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LINC00968的生物信息學(xué)分析以及對(duì)肺腺癌調(diào)控機(jī)制的研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-05 18:17
  背景與目的:肺癌作為全球發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤,關(guān)于它的研究一直是個(gè)熱點(diǎn)。隨著醫(yī)療技術(shù)的不斷發(fā)展與創(chuàng)新,肺癌的生存率有了一定改善,但肺癌的發(fā)病機(jī)制仍不清楚,因此急需探索肺癌發(fā)生和進(jìn)展的分子機(jī)制,尋找特異性高的診斷及治療靶標(biāo)。Long non-coding RNA(lncRNA)LINC00968作為一個(gè)新的lncRNA,在肺癌中的作用機(jī)制尚不清楚。本實(shí)驗(yàn)通過對(duì)LINC00968進(jìn)行生物信息學(xué)的預(yù)測(cè)和分析,并結(jié)合芯片檢測(cè)、細(xì)胞轉(zhuǎn)染技術(shù)等初步探討LINC00968在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中的調(diào)控機(jī)制,以期為肺腺癌的治療提供的新的治療靶點(diǎn)。方法:為了探索LINC00968在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)中的表達(dá)及作用機(jī)制,我們采用qRT-PCR方法對(duì)臨床20例LUAD組織和癌旁組織以及肺癌A549細(xì)胞進(jìn)行了lncRNA表達(dá)水平的檢測(cè),發(fā)現(xiàn)LINC00968在LUAD組織和A549細(xì)胞中低表達(dá)。而且,我們?cè)贏549細(xì)胞中過表達(dá)lncRNA,用miRNA芯片檢測(cè)得到了具有顯著性差異的miRNA(differentially e... 

【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

LINC00968的生物信息學(xué)分析以及對(duì)肺腺癌調(diào)控機(jī)制的研究


LINC00968表達(dá)量的比較

肺腺癌,數(shù)據(jù)庫,侵染效率,慢病毒


圖 2.來自 TCGA 數(shù)據(jù)庫的肺腺癌中 LINC00968 表達(dá)量的總體達(dá)和低表達(dá)水平。x 軸,整體生存時(shí)間(年); y 軸,總生Figure 2. Overall survival analysis of LINC00968 in Genome Atlas database(TCGA). Red and green lines indirespectively. x-axis, overall survival time (year). y-3.2 LINC00968 侵染效率評(píng)價(jià)和相對(duì)定量分析考慮到包含綠色熒光蛋白(GFP)的慢病毒轉(zhuǎn)

轉(zhuǎn)染效率,細(xì)胞轉(zhuǎn)染,情況,轉(zhuǎn)染


圖 3. 在最佳轉(zhuǎn)染效率情況下的 A549 細(xì)胞轉(zhuǎn)染情況。 (A)通過正常光學(xué)顯微鏡觀察到的染情況,200×。 (B)通過倒置熒光顯微鏡觀察到的的細(xì)胞轉(zhuǎn)染情況,200×。Figure 3. A549 cell transfection in the case of optimal transfection efficiency.transfection visualized by normal optical microscope, 200 × ; (B) Cell tranvisualized by inverted fluorescence microscope, 200×.

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Long noncoding RNA RP4 functions as a competing endogenous RNA through miR-7-5p sponge activity in colorectal cancer[J]. Mu-Lin Liu,Qiao Zhang,Xiao Yuan,Long Jin,Li-Li Wang,Tao-Tao Fang,Wen-Bin Wang.  World Journal of Gastroenterology. 2018(09)
[2]Molecular profiles to biology and pathways:a systems biology approach[J]. Steven Van Laere,Luc Dirix,Peter Vermeulen.  Chinese Journal of Cancer. 2016(10)



本文編號(hào):3570839

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