新型AR拮抗劑的設(shè)計(jì)、結(jié)構(gòu)優(yōu)化和活性評(píng)價(jià)
發(fā)布時(shí)間:2023-03-19 19:12
前列腺癌(Prostate cancer,PCa)是歐美等發(fā)達(dá)國(guó)家男性常見(jiàn)的惡性腫瘤,發(fā)病率和死亡率都非常高。隨著國(guó)民生活水平的提高和人口老齡化的加劇,我國(guó)PCa的發(fā)病率也在逐年上升。而且,多數(shù)患者確診時(shí)就已經(jīng)處于中晚期,在經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的去雄激素治療后通常會(huì)發(fā)展為去勢(shì)抵抗性前列腺癌(Castration-resistant prostate cancer,CRPC),使得后續(xù)治療十分困難。持續(xù)的雄激素受體(Androgen receptor,AR)信號(hào)是CRPC的主要驅(qū)動(dòng)因素,而AR拮抗劑是目前CRPC臨床治療最重要的藥物種類之一。第一代非甾體AR拮抗劑如氟他胺和比卡魯胺通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性地與AR的配體結(jié)合口袋(Ligand binding pocket,LBP)結(jié)合發(fā)揮作用,第二代抑制劑如恩雜魯胺(Enzalutamide,Enz)還能通過(guò)抑制AR的入核等發(fā)揮藥效。但是隨著疾病的發(fā)展,這些藥物均出現(xiàn)不同程度的抵抗性。耐藥的一個(gè)重要原因是AR的LBP中氨基酸位點(diǎn)的突變使得AR拮抗劑轉(zhuǎn)變?yōu)锳R激動(dòng)劑。尋找和發(fā)現(xiàn)新的AR拮抗劑刻不容緩。本論文的第一部分主要圍繞AR展開,介紹AR的結(jié)構(gòu)、功能、作用機(jī)...
【文章頁(yè)數(shù)】:98 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
中文摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 緒論
1.1 AR的結(jié)構(gòu)和功能
1.1.1 NTD
1.1.2 DBD
1.1.3 LBD
1.2 AR的作用機(jī)制
1.3 AR與癌癥
1.3.1 AR與 PCa
1.3.2 AR與 BrCa
1.3.3 AR和卵巢癌
1.3.4 PCa的治療
1.4 AR拮抗劑
1.4.1 靶向LBD的拮抗劑
1.4.2 靶向其它位點(diǎn)的拮抗劑
1.5 CRPC的耐藥機(jī)制
1.5.1 AR的突變
1.5.2 AR過(guò)表達(dá)
1.5.3 ARVs
1.6 CADD與 AR拮抗劑的設(shè)計(jì)和發(fā)現(xiàn)
1.7 小結(jié)
2 靶向AR先導(dǎo)拮抗劑C18 的發(fā)現(xiàn)與活性評(píng)價(jià)
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 基于AR結(jié)構(gòu)的層級(jí)式VS
2.2.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
2.2.3 實(shí)驗(yàn)溶液配制
2.2.4 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2.5 LNCaP-ARR2PB-EGFP轉(zhuǎn)錄活性實(shí)驗(yàn)
2.2.6 靶點(diǎn)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)
2.2.7 PSA檢測(cè)
2.2.8 PCa相關(guān)細(xì)胞的增殖實(shí)驗(yàn)
2.2.9 C18 的細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 靶向AR層級(jí)式的VS
2.3.2 潛在活性分子的轉(zhuǎn)錄活性實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.3 靶點(diǎn)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.4 PSA實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.5 細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.6 細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.4 小結(jié)
3 AR拮抗劑小分子的結(jié)構(gòu)優(yōu)化與活性評(píng)價(jià)
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 AR LBD和 C18 復(fù)合物體系的分子動(dòng)力學(xué)模擬
3.2.2 VD-MM/GBSA方法結(jié)合自由能的計(jì)算和關(guān)鍵氨基酸殘基分解
3.2.3 主成分分析和小波分析
3.2.4 CT系列化合物的合成
3.2.5 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
3.2.6 實(shí)驗(yàn)溶液配制
3.2.7 提取RNA
3.2.8 Q-PCR實(shí)驗(yàn)
3.2.9 免疫熒光實(shí)驗(yàn)
3.2.10 免疫印跡試驗(yàn)
