口服抗腫瘤藥物對小鼠腸道菌群和免疫相關(guān)基因表達的影響
發(fā)布時間:2017-04-09 07:07
本文關(guān)鍵詞:口服抗腫瘤藥物對小鼠腸道菌群和免疫相關(guān)基因表達的影響,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:腸道菌群與人類的健康息息相關(guān)。腸道菌群可以參與物質(zhì)代謝,協(xié)助宿主完成營養(yǎng)吸收,還可以合成人體必需的維生素。除此之外,腸道菌群失調(diào)還與很多疾病,比如糖尿病、胃腸道疾病、肥胖、心血管疾病甚至精神疾病相關(guān)。微生物的結(jié)構(gòu)組成會受到很多因素的影響,比如宿主基因型、年齡、飲食、抗生素等。抗腫瘤藥物存在毒副作用,這種毒副作用亦能夠影響腸道菌群結(jié)構(gòu),但其作用機制尚不明確。因此,本文以此為切入點,進行口服抗腫瘤藥物卡培他濱對小鼠腸道菌群和免疫相關(guān)基因表達的影響研究,以期揭示藥物影響腸道菌群及免疫系統(tǒng)的作用機制。以小鼠為模型,進行短、中、長(下稱Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)三個時期灌胃,灌胃劑量822mg/Kg/day。觀察實驗小鼠的表型,監(jiān)測體重,結(jié)果顯示實驗組小鼠體重下降,背毛枯槁,提示卡培他濱影響了小鼠腸道正常的消化吸收功能,從而導(dǎo)致小鼠體質(zhì)量下降。通過16s rRNA基因測序技術(shù)對實驗小鼠不同時期糞便、腸內(nèi)容物、腸黏液中菌群的多樣性及結(jié)構(gòu)組成進行分析,發(fā)現(xiàn)糞便中的優(yōu)勢菌群為擬桿菌門、厚壁菌門;腸黏液、腸內(nèi)容物中的優(yōu)勢菌群為厚壁菌門、擬桿菌門和變形菌門。糞便菌群與腸黏液菌群、腸內(nèi)容物菌群,存在明顯差異。腸黏液菌群和腸內(nèi)容物菌群相似度較高,差異不顯著。糞便菌群和腸內(nèi)容物菌群,實驗組和對照組之間有顯著差異,但發(fā)生差異的菌種并不多。與之相比,實驗組腸黏液和對照組腸黏液中菌群差異非常顯著,而腸黏液是黏膜免疫的組成部分,提示腸道菌群與免疫系統(tǒng)相關(guān)。通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)篩選Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三個時期實驗組和對照組中差異表達基因,以及這些差異表達基因相關(guān)的信號通路,隨后進一步篩選差異表達的免疫相關(guān)基因和它們參與的信號通路。研究結(jié)果顯示,Ⅰ期實驗組共有334個差異表達基因,上調(diào)201個,下調(diào)133個。Ⅱ期實驗組共有141個差異表達基因,上調(diào)68個,下調(diào)73個。Ⅲ期實驗組共有221個差異表達基因,上調(diào)165個,下調(diào)56個。三個時期篩選得到的免疫相關(guān)差異基因共25個。這些免疫差異基因參與的通路有:NOD樣受體信號通路(NOD-like receptor signaling pathway)、T細胞受體信號通路(T cell receptor signaling pathway)、TOll樣受體信號通路(Toll-like receptor signaling pathway)、抗原呈遞(Antigen processing and presentation)、趨化因子信號通路(Chemokine signaling pathway)、FcγR介導(dǎo)的吞噬通路(Fc gamma R-mediated phagocytosis)等。其中發(fā)現(xiàn)Defa-rs7基因與殺菌作用相關(guān),pIgR基因、CCL28基因分別與IgA的轉(zhuǎn)運和分泌相關(guān)。提示卡培他濱可能通過改變腸道菌群進而影響?zhàn)つっ庖呦到y(tǒng)。
【關(guān)鍵詞】:抗腫瘤藥物 腸道菌群 轉(zhuǎn)錄組測序
【學(xué)位授予單位】:山東師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R965
