATF5在成人AML骨髄細(xì)胞中髙表達(dá)??A)在正常對照者、AML初診患者、完全緩解和難治復(fù)發(fā)患者中qRT-PCR檢TF5表達(dá)水平,ATF5在初診者中出現(xiàn)明顯高表達(dá),當(dāng)疾病達(dá)CR時ATF5表達(dá),當(dāng)疾病復(fù)發(fā)時,ATF5表達(dá)再次升高;(B)?Western?blot檢測ATF5表達(dá):(C)免疫熒光檢測對照者、AML初診者及復(fù)發(fā)者中ATF5表達(dá)水平。圖
圖4?AML細(xì)胞系誘導(dǎo)分化后ATF5表達(dá)下調(diào)??(A,?B)?GEO數(shù)據(jù)庫中AML細(xì)胞系誘導(dǎo)分化基因芯片分析顯示,HL60細(xì)胞系經(jīng)??ATAR、PMA以及DMS0誘導(dǎo)分化后ATF5表達(dá)下降(HL60+CTR?:對照組,??HL60+ATRA:全反式維甲酸處理5天的HL60細(xì)胞,HL60+PMA:?PMA處理5天的??HL60細(xì)胞,HL60+DMSO:?DMS0處理5天的HL60細(xì)胞);(C-E)?U937細(xì)胞系依??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]激活轉(zhuǎn)錄因子5啟動子區(qū)甲基化水平的研究(英文)[J]. Xiao-min HUA,Juan WANG,Dong-meng QIAN,Jing-yi SONG,Hao CHEN,Xiu-li ZHU,Rui ZHOU,Yu-dan ZHAO,Xiu-zhi ZHOU,Ling LI,Li ZHANG,Xu-xia SONG,Bin WANG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2015(09)
本文編號:3605251
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