本文關(guān)鍵詞：基于WebAR的分子對接游戲中打分函數(shù)的優(yōu)化與實(shí)現(xiàn)，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)和藥學(xué)的發(fā)展,計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法逐漸成為藥物研發(fā)的重要手段。其中,分子對接方法已發(fā)展為研究分子間相互作用并預(yù)測復(fù)合物結(jié)構(gòu)的主要方法之一。但是,在Web環(huán)境中,分子對接的用戶交互性和打分函數(shù)的計(jì)算速度有待提高。本文利用增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)(Augmented Reality, AR)技術(shù),設(shè)計(jì)分子對接游戲,并優(yōu)化打分函數(shù),利用消息中間件將打分函數(shù)加入分子對接游戲,從而在WebAR環(huán)境中實(shí)現(xiàn)分子對接過程。本文主要工作包括以下三個(gè)方面： (1)基于WebAR的交互式分子對接游戲。分析了基于WebAR的交互式分子對接游戲的需求,并設(shè)計(jì)了對接游戲框架結(jié)構(gòu)和對接流程,使用戶在游戲環(huán)境中能夠解決科學(xué)問題。 (2)基于配位點(diǎn)局部范圍搜尋的打分函數(shù)優(yōu)化。根據(jù)Autodock的打分函數(shù)邏輯,分析對接游戲中的變量情況,只計(jì)算位于配位點(diǎn)附近的局部范圍內(nèi)的能量,從而減少不必要的計(jì)算量。通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,該方法能夠提高打分速度。 (3)利用消息中間件實(shí)現(xiàn)前端用戶交互與后端打分計(jì)算的實(shí)時(shí)通訊。首先保存前端用戶交互信息,通過網(wǎng)絡(luò)發(fā)送到消息中間件；然后消息中間件將交互信息轉(zhuǎn)發(fā)到后臺打分計(jì)算；最后,消息中間件將得到的打分結(jié)果傳回系統(tǒng)前端,并實(shí)時(shí)展示給用戶。 上述研究與實(shí)現(xiàn)延伸了分子對接的應(yīng)用范圍,提高了用戶交互性,改進(jìn)了打分函數(shù)的計(jì)算速度,為新藥發(fā)現(xiàn)提供了新的思路和實(shí)現(xiàn)方法。
【關(guān)鍵詞】：AR技術(shù) 分子對接 打分函數(shù) 消息中間件
【學(xué)位授予單位】：華東理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R91;TP311.52
【目錄】：

• 摘要5-6
• Abstract6-9
• 第1章 緒論9-19
• 1.1 新藥研發(fā)現(xiàn)狀9-10
• 1.2 分子對接方法及發(fā)展現(xiàn)狀10-13
• 1.2.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)簡介10-11
• 1.2.2 分子對接方法介紹11-12
• 1.2.3 分子對接技術(shù)研究現(xiàn)狀12-13
• 1.3 增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)技術(shù)簡介和應(yīng)用13-17
• 1.3.1 虛擬現(xiàn)實(shí)技術(shù)簡介13-14
• 1.3.2 虛擬現(xiàn)實(shí)技術(shù)應(yīng)用14-15
• 1.3.3 增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)技術(shù)簡介15-16
• 1.3.5 增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)技術(shù)應(yīng)用16-17
• 1.4 本文研究內(nèi)容17
• 1.5 論文組織結(jié)構(gòu)17-19
• 第2章 基于WebAR的交互式分子對接游戲設(shè)計(jì)19-26
• 2.1 基于WebAR的交互式分子對接游戲的需求分析19-20
• 2.2 基于WebAR的交互式分子對接游戲的功能設(shè)計(jì)20-22
• 2.3 基于WebAR的交互式分子對接游戲界面設(shè)計(jì)22-25
• 2.4 本章小結(jié)25-26
• 第3章 基于配位點(diǎn)局部范圍搜尋的打分函數(shù)優(yōu)化26-44
• 3.1 分子對接中的打分函數(shù)簡介26-27
• 3.2 Autodock打分函數(shù)簡介27-28
• 3.3 基于配位點(diǎn)局部范圍搜尋的打分函數(shù)優(yōu)化28-30
• 3.4 基于配位點(diǎn)局部范圍搜尋的打分函數(shù)實(shí)現(xiàn)30-40
• 3.5 實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證40-43
• 3.6 本章小結(jié)43-44
• 第4章 交互式對接游戲的實(shí)時(shí)通信44-60
• 4.1 消息中間件概述44-50
• 4.1.1 中間件技術(shù)簡介44-46
• 4.1.2 消息中間件技術(shù)簡介46-48
• 4.1.3 JMS概述48-49
• 4.1.4 ActiveMQ簡介49-50
• 4.2 基于ActiveMQ的消息中間件實(shí)現(xiàn)50-57
• 4.2.1 系統(tǒng)環(huán)境配置介紹50-51
• 4.2.2 C++客戶端通信實(shí)現(xiàn)51-54
• 4.2.3 Web服務(wù)器端通信實(shí)現(xiàn)54-57
• 4.3 交互式對接游戲中打分效果57-59
• 4.4 本章小結(jié)59-60
• 第5章 總結(jié)與展望60-61
• 參考文獻(xiàn)61-65
• 致謝65

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 魯敏,郁文賢,鮑虎軍,匡綱要;基于機(jī)電跟蹤的三維虛擬演播室系統(tǒng)[J];電子學(xué)報(bào);2003年S1期

2 周洪玉,王慧英,周巖;虛擬現(xiàn)實(shí)及應(yīng)用的研究[J];哈爾濱理工大學(xué)學(xué)報(bào);2000年04期

3 冉洋;朱飛;陳康;;虛擬現(xiàn)實(shí)及增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)技術(shù)在工業(yè)設(shè)計(jì)中的應(yīng)用[J];激光雜志;2010年01期

4 全紅艷;王長波;林俊雋;;基于視覺的增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)技術(shù)研究綜述[J];機(jī)器人;2008年04期

5 陳靖,王涌天,閆達(dá)遠(yuǎn);增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)系統(tǒng)及其應(yīng)用[J];計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用;2001年15期

6 張文舉;陳曙東;劉了;馬范援;沈建華;;藥物發(fā)現(xiàn)網(wǎng)格設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)[J];計(jì)算機(jī)工程;2006年11期

7 馬志艷;陳幼平;劉仕慶;袁楚明;周祖德;;可重構(gòu)增強(qiáng)現(xiàn)實(shí)三維實(shí)體虛擬組件技術(shù)研究與實(shí)現(xiàn)[J];計(jì)算機(jī)工程與科學(xué);2006年10期

8 李祖華;張軍;王永劍;于坤千;;DDGrid:一種大規(guī)模藥物虛擬篩選網(wǎng)格[J];計(jì)算機(jī)工程與科學(xué);2009年S1期

9 秦t

本文編號：257797