【目錄】:
- 中文摘要5-7
- Abstract7-9
- 第一章 綜述9-19
- 一、抗腫瘤藥簡介9-10
- 1 卡培他濱的物理性質(zhì)9
- 2 卡培他濱藥理作用機制9-10
- 3 卡培他濱的毒副作用10
- 二、腸道微生物簡介10-18
- 1 腸道微生物的研究歷史10-11
- 2 免疫系統(tǒng)與腸道微生物之間的相互影響11-16
- 3 腸道菌群和免疫系統(tǒng)互作的研究方法16-18
- 三、選題研究意義18-19
- 第二章 抗腫瘤藥物對小鼠表型、體重、免疫器官指數(shù)的影響19-22
- 1 材料和方法19-20
- 1.1 實驗材料19
- 1.2 實驗儀器19
- 1.3 實驗動物的分組和給藥19
- 1.4 藥物對小鼠一般特征和體重的影響19
- 1.5 小鼠免疫器官指數(shù)的監(jiān)測19-20
- 2 實驗結(jié)果20-21
- 3 討論21-22
- 第三章 抗腫瘤藥物對小鼠腸道菌群的影響22-44
- 1 材料和方法22-27
- 1.1 實驗材料22
- 1.2 實驗儀器22
- 1.3 實驗動物的分組和給藥22
- 1.4 樣品采集及細菌總DNA提取22-24
- 1.5 16s rRNA V3-V4高變區(qū)基因PCR擴增24-25
- 1.6 瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物25-26
- 1.7 PCR產(chǎn)物的回收、定量及混合26
- 1.8 MiSeq平臺測序26-27
- 2 生物信息學(xué)分析27-28
- 3 實驗結(jié)果28-42
- 3.1 樣品基因組DNA電泳圖28-29
- 3.2 PCR對 16s rRNA基因的擴增29
- 3.3 Miseq平臺測序結(jié)果29-31
- 3.4 細菌通用 16s rRNA基因克隆文庫的庫容分析31-32
- 3.5 多樣性分析32-34
- 3.6 分類學(xué)分析34-37
- 3.7 基于多元統(tǒng)計的各樣品菌群結(jié)構(gòu)的分析37-40
- 3.8 LDA EffectSize分析40-42
- 4 討論42-44
- 第四章 抗腫瘤藥物對小鼠免疫相關(guān)基因的影響44-58
- 1 材料和方法44-46
- 1.1 實驗材料44
- 1.2 實驗儀器44
- 1.3 實驗動物的分組和給藥44
- 1.4 樣品的采集與總RNA的提取、檢測44-45
- 1.5 基因差異表達分析45-46
- 2 實驗結(jié)果46-56
- 2.1 RNA質(zhì)量檢測結(jié)果46
- 2.2 各樣品測序數(shù)據(jù)及序列比對結(jié)果46-48
- 2.3 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)飽和度檢驗48-50
- 2.4 差異表達基因篩選50-51
- 2.5 對差異表達的基因進行GO分析51-52
- 2.6 差異表達基因KEGG注釋52-54
- 2.7 免疫相關(guān)差異表達基因及KEGG通路預(yù)測54-56
- 3 討論56-58
- 結(jié)論58-59
- 參考文獻59-64
- 致謝64
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條
1 李學(xué)敏;于卿;鄭榮;左濤;曹斌斌;唐慶娟;王靜鳳;王玉明;薛長湖;;4種常見海參對小鼠腸道黏膜免疫功能的保護作用[J];食品科學(xué);2013年15期
2 唐慶娟;戚欣;耿美玉;;多聚免疫球蛋白受體(pIgR)在粘膜免疫中的重要功能[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報;2007年09期
3 馬新成,魏長鳳,岳建華;卡培他濱[J];齊魯藥事;2005年10期
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本文編號:294706
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