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 基于分子動(dòng)力學(xué)模擬的C18 類似物的設(shè)計(jì)
3.3.2 先導(dǎo)化合物C18 類似物的轉(zhuǎn)錄抑制活性篩選
3.3.3 C18 活性類似物的靶標(biāo)驗(yàn)證
3.3.4 AT2 對(duì)多種PCa細(xì)胞的增殖抑制活性
3.3.5 活性類似物AT2 的細(xì)胞毒性檢測(cè)
3.3.6 活性類似物AT2的PSA實(shí)驗(yàn)
3.3.7 活性類似物AT2 對(duì)下游基因轉(zhuǎn)錄的拮抗
3.3.8 AT2對(duì)AR入核的影響
3.3.9 AT2對(duì)AR表達(dá)的影響
3.4 小結(jié)
4.總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3765799
【文章頁(yè)數(shù)】:98 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
中文摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 緒論
1.1 AR的結(jié)構(gòu)和功能
1.1.1 NTD
1.1.2 DBD
1.1.3 LBD
1.2 AR的作用機(jī)制
1.3 AR與癌癥
1.3.1 AR與 PCa
1.3.2 AR與 BrCa
1.3.3 AR和卵巢癌
1.3.4 PCa的治療
1.4 AR拮抗劑
1.4.1 靶向LBD的拮抗劑
1.4.2 靶向其它位點(diǎn)的拮抗劑
1.5 CRPC的耐藥機(jī)制
1.5.1 AR的突變
1.5.2 AR過(guò)表達(dá)
1.5.3 ARVs
1.6 CADD與 AR拮抗劑的設(shè)計(jì)和發(fā)現(xiàn)
1.7 小結(jié)
2 靶向AR先導(dǎo)拮抗劑C18 的發(fā)現(xiàn)與活性評(píng)價(jià)
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 基于AR結(jié)構(gòu)的層級(jí)式VS
2.2.2 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
2.2.3 實(shí)驗(yàn)溶液配制
2.2.4 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2.5 LNCaP-ARR2PB-EGFP轉(zhuǎn)錄活性實(shí)驗(yàn)
2.2.6 靶點(diǎn)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)
2.2.7 PSA檢測(cè)
2.2.8 PCa相關(guān)細(xì)胞的增殖實(shí)驗(yàn)
2.2.9 C18 的細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 靶向AR層級(jí)式的VS
2.3.2 潛在活性分子的轉(zhuǎn)錄活性實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.3 靶點(diǎn)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.4 PSA實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.5 細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.3.6 細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
2.4 小結(jié)
3 AR拮抗劑小分子的結(jié)構(gòu)優(yōu)化與活性評(píng)價(jià)
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 AR LBD和 C18 復(fù)合物體系的分子動(dòng)力學(xué)模擬
3.2.2 VD-MM/GBSA方法結(jié)合自由能的計(jì)算和關(guān)鍵氨基酸殘基分解
3.2.3 主成分分析和小波分析
3.2.4 CT系列化合物的合成
3.2.5 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
3.2.6 實(shí)驗(yàn)溶液配制
3.2.7 提取RNA
3.2.8 Q-PCR實(shí)驗(yàn)
3.2.9 免疫熒光實(shí)驗(yàn)
3.2.10 免疫印跡試驗(yàn)
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 基于分子動(dòng)力學(xué)模擬的C18 類似物的設(shè)計(jì)
3.3.2 先導(dǎo)化合物C18 類似物的轉(zhuǎn)錄抑制活性篩選
3.3.3 C18 活性類似物的靶標(biāo)驗(yàn)證
3.3.4 AT2 對(duì)多種PCa細(xì)胞的增殖抑制活性
3.3.5 活性類似物AT2 的細(xì)胞毒性檢測(cè)
3.3.6 活性類似物AT2的PSA實(shí)驗(yàn)
3.3.7 活性類似物AT2 對(duì)下游基因轉(zhuǎn)錄的拮抗
3.3.8 AT2對(duì)AR入核的影響
3.3.9 AT2對(duì)AR表達(dá)的影響
3.4 小結(jié)
4.總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3765799
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