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融合影像組學(xué)深度特征與手工特征預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌KRAS基因狀態(tài)的研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-15 05:31
  背景:結(jié)直腸癌是最常見的消化系統(tǒng)腫瘤之一,其發(fā)病率位居全球癌癥發(fā)病第三,死亡率列全球癌癥相關(guān)死亡原因第二。結(jié)直腸癌患者中大概有40-50%存在KRAS基因突變,KRAS基因突變患者對(duì)表皮因子受體拮抗劑靶向治療藥物無反應(yīng)。因此,治療前準(zhǔn)確評(píng)估結(jié)直腸癌患者KRAS基因狀態(tài),對(duì)協(xié)助臨床制定個(gè)體化治療方案有重要的臨床價(jià)值。目的:探討基于影像組學(xué)深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutional neural network,CNN)和手工影像組學(xué)特征的融合模型在術(shù)前預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌患者KRAS基因狀態(tài)的性能。材料與方法:本研究回顧性收集廣東省人民醫(yī)院經(jīng)手術(shù)切除病理確診為結(jié)直腸癌患者的臨床和影像資料,其中2011年4月至2015年4月納入的病例作為訓(xùn)練組(n=279例),2015年5月至2016年4月納入的病例作為驗(yàn)證組(n=119例)。所有納入的患者術(shù)前全腹部CT(computer tomography,CT)增強(qiáng)掃描,術(shù)后均進(jìn)行KRAS基因檢測(cè)。收集入組病例的CT門脈期圖像作為特征提取對(duì)象,分別提取手工影像組學(xué)標(biāo)簽以及深度學(xué)習(xí)特征。在訓(xùn)練組中,本研究采用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)、m RMR算法和多因素... 

【文章來源】:華南理工大學(xué)廣東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:53 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

融合影像組學(xué)深度特征與手工特征預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌KRAS基因狀態(tài)的研究


結(jié)直腸腫瘤手動(dòng)分割

流程圖,標(biāo)簽,影像,流程圖


華南理工大學(xué)碩士學(xué)位論文12圖2-2影像組學(xué)標(biāo)簽構(gòu)建流程圖。在手動(dòng)勾畫的腫瘤區(qū)域及算法計(jì)算的腫瘤周圍區(qū)域中提取手工特征。對(duì)于深度特征提取,我們基于最大橫截面區(qū)域的中心裁剪適合大小的感興趣區(qū)域。然后,對(duì)于這兩種類型的特征進(jìn)行特征篩選及影像組學(xué)標(biāo)簽建立。Fig2-2Flowchartoftheradiomicssignaturebuildingprocess.Thehand-craftedfeatureswereextractedmanuallyfromtheintratumoralregionandperitumoralregion,whichiscalculatedusingamorphologicoperation.Fordeeplearningfeatureextraction,wecroppedpatchesofafixedsizebasedonthecenterofthelargestcross-sectionedareaofmass.Then,forbothfeaturetypes,featureselectionisperformedforbuildingtheradiomicssignature.2.5統(tǒng)計(jì)學(xué)方法2.5.1臨床病理基線資料的分析分別采用t檢驗(yàn)或Mann-WhitneyU檢驗(yàn)和卡方檢驗(yàn)對(duì)臨床病理基本資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。對(duì)于連續(xù)變量,如年齡,在進(jìn)行變量正態(tài)檢驗(yàn)及方差齊性檢驗(yàn)之后,若變量滿足正態(tài)分布及方差齊性檢驗(yàn),則采用t檢驗(yàn);若不滿足則采用Mann-WhitneyU檢驗(yàn)進(jìn)行訓(xùn)練組與驗(yàn)證組、KRAS基因野生型及突變型患者之間的連續(xù)變量的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異分析,并計(jì)算訓(xùn)練組、驗(yàn)證組及整體樣本的平均值及標(biāo)準(zhǔn)差。對(duì)于分類變量,如性別、腫瘤位置和


本文編號(hào):3589999

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