1 研究背景與目的三陰性乳腺癌（TNBC）是一種預(yù)后較差的乳腺癌亞型,好發(fā)于年輕女性,臨床特點(diǎn)常表現(xiàn)為組織學(xué)分級(jí)高、侵襲性強(qiáng)、易復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移。越來(lái)越多的研究表明微小RNA（miRNA）和信使RNA（mRNA）在包括乳腺癌在內(nèi)的多種實(shí)體腫瘤的發(fā)生發(fā)展發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用,但他們?cè)赥NBC中的作用機(jī)制尚未明確。本研究旨在利用TCGA網(wǎng)站上的乳腺癌數(shù)據(jù),通過(guò)一系列生物信息學(xué)分析,得到與TNBC預(yù)后相關(guān)的潛在miRNA標(biāo)志物,并進(jìn)行文獻(xiàn)回顧,嘗試探討miRNA與mRNA在TNBC中的具體影響,為進(jìn)一步探索腫瘤發(fā)生發(fā)展的分子作用機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。2材料及方法從癌癥基因組圖譜（TCGA）網(wǎng)站下載TNBC患者的miRNA和mRNA的測(cè)序樣本（第3級(jí)）,經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)預(yù)處理后,利用Bioconductor軟件包比較癌組織及正常乳腺組織間存在差異表達(dá)的miRNA及mRNA。差異表達(dá)miRNA進(jìn)一步做生存分析,篩選預(yù)后相關(guān)miRNA。miRDB以及mirDIP兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)全面預(yù)測(cè)并注釋差異表達(dá) miRNA（Differential Expressed miRNAs,DEMs）的靶基因后,對(duì)預(yù)測(cè)得到的靶基因和差異表達(dá)的... 

【文章來(lái)源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】：69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－４排名前２０的高連接性關(guān)鍵基因??Ｆｉｇｕｒｅ３－３?Ｔｏｐ?２０?ｈｉｇｈｌｙ?ｃｏｎｎｅｃｔｉｖｅ?ｋｅｙ?ｇｅｎｅｓ??注：（Ａ）為ｄｅｇｒｅｅ算法的前２０名關(guān)鍵基因，（Ｂ）為ｃｌｏｓｅｎｅｓｓ算法的前２０名關(guān)鍵??２４??


本文編號(hào)：3